ABO (gen) - ABO (gene)
Transferaza układu ABO grupy histokrwi jest enzymem o aktywności glikozylotransferazy , która jest kodowana przez gen ABO u ludzi. Jest wszechobecnie wyrażany w wielu tkankach i typach komórek. ABO określa grupę krwi ABO osobnika poprzez modyfikację oligosacharydów na glikoproteinach powierzchni komórek. Różnice w sekwencji białka między osobnikami określają rodzaj modyfikacji i grupę krwi. ABO gen zawiera również jeden z 27 SNP związane ze zwiększonym ryzykiem choroby niedokrwiennej wieńcowej .
Struktura
ABO gen znajduje się na chromosomie 9 w 9q34.2 zespołu i zawiera 7 eksonów . ABO locus koduje trzy allele . Allel A wytwarza transferazę α-1,3-N-acetylogalaktozaminy (A-transferazę), która katalizuje przeniesienie reszt GalNAc z nukleotydu donorowego UDP-GalNAc do reszt Gal antygenu akceptorowego H , przekształcając antygen H w A antygen u osobników A i AB. Allel B koduje transferazę α-1,3-galaktozylo (B-transferazę), która katalizuje przeniesienie reszt Gal z nukleotydu donorowego UDP -Gal na reszty Gal antygenu akceptorowego H, przekształcając antygen H w antygen B w Osoby B i AB. Co ciekawe, różnica między enzymami glikozylotransferazy A i B to tylko cztery aminokwasy . Allel O nie ma obu aktywności enzymatycznych z powodu przesunięcia ramki odczytu spowodowanego delecją guaniny-258 w genie, który odpowiada regionowi w pobliżu N-końca białka. Powoduje to przesunięcie ramki i translację prawie zupełnie innego białka. Ta mutacja skutkuje powstaniem białka niezdolnego do modyfikacji oligosacharydów, które kończą się fukozą połączoną z galaktozą . Zatem u O osobników nie znaleziono antygenu A ani B. Ta kombinacja cukrów nazywana jest antygenem H . Antygeny te odgrywają ważną rolę w połączeniu transfuzji krwi i przeszczepiania narządów . Znaleziono inne mniejsze allele dla tego genu.
Wspólne allele
Istnieje sześć wspólnych alleli u osobników pochodzenia europejskiego. Niemal każdego żyjącego człowieka fenotyp genu ABO jest kombinacją tylko tych sześciu alleli:
- A
- A101 (A1)
- A201 (A2)
- b
- B101 (B1)
- O
- O01 (O1)
- O02 (O1v)
- O03 (O2)
Wiele rzadkich wariantów tych alleli znaleziono w populacjach ludzkich na całym świecie.
Znaczenie kliniczne
W komórkach ludzkich allele ABO i ich kodowane glikozylotransferazy opisano w kilku stanach onkologicznych. Stosując przeciwciała monoklonalne anty-GTA/GTB wykazano, że utrata tych enzymów była skorelowana ze złośliwym nabłonkiem pęcherza moczowego i jamy ustnej. Ponadto ekspresja antygenów grup krwi ABO w normalnych tkankach ludzkich zależy od rodzaju zróżnicowania nabłonka. W większości ludzkich raków, w tym raka jamy ustnej, istotnym wydarzeniem jako częścią mechanizmu leżącego u podstaw jest zmniejszona ekspresja antygenów A i B. W kilku badaniach zaobserwowano, że względna regulacja w dół GTA i GTB występuje w rakach jamy ustnej w związku z rozwojem nowotworu. Niedawno w badaniu asocjacyjnym całego genomu (GWAS) zidentyfikowano warianty w locus ABO związane z podatnością na raka trzustki .
Marker kliniczny
Wielomiejscowe badanie oceny ryzyka genetycznego oparte na kombinacji 27 loci , w tym genu ABO, zidentyfikowało osoby o zwiększonym ryzyku zarówno incydentów, jak i nawrotów choroby wieńcowej, a także zwiększone korzyści kliniczne z leczenia statynami. Badanie opierało się na badaniu kohortowym społeczności (badanie Malmo Diet and Cancer) oraz czterech dodatkowych randomizowanych, kontrolowanych badaniach kohortowych z prewencją pierwotną (JUPITER i ASCOT) i kohortami prewencji wtórnej (CARE i PROVE IT-TIMI 22).
Bibliografia
Dalsza lektura
- Nagai M, Davè V, Kaplan BE, Yoshida A (styczeń 1978). „Glikozylotransferazy grup krwi ludzkiej. I. Oczyszczanie n-acetylogalaktozaminylotransferazy” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 253 (2): 377–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)38216-9 . PMID 618875 .
- Takeya A, Hosomi O, Shimoda N, Yazawa S (wrzesień 1992). „Biosynteza grupy krwi P antygenopodobnej GalNAc beta 1-> 3Gal beta 1-> 4GlcNAc/Glc struktury: nowa N-acetylogalaktozaminylotransferaza w ludzkim osoczu krwi”. Czasopismo Biochemii . 112 (3): 389–95. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123910 . PMID 1429528 .
- Kominato Y, McNeill PD, Yamamoto M, Russell M, Hakomori S, Yamamoto F (listopad 1992). „Geny ABO grupy histo-krwi zwierząt”. Komunikacja badań biochemicznych i biofizycznych . 189 (1): 154–64. doi : 10.1016/0006-291X(92)91538-2 . PMID 1449469 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Hakomori S (sierpień 1992). „Ludzka transferaza grupy A2 krwi histo kodowana przez allel A2, jeden z podtypów A, charakteryzuje się delecją pojedynczej zasady w sekwencji kodującej, co skutkuje dodatkową domeną na końcu karboksylowym”. Komunikacja badań biochemicznych i biofizycznych . 187 (1): 366–74. doi : 10.1016/S0006-291X(05)81502-5 . PMID 1520322 .
- Clausen H, Biały T, Takio K, Titani K, Stroud M, Holmes E, Karkov J, Thim L, Hakomori S (styczeń 1990). „Izolacja do jednorodności i częściowa charakterystyka zdefiniowanej grupy A histo-krwi alfa 1----2Gal alfa 1----3-N-acetylogalaktozaminylotransferazy z ludzkiej tkanki płucnej” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 265 (2): 1139–45. doi : 10.1016/S0021-9258(19)40169-5 . PMID 2104827 .
- Yamamoto F, Marken J, Tsuji T, Biały T, Clausen H, Hakomori S (styczeń 1990). „Klonowanie i charakterystyka DNA komplementarnego do ludzkiego UDP-GalNAc: mRNA Fuc alfa 1----2Gal alfa 1----3GalNAc (transferaza grupy A z krwi histo)” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 265 (2): 1146–51. doi : 10.1016/S0021-9258(19)40170-1 . PMID 2104828 .
- Yamamoto F, Hakomori S (listopad 1990). „Swoistość dawcy cukrowo-nukleotydowego transferaz grupy A i B histo-krwi opiera się na podstawieniach aminokwasów” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 265 (31): 19257-62. doi : 10.1016/S0021-9258(17)30652-X . PMID 2121736 .
- Whitehead JS, Bella S, Kim YS (czerwiec 1974). „N-acetylogalaktozaminylotransferaza z ludzkiego osocza grupy krwi A. II. Właściwości kinetyczne i fizykochemiczne” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 249 (11): 3448–52. doi : 10.1016/S0021-9258(19)42593-3 . PMID 4831223 .
- Whitehead JS, Bella A, Kim YS (czerwiec 1974). „N-acetylogalaktozaminylotransferaza z osocza ludzkiej grupy krwi A. I. Właściwości oczyszczania i wiązania agarozy” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 249 (11): 442–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)42592-1 . PMID 4831233 .
- Kobata A, Ginsburg V (marzec 1970). „Difosforan urydyny-N-acetylo-D-galaktozamina: alfa-3-N-acetylo-D-galaktozaminylotransferaza D-galaktozy, produkt genu określającego grupę krwi A u człowieka” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 245 (6): 1484–90. doi : 10.1016/S0021-9258(18)63261-2 . PMID 5442829 .
- Yoshida A, Yamaguchi H, Okubo Y (maj 1980). „Mechanizm genetyczny dziedziczenia cis-AB. I. Przypadek związany z nierównym krzyżowaniem chromosomów” . American Journal of Human Genetics . 32 (3): 332–8. PMC 1686052 . PMID 6770676 .
- Olsson ML, Thuresson B, Chester MA (listopad 1995). „Wstawienie nukleotydów specyficzne dla allelu Ael w locus grupy krwi AB0 i jej wykrywanie za pomocą reakcji łańcuchowej polimerazy specyficznej dla sekwencji”. Komunikacja badań biochemicznych i biofizycznych . 216 (2): 642–7. doi : 10.1006/bbrc.1995.2670 . PMID 7488159 .
- Bennett EP, Steffensen R, Clausen H, Weghuis DO, van Kessel AG (styczeń 1995). „Genomowe klonowanie locus ABO grupy ludzkiej histo-krwi”. Komunikacja badań biochemicznych i biofizycznych . 206 (1): 318–25. doi : 10.1006/bbrc.1995.1044 . hdl : 2066/22100 . PMID 7598760 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Hakomori S (luty 1995). „Genomiczna organizacja ludzkich genów grupy ABO z krwi histo”. Glikobiologia . 5 (1): 51–8. doi : 10.1093/glikob/5.1.51 . PMID 7772867 .
- Bennett EP, Steffensen R, Clausen H, Weghuis DO, Geurts van Kessel A (czerwiec 1995). „Genomowe klonowanie locus ABO grupy ludzkiej histo-krwi”. Komunikacja badań biochemicznych i biofizycznych . 211 (1): 347. doi : 10.1006/bbrc.1995.1817 . hdl : 2066/22100 . PMID 7779106 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Kominato Y, Yamamoto M, Hakomori S, Ishimoto S, Nishida S, Shima M, Fujimura Y (1993). „Molekularna analiza genetyczna układu grup krwi ABO: 2. allele cis-AB”. Vox Sanguinis . 64 (2): 120–3. doi : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb02529.x . PMID 8456556 . S2CID 23119465 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Yamamoto M, Hakomori S, Harris T (1993). „Molekularna analiza genetyczna układu grup krwi ABO: 3. allele A(X) i B(A)”. Vox Sanguinis . 64 (3): 171–4. doi : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb05157.x . hdl : 2027.42/71979 . PMID 8484250 . S2CID 43662514 .
- Ogasawara K, Yabe R, Uchikawa M, Saitou N, Bannai M, Nakata K, Takenaka M, Fujisawa K, Ishikawa Y, Juji T, Tokunaga K (październik 1996). „Molekularna analiza genetyczna wariantów fenotypów układu grup krwi ABO” . Krew . 88 (7): 2732-7. doi : 10.1182/blood.V88.7.2732.bloodjournal8872732 . PMID 8839869 .
Zobacz też
Zewnętrzne linki
- Lokalizacja ludzkiego genomu ABO i strona szczegółów genu ABO w przeglądarce genomu UCSC .
- Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : P16442 (transferaza systemu ABO grupy histo -krwi) w PDBe-KB .
Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .