ABO (gen) - ABO (gene)

ABO
Białko ABO PDB 1lz0.png
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Identyfikatory
Skróty ABO , A3GALNT, A3GALT1, GTB, NAGAT, grupa krwi ABO (transferaza A, alfa 1-3-N-acetylogalaktozaminylotransferaza; transferaza B, alfa 1-3-galaktozylotransferaza), alfa 1-3-N-acetylogalaktozaminylotransferaza i alfa 1-3 -galaktozylotransferaza
Identyfikatory zewnętrzne OMIM : 110300 MGI : 2135738 HomoloGene : 69306 Karty genowe : ABO
Numer WE 2.4.1.37 2.4.1.40, 2.4.1.37
Ortologi
Gatunek Człowiek Mysz
Entrez
Zespół
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_020469

NM_030718
NM_001290444

RefSeq (białko)

NP_065202

NP_001277373
NP_109643

Lokalizacja (UCSC) Chr 9: 133,23 – 133,28 Mb Chr 2: 26,84 – 26,86 Mb
Wyszukiwanie w PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Transferaza układu ABO grupy histokrwi jest enzymem o aktywności glikozylotransferazy , która jest kodowana przez gen ABO u ludzi. Jest wszechobecnie wyrażany w wielu tkankach i typach komórek. ABO określa grupę krwi ABO osobnika poprzez modyfikację oligosacharydów na glikoproteinach powierzchni komórek. Różnice w sekwencji białka między osobnikami określają rodzaj modyfikacji i grupę krwi. ABO gen zawiera również jeden z 27 SNP związane ze zwiększonym ryzykiem choroby niedokrwiennej wieńcowej .

Struktura

ABO gen znajduje się na chromosomie 9 w 9q34.2 zespołu i zawiera 7 eksonów . ABO locus koduje trzy allele . Allel A wytwarza transferazę α-1,3-N-acetylogalaktozaminy (A-transferazę), która katalizuje przeniesienie reszt GalNAc z nukleotydu donorowego UDP-GalNAc do reszt Gal antygenu akceptorowego H , przekształcając antygen H w A antygen u osobników A i AB. Allel B koduje transferazę α-1,3-galaktozylo (B-transferazę), która katalizuje przeniesienie reszt Gal z nukleotydu donorowego UDP -Gal na reszty Gal antygenu akceptorowego H, przekształcając antygen H w antygen B w Osoby B i AB. Co ciekawe, różnica między enzymami glikozylotransferazy A i B to tylko cztery aminokwasy . Allel O nie ma obu aktywności enzymatycznych z powodu przesunięcia ramki odczytu spowodowanego delecją guaniny-258 w genie, który odpowiada regionowi w pobliżu N-końca białka. Powoduje to przesunięcie ramki i translację prawie zupełnie innego białka. Ta mutacja skutkuje powstaniem białka niezdolnego do modyfikacji oligosacharydów, które kończą się fukozą połączoną z galaktozą . Zatem u O osobników nie znaleziono antygenu A ani B. Ta kombinacja cukrów nazywana jest antygenem H . Antygeny te odgrywają ważną rolę w połączeniu transfuzji krwi i przeszczepiania narządów . Znaleziono inne mniejsze allele dla tego genu.

Wspólne allele

Istnieje sześć wspólnych alleli u osobników pochodzenia europejskiego. Niemal każdego żyjącego człowieka fenotyp genu ABO jest kombinacją tylko tych sześciu alleli:

  • A
    • A101 (A1)
    • A201 (A2)
  • b
    • B101 (B1)
  • O
    • O01 (O1)
    • O02 (O1v)
    • O03 (O2)

Wiele rzadkich wariantów tych alleli znaleziono w populacjach ludzkich na całym świecie.

Znaczenie kliniczne

W komórkach ludzkich allele ABO i ich kodowane glikozylotransferazy opisano w kilku stanach onkologicznych. Stosując przeciwciała monoklonalne anty-GTA/GTB wykazano, że utrata tych enzymów była skorelowana ze złośliwym nabłonkiem pęcherza moczowego i jamy ustnej. Ponadto ekspresja antygenów grup krwi ABO w normalnych tkankach ludzkich zależy od rodzaju zróżnicowania nabłonka. W większości ludzkich raków, w tym raka jamy ustnej, istotnym wydarzeniem jako częścią mechanizmu leżącego u podstaw jest zmniejszona ekspresja antygenów A i B. W kilku badaniach zaobserwowano, że względna regulacja w dół GTA i GTB występuje w rakach jamy ustnej w związku z rozwojem nowotworu. Niedawno w badaniu asocjacyjnym całego genomu (GWAS) zidentyfikowano warianty w locus ABO związane z podatnością na raka trzustki .

Marker kliniczny

Wielomiejscowe badanie oceny ryzyka genetycznego oparte na kombinacji 27 loci , w tym genu ABO, zidentyfikowało osoby o zwiększonym ryzyku zarówno incydentów, jak i nawrotów choroby wieńcowej, a także zwiększone korzyści kliniczne z leczenia statynami. Badanie opierało się na badaniu kohortowym społeczności (badanie Malmo Diet and Cancer) oraz czterech dodatkowych randomizowanych, kontrolowanych badaniach kohortowych z prewencją pierwotną (JUPITER i ASCOT) i kohortami prewencji wtórnej (CARE i PROVE IT-TIMI 22).

Bibliografia

Dalsza lektura

Zobacz też

Zewnętrzne linki

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .