ChemSpider - ChemSpider

ChemSpider
ChemSpider Logo.png
Zawartość
Opis Baza danych struktur chemicznych zapewniająca szybki dostęp do ponad 100 milionów struktur, właściwości i powiązanych informacji.
Kontakt
Centrum Badań Raleigh, Karolina Północna , Stany Zjednoczone
Laboratorium
Dostęp
Stronie internetowej www.chemspider.com
Przybory
Samodzielny https://itunes.apple.com/us/app/chemspider/id458878661
Różne
Licencja Creative Commons Attribution Share-alike

ChemSpider to baza danych chemicznych . ChemSpider jest własnością Royal Society of Chemistry .

Baza danych

Baza danych zawiera informacje o ponad 100 milionach cząsteczek z ponad 270 źródeł danych, w tym:

Każda substancja chemiczna otrzymuje niepowtarzalny identyfikator , który stanowi część odpowiedniego adresu URL. Na przykład aceton to 175, a więc ma adres URL http://www.chemspider.com/Chemical-Structure.175.html

Crowdsourcing

Baza danych ChemSpider może być aktualizowana o wkład użytkowników, w tym skład chemiczny, osadzanie widm i selekcję użytkownika. Jest to podejście crowdsourcingowe do opracowania internetowej bazy danych chemii. Analiza danych oparta na crowdsourcingu zaowocowała stworzeniem słownika nazw chemicznych powiązanych ze strukturami chemicznymi, który został wykorzystany w zastosowaniach eksploracji tekstów w literaturze biomedycznej i chemicznej.

Jednak prawa do bazy danych nie są uchylane, a zrzut danych nie jest dostępny; w rzeczywistości FAQ stwierdza nawet, że dozwolone są tylko ograniczone pliki do pobrania: w związku z tym prawo do forka nie jest gwarantowane, a projekt nie może być uznany za wolny / otwarty .

Badawczy

Dostępnych jest kilka dostępnych modułów wyszukiwania:

  • Standardowe wyszukiwanie pozwala zapytań dla systematycznych nazw , nazw handlowych i synonimów oraz numerów rejestrowych
  • Zaawansowane umożliwia wyszukiwanie interaktywne przez strukturę chemiczną, podbudowy chemicznej, z zastosowaniem wzoru cząsteczkowego i ciężaru cząsteczkowego zakres, CAS numery, dostawców, itp Wyszukiwanie może być stosowany w celu poszerzenia albo ogranicza już wyników.
  • Wyszukiwanie struktur na urządzeniach mobilnych można przeprowadzić za pomocą bezpłatnych aplikacji na iOS (iPhone / iPod / iPad) i Android (system operacyjny) .

Znacznik na dokumencie chemicznym

Baza danych ChemSpider została wykorzystana w połączeniu z eksploracją tekstów jako podstawa znaczników dokumentów chemicznych . ChemMantis The Chemistry Markup i nomenklatura Transformacja Zintegrowany System wykorzystuje algorytmy zidentyfikować i wyodrębnić nazwy chemiczne z dokumentów i stron internetowych i konwertuje nazwy chemiczne do struktur chemicznych wykorzystujących algorytmy nazwa-struktury konwersji i słownikowe look-upy w bazie ChemSpider. Rezultatem jest zintegrowany system pomiędzy dokumentami chemicznymi i wyszukiwaniem informacji za pośrednictwem ChemSpider w ponad 150 źródłach danych.

Historia

ChemSpider został przejęty przez Royal Society of Chemistry (RSC) w maju 2009 roku. Przed przejęciem przez RSC, ChemSpider był kontrolowany przez prywatną korporację ChemZoo Inc. System został po raz pierwszy uruchomiony w marcu 2007 roku w wersji beta i przeniesiony do wydania w marcu 2008.

Usługi

Szereg usług jest udostępnianych online. Obejmują one konwersję nazw chemicznych na struktury chemiczne , generowanie łańcuchów SMILES i InChI, a także przewidywanie wielu parametrów fizykochemicznych i integrację z usługą sieciową umożliwiającą przewidywanie NMR .

Strony syntetyczne

SyntheticPages to bezpłatna interaktywna baza danych procedur chemii syntetycznej obsługiwana przez Królewskie Towarzystwo Chemii . Użytkownicy zgłaszają procedury syntetyczne, które sami przeprowadzili, do publikacji w serwisie. Procedury te mogą być dziełami oryginalnymi, ale częściej opierają się na reakcjach literaturowych. Cytowania do oryginalnej procedury opublikowanej wykonane są w stosownych przypadkach. Przed wysłaniem są sprawdzane przez redaktora naukowego. Strony nie są poddawane formalnej recenzji, jak artykuł w czasopiśmie naukowym, ale zalogowani użytkownicy mogą zgłaszać komentarze. Komentarze są również moderowane przez redaktorów naukowych. Celem jest zebranie praktycznego doświadczenia w zakresie przeprowadzania pożytecznej syntezy chemicznej w laboratorium. Podczas gdy metody eksperymentalne publikowane w zwykłym czasopiśmie akademickim są wymienione formalnie i zwięźle, procedury w ChemSpider SyntheticPages są podane z bardziej praktycznymi szczegółami. Zachęcamy do nieformalności. Uwzględniono również komentarze przesyłających. Inne publikacje o porównywalnej ilości szczegółów obejmują syntezę organiczną i syntezę nieorganiczną . Witryna SyntheticPages została pierwotnie założona przez profesorów Kevina Bookera-Milburna ( University of Bristol ), Stephena Caddicka ( University College London ), Petera Scotta ( University of Warwick ) i dr Maxa Hammonda. W lutym 2010 roku ogłoszono fuzję z wyszukiwarką struktur chemicznych ChemSpider Królewskiego Towarzystwa Chemicznego i utworzenie ChemSpider | SyntheticPages (CS | SP).

Otwórz PHACTS

ChemSpider służył jako repozytorium związków chemicznych w ramach projektu Open PHACTS , Innovative Medicines Initiative . Otwarte PHACTS opracowane zgodnie z otwartymi standardami, z otwartym dostępem, podejściem do sieci semantycznej w celu rozwiązania problemu wąskich gardeł w odkrywaniu leków małocząsteczkowych - zróżnicowane źródła informacji, brak standardów i nadmiar informacji.

Zobacz też

Bibliografia