Klaster 5 - Cluster 5

" Klaster 5 ", określany również jako ΔFVI-skok przez duńskiego państwa Serum Institute (SSI), to wariant z SARS-CoV-2 , wirus, który powoduje COVID-19 , który uważa się za wymarły. Odkryto go w północnej Jutlandii w Danii i uważa się , że przeniósł się z norek na ludzi za pośrednictwem ferm norek . 4 listopada 2020 r. ogłoszono, że populacja norek w Danii zostanie uśmiercona, aby zapobiec ewentualnemu rozprzestrzenianiu się tej mutacji i zmniejszyć ryzyko wystąpienia nowych mutacji. W siedmiu gminach Północnej Jutlandii wprowadzono blokadę i ograniczenia w podróżowaniu, aby zapobiec rozprzestrzenianiu się mutacji, co może zagrozić krajowym lub międzynarodowym reakcjom na pandemię COVID-19 .

Światowa Organizacja Zdrowia (WHO) stwierdziła, że klaster 5 ma „umiarkowanie zmniejszona wrażliwość na przeciwciała neutralizujące”. SSI ostrzegło, że mutacja może zmniejszyć działanie opracowywanych szczepionek COVID-19 , chociaż jest mało prawdopodobne, że uczyni je bezużytecznymi. Po zablokowaniu i masowych testach SSI ogłosiło 19 listopada 2020 r., że klaster 5 najprawdopodobniej wymarł.

Tło

Norka amerykańska ( Neogale vison )

W 2019 roku Dania była największym producentem futer norek na świecie, przy czym zdecydowana większość duńskich ferm znajdowała się w północnej i zachodniej Jutlandii . W ostatnich latach przemysł w kraju generalnie podupadał. Norki, obok nietoperzy, łuskowców i ludzi, są jednym z wielu gatunków ssaków, które mogą być zarażone koronawirusami .

W listopadzie 2020, w roli łuskowiec w rozprzestrzenianiu COVID-19 jest stopniowo odwołany przez naukowców, w artykule z kryzysów z dnia 7 stycznia, socjolog i dziennikarz gazety Reporterre  [ fr ] Yann Faure przedstawia dane potwierdzające możliwość, że chińskie hodowle norek mogły odegrać rolę w pojawieniu się COVID-19 . We współpracy z dziennikarzem naukowym Yvesem Sciamą przeprowadzili śledztwo dla Reporterre między listopadem a grudniem 2020 r. Następnego dnia w czasopiśmie Science udokumentowano przeniesienie wirusa z norek na ludzi i mutacje związane z norkami , co skłoniło rząd skrócić do końca 2020 r. zakaz hodowli norek, który ma wejść w życie w 2024 r. Po odkryciu w Holandii władze Danii zainicjowały zakrojony na szeroką skalę program nadzoru wszystkich ferm norek w kraju, z regularnymi testami i sekwencjonowanie genomowe. Sekwencje duńskich i holenderskich wirusów związanych z norkami zostały zdeponowane w bazie danych GISAID . US Department of Agriculture (USDA) potwierdziła, że przypadki norek chory COVID-19 zostały opisane w Utah sierpień 2020. Dodatkowe ognisk wykrytych w Michigan , Wisconsin i Oregon . Od 29 listopada 2020 r. infekcje COVID-19 u norek zgłaszano w Danii, Włoszech, Holandii, Hiszpanii, Szwecji i Stanach Zjednoczonych.

Klasyfikacja

W Danii istniało pięć klastrów wariantów norek SARS-CoV-2; Duński Państwowy Instytut Serum (SSI) określił je jako skupienia 1–5 (duński: skupienie 1–5 ). W klastrze 5, określanym również przez SSI jako FVI‑skok , potwierdzono kilka różnych mutacji w białku wypustek wirusa. Specyficzne mutacje obejmują 69-70deltaHV (delecja reszt histydyny i waliny w 69. i 70. pozycji białka), Y453F (zmiana z tyrozyny na fenyloalaninę w pozycji 453, wewnątrz domeny wiążącej receptor białka wypustek), I692V (z izoleucyny na walinę w pozycji 692), M1229I (z metioniny na izoleucynę w pozycji 1229) i niekonserwatywne podstawienie S1147L.

Mutacje związane z norkami, które częściowo przypominają mutacje odkryte w Danii, choć stanowią część odrębnej grupy genomowej, są znane z Holandii.

Implikacje dla zdrowia ludzkiego

5 listopada BBC News poinformowało, że wykryto 12 przypadków zakażenia ludzi wariantem 5 klastra. Tydzień później raport szybkiej oceny ryzyka ECDC wykazał, że miało miejsce 214 przypadków związanych z norkami u ludzi, jednak uważa się, że niewiele z nich, jeśli w ogóle, było dodatkowymi przypadkami związanymi z wybuchem ogniska 5. klastra. Całkowita liczba przypadków u ludzi mogła nie przekroczyć początkowo zgłoszonych 12. Do 20 listopada nie wykryto żadnych dalszych przypadków szczepu Klastra 5 u ludzi pomimo szeroko zakrojonego sekwencjonowania genetycznego, które ujawniło 750 przypadków związanych z norkami, i oceniono, że Klaster Wariant 5 nie krążył już u ludzi.

Historia

Odkrycie

Do 2 listopada 2020 r. duński państwowy niezależny instytut badawczy Statens Serum Institut (SSI) wykrył zmutowane warianty SARS-CoV-2, którymi mogą być zakażeni ludzie i które mogą mieć niebezpieczne skutki na fermach norek w kraju, w przypadku związku między ludźmi. infekcji i 191 pozytywnych ferm norek. Publicznie zgłaszają to 3 listopada, nazywając warianty ze znanym powiązaniem trzem gospodarstwom „Klaster 5”. 4 listopada 2020 r. premier Danii Mette Frederiksen stwierdziła, że ​​zmutowany koronawirus jest przenoszony na ludzi przez norki , związane głównie z fermami norek w północnej Jutlandii . Raport SSI wykazał, że doszło do 12 infekcji u ludzi (8 bezpośrednio związanych z hodowlą norek, 4 w pobliskiej społeczności) z udziałem tej mutacji w Północnej Jutlandii (określanej jako „klaster 5”), a odpowiedź przeciwciał była słabsza . Chociaż instytut stwierdził, że mutacja wydaje się nie być bardziej niebezpieczna niż inne koronawirusy same w sobie, Kåre Mølbak i Tyra Grove Krause z SSI ostrzegli, że mutacja potencjalnie może zmniejszyć działanie obecnie opracowywanych szczepionek COVID-19 , chociaż jest to mało prawdopodobne by uczynić je bezużytecznymi. Ponadto wykazano, że słabsza odpowiedź przeciwciał zmniejsza odporność nabytą w wyniku wcześniejszej infekcji. SSI zauważyło, że chociaż klaster 5 budził pewne obawy, obawiali się również potencjalnych przyszłych mutacji, które mogą pojawić się w norkach, co doprowadziło do zalecenia zamknięcia wszystkich ferm w kraju.

Blokowanie i ubój

Jako środek zapobiegawczy Frederiksen ogłosił, że kraj jest już w trakcie uboju około 14 milionów norek (wstępne raporty o liczbie 15–17 milionów opierały się na szacunkach z wcześniejszych lat, kiedy branża była większa). Aby zapobiec rozprzestrzenianiu się mutacji, ogłoszono również w dniu 5 listopada, że ​​w gminach Brønderslev , Frederikshavn , Hjørring , Jammerbugt , Læsø , Thisted i Vesthimmerland w północnej Jutlandii zostaną wprowadzone blokady i ograniczenia przemieszczania się od 6 listopada. Wszystkie instytucje kulturalne , nakazano zamknięcie kin, teatrów, obiektów sportowych i rekreacyjnych oraz restauracji serwujących posiłki, a także zabroniono wjazdu i wyjazdu z gmin. Transport publiczny został zawieszony 9 listopada. Rozpoczęto testy masowe (Dania miała już jeden z najwyższych wskaźników testów na świecie ), a programy śledzenia zostały dalej przeskalowane. Ograniczenia w północnej Jutlandii początkowo planowano, aby obowiązywały do ​​3 grudnia, ale można je było cofnąć wcześniej, w zależności od szybkości uboju norek i masowych testów ludzi oraz gdyby nie znaleziono nowych przypadków klastra 5.

WHO wydała oświadczenie w sprawie wariantów SARS-CoV-2 6 listopada. Wyjaśniło to, że ta gromada miała kombinację mutacji, której wcześniej nie zaobserwowano. Wariant miał umiarkowanie obniżoną wrażliwość na przeciwciała neutralizujące, ale potrzebne byłyby dalsze badania, aby zrozumieć implikacje dotyczące diagnostyki, terapii i szczepionek. Zostało to później powtórzone w ocenie ryzyka opublikowanej przez Europejskie Centrum ds. Zapobiegania i Kontroli Chorób (ECDC), które zauważa, że ​​ryzyko dla wariantów związanych z norkami jest podobne do ogólnego ryzyka COVID-19, ale można je ponownie ocenić, jeśli obawy podniesione w odniesieniu do odporności , reinfekcji , szczepień i leczenia są potwierdzone w szczególności w przypadku klastra 5, zwracając również uwagę, że krążenie wirusa na fermach norek może stwarzać inne problemy w przyszłości, oraz dostarczając wytyczne dotyczące zarządzania ryzykiem. Pod koniec listopada zabito ponad 10 milionów.

Reakcje międzynarodowe

6 listopada Wielka Brytania ogłosiła, że ​​Dania zostanie usunięta z „korytarza” białej listy krajów, z których podróżni mogą wrócić bez samoizolowania się przez 14 dni, powołując się na wariant klastra-5. 7 listopada Wielka Brytania ogłosiła, że ​​zabroni również wjazdu nierezydentom podróżującym z Danii oraz nierezydentom, którzy byli w Danii w ciągu ostatnich 14 dni. Obywatele brytyjscy nadal mogli wracać do domu, ale oni, podobnie jak wszyscy inni członkowie ich gospodarstwa domowego, musieli izolować się przez 14 dni. Ten zakaz podróżowania miał zostać zrewidowany po tygodniu. Ograniczenia zostały ostatecznie zniesione 28 listopada.

Następstwa

Po masowych testach SSI ogłosiło 19 listopada 2020 r., że nie znaleźli nowych przypadków klastra 5 i według wszelkiego prawdopodobieństwa wymarły. Specjalne ograniczenia nałożone na niektóre gminy Północnej Jutlandii zostały zniesione w dniach 19-20 listopada (są one nadal objęte standardowymi ograniczeniami COVID-19, które obejmują cały kraj i nie są związane z mutacjami norek).

Konsekwencje polityczne

Okazało się pod koniec listopada, że minister rolnictwa , Mogens Jensen , a pięć innych ministrowie zostali poinformowani, że we wrześniu uboju populacji norek całego kraju, a nie tylko te, w zakażonych obszarach, byłoby nielegalne. W obliczu wezwania do rezygnacji z opozycji parlamentarnej i ostrej publicznej krytyki premier Frederiksen przyznał, że nakaz uboju wszystkich norek jest nielegalny, a Jensen podał się do dymisji 18 listopada. Później osiągnięto porozumienie, aby z mocą wsteczną zalegalizować nakaz rządu. 21 grudnia 2020 r. w parlamencie duńskim rząd i lewicowe partie parlamentarne uchwaliły ustawę zakazującą wszelkiej produkcji norek przez cały 2021 r. Projekt ustawy nie zawiera przepisów znoszących odpowiedzialność prawną za poprzedni ubój, ale legalizuje z mocą wsteczną wypłatę premii za szybsze uboje. Partie opozycyjne ( V , C , O , NB , LA ) sprzeciwiały się. 25 stycznia 2021 r. większość w duńskim parlamencie osiągnęła porozumienie w sprawie rekompensaty od 15,6 mld do 18,8 mld DKK duńskich hodowców norek i innych osób utrzymujących się z hodowli norek  ( ok. 2,1 mld EUR – ok. 2,5 mld EUR).

Zobacz też

Bibliografia