Białko F-box - F-box protein

Domena konsolidatora F-box
PDB 1fs2 EBI.jpg
Struktura domeny łącznikowej LRR Skp2 w kompleksie Skp1-Skp2.
Identyfikatory
Symbol F-box
Pfam PF00646
Klan Pfam CL0271
InterPro IPR001810
MĄDRY SM00256
PROSITE PS50181
SCOP2 1fs2 / zakres / SUPFAM
Membrana 630

Białka F-box to białka zawierające co najmniej jedną domenę F-box. Pierwsze zidentyfikowane białko F-box jest jednym z trzech składników kompleksu SCF , który pośredniczy w ubikwitynacji białek przeznaczonych do degradacji przez proteasom 26S .

Podstawowe komponenty

Domena F-box to białkowy motyw strukturalny składający się z około 50 aminokwasów, który pośredniczy w interakcjach białko-białko . Ma sekwencję konsensusową i różni się w kilku pozycjach. Po raz pierwszy został zidentyfikowany w cyklinie F . Motyw F-box Skp2, składający się z trzech alfa-helis, oddziałuje bezpośrednio z białkiem Skp1 SCF . Domeny F-box powszechnie występują w białkach w połączeniu z innymi motywami interakcji białko-białko, takimi jak powtórzenia bogate w leucynę (zilustrowane na rycinie) i powtórzenia WD , o których uważa się, że pośredniczą w interakcjach z substratami SCF.

Funkcjonować

Białka F-box powiązano również z funkcjami komórkowymi, takimi jak transdukcja sygnału i regulacja cyklu komórkowego . W roślinach wiele białek F-box jest reprezentowanych w sieciach genów szeroko regulowanych przez wyciszanie genów za pośrednictwem mikroRNA poprzez interferencję RNA . Białka F-box biorą udział we wzroście i rozwoju wielu roślin wegetatywnych i reprodukcyjnych. Na przykład białko F-box-FOA1 zaangażowane w sygnalizację kwasu abscysynowego (ABA) w celu wpływania na kiełkowanie nasion. ACRE189/ACIF1 może regulować śmierć komórek i obronę, gdy patogen zostanie rozpoznany w roślinie tytoniu i pomidora.

W ludzkich komórkach, w warunkach wysokiej zawartości żelaza, dwa atomy żelaza stabilizują F-Box FBXL5, a następnie kompleks pośredniczy w ubikwitynacji IRP2 .

Rozporządzenie

Poziomy białka F-box mogą być regulowane przez różne mechanizmy. Regulacja może nastąpić poprzez proces degradacji białka i asocjację z kompleksem SCF. Na przykład w drożdżach białko F-box Met30 może być ubikwitynowane w sposób zależny od kulliny. [11]

Bibliografia

Dalsza lektura

Linki zewnętrzne