Białko F-box - F-box protein
Domena konsolidatora F-box | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||||
Symbol | F-box | ||||||||
Pfam | PF00646 | ||||||||
Klan Pfam | CL0271 | ||||||||
InterPro | IPR001810 | ||||||||
MĄDRY | SM00256 | ||||||||
PROSITE | PS50181 | ||||||||
SCOP2 | 1fs2 / zakres / SUPFAM | ||||||||
Membrana | 630 | ||||||||
|
Białka F-box to białka zawierające co najmniej jedną domenę F-box. Pierwsze zidentyfikowane białko F-box jest jednym z trzech składników kompleksu SCF , który pośredniczy w ubikwitynacji białek przeznaczonych do degradacji przez proteasom 26S .
Podstawowe komponenty
Domena F-box to białkowy motyw strukturalny składający się z około 50 aminokwasów, który pośredniczy w interakcjach białko-białko . Ma sekwencję konsensusową i różni się w kilku pozycjach. Po raz pierwszy został zidentyfikowany w cyklinie F . Motyw F-box Skp2, składający się z trzech alfa-helis, oddziałuje bezpośrednio z białkiem Skp1 SCF . Domeny F-box powszechnie występują w białkach w połączeniu z innymi motywami interakcji białko-białko, takimi jak powtórzenia bogate w leucynę (zilustrowane na rycinie) i powtórzenia WD , o których uważa się, że pośredniczą w interakcjach z substratami SCF.
Funkcjonować
Białka F-box powiązano również z funkcjami komórkowymi, takimi jak transdukcja sygnału i regulacja cyklu komórkowego . W roślinach wiele białek F-box jest reprezentowanych w sieciach genów szeroko regulowanych przez wyciszanie genów za pośrednictwem mikroRNA poprzez interferencję RNA . Białka F-box biorą udział we wzroście i rozwoju wielu roślin wegetatywnych i reprodukcyjnych. Na przykład białko F-box-FOA1 zaangażowane w sygnalizację kwasu abscysynowego (ABA) w celu wpływania na kiełkowanie nasion. ACRE189/ACIF1 może regulować śmierć komórek i obronę, gdy patogen zostanie rozpoznany w roślinie tytoniu i pomidora.
W ludzkich komórkach, w warunkach wysokiej zawartości żelaza, dwa atomy żelaza stabilizują F-Box FBXL5, a następnie kompleks pośredniczy w ubikwitynacji IRP2 .
Rozporządzenie
Poziomy białka F-box mogą być regulowane przez różne mechanizmy. Regulacja może nastąpić poprzez proces degradacji białka i asocjację z kompleksem SCF. Na przykład w drożdżach białko F-box Met30 może być ubikwitynowane w sposób zależny od kulliny. [11]
Bibliografia
Dalsza lektura
- Ho M, Tsai P, Chien C (2006). „Białka F-box: klucz do degradacji białek” . J Biomed Sci . 13 (2): 181-191. doi : 10.1007/s11373-005-9058-2 . PMID 16463014 .
Linki zewnętrzne
- F-Box + Proteiny w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)
- F-box + motywy w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)