Firmicutes - Firmicutes
| Firmicutes | |
|---|---|
|
|
| Bacillus subtilis , barwiony metodą Grama | |
Klasyfikacja naukowa 
|
|
| Domena: | Bakteria |
| (bez rankingu): | Terrabakteria |
| Gromada: |
Firmicutes Gibbons i Murray 1978, Murray, 1984 |
| Klasy | |
| Synonimy | |
|
|
W Firmicutes ( Łacińskiej : firmus , silny i Cutis , skóry, odnoszące się do ściany komórkowej) są Phylum z bakterii , z których większość bakterii Gram-dodatnich ściany komórkowej struktury. Jednak niektóre, takie jak Megasphaera , Pectinatus , Selenomonas i Zymophilus , mają porowatą pseudo-zewnętrzną błonę, która powoduje, że zabarwiają się na bakterie Gram-ujemne . Naukowcy kiedyś zaklasyfikowali Firmicutes tak, aby obejmowały wszystkie bakterie Gram-dodatnie, ale ostatnio zdefiniowali je jako podstawową grupę pokrewnych form, zwaną grupą o niskim G+C , w przeciwieństwie do Actinobacteria . Mają okrągłe komórki, zwane cocci (pojedynczy coccus) lub formy przypominające pręciki (bacillus).
Wiele Firmicutes produkować endospory , które są odporne na wysychanie i może przetrwać ekstremalne warunki. Występują w różnych środowiskach, a grupa obejmuje kilka godnych uwagi patogenów. Te z jednej rodziny, heliobakterie , wytwarzają energię poprzez fotosyntezę anoksygeniczną . Firmicutes odgrywają ważną rolę w psuciu się piwa, wina i cydru.
Klasy
Grupa jest zazwyczaj podzielona na Clostridia , które są beztlenowe i Bacilli , które są bezwzględnymi lub fakultatywnymi tlenowcami .
Na drzewach filogenetycznych dwie pierwsze grupy są widoczne jako parafiletyczne lub polifiletyczne , podobnie jak ich główne rodzaje Clostridium i Bacillus . Jednak Firmicutes jako całość jest ogólnie uważany za monofiletyczny lub parafiletyczny z wyłączeniem Mollicutes .
Filogeneza
Filogeneza wydana przez Annotree i GTDB 05-RS95 (17 lipca 2020 r.).
| Firmicutes |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ta druga filogeneza oparta jest na wersji 132 LTP opartej na 16S rRNA opracowanej przez All-Species Living Tree Project , z obecnie akceptowaną taksonomią opartą na Liście nazw prokariotycznych z Standing in Nomenclature (LPSN), National Center for Biotechnology Information (NCBI) oraz niektóre niesprawdzone nazwy kladów z Genome Taxonomy Database .
|
Parafiletyczne
Thermoanaerobacterales |
Generał
Ponad 274 rodzaje zostały uznane od 2016 roku za należące do gromady Firmicutes, godne uwagi rodzaje Firmicutes obejmują:
Bacilli, zamów Bacillales
Bacilli, zamów Lactobacillales
Znaczenie kliniczne
Firmicutes stanowią największą część mikrobiomu jelitowego myszy i człowieka . Wykazano, że podział Firmicutes jako część mikroflory jelitowej jest zaangażowany w resorpcję energii i potencjalnie związany z rozwojem cukrzycy i otyłości . W jelitach zdrowych dorosłych ludzi najliczniejsza bakteria: Faecalibacterium prausnitzii (F. prausnitzii) , która stanowi 5% całkowitego mikrobiomu jelitowego, należy do gromady Firmicutes. Gatunek ten jest bezpośrednio związany ze zmniejszonym stanem zapalnym niskiego stopnia w otyłości. F. prausnitzii stwierdzono w wyższych ilościach w jelitach dzieci otyłych niż u dzieci bez otyłości.
W wielu badaniach stwierdzono wyższą obfitość Firmicute u osób otyłych niż u osób szczupłych. Wyższy poziom Lactobacillus (typu Firmicutes) stwierdzono u otyłych pacjentów, a w jednym z badań otyli pacjenci stosujący diety odchudzające wykazali zmniejszoną ilość Firmicutes w ich jelitach.
Wykazano również, że zmiany diety u myszy sprzyjają zmianom w obfitości Firmicutes. Wyższą względną obfitość Firmicutes zaobserwowano u myszy karmionych dietą zachodnią (wysokotłuszczową/wysokocukrową) niż u myszy karmionych standardową dietą niskotłuszczową/wysoką polisacharydową. Większa ilość Firmicutes była również powiązana z większą otyłością i masą ciała u myszy. W szczególności, wśród otyłych myszy, klasa Mollicutes (w obrębie typu Firmicutes) była najczęstsza. Kiedy mikroflora otyłych myszy z wyższą obfitością Firmicutes została przeszczepiona do jelit myszy wolnych od zarazków, myszy wolne od zarazków zyskały znaczną ilość tłuszczu w porównaniu z tymi, którym przeszczepiono mikroflorę chudych myszy z niższą obfitością Firmicutes.
Stwierdzono, że obecność bakterii Christensenella (Firmicutes, w klasie Clostridia) wyizolowanej z kału ludzkiego koreluje z niższym wskaźnikiem masy ciała .
Bibliografia
Zewnętrzne linki
- Phylum „Firmicutes” - JP Euzéby: Lista imion prokariotycznych ze statusem w nomenklaturze