Fuzobakterie - Fusobacteria
Fuzobakterie | |
---|---|
Fusobacterium novum w kulturze płynnej | |
Klasyfikacja naukowa | |
Domena: | Bakteria |
Gromada: |
Fusobakterie Garrity i Holt 2012 |
Klasa: |
Fusobacteriia Staley & Whitman, 2012 |
Zamówienie: |
Fusobacteriales Staley & Whitman, 2012 |
Rodziny i pokolenia | |
Fusobacteria są obligatoryjnie beztlenowe non-sporeforming Gram-ujemne pałeczki . Od pierwszych doniesień pod koniec dziewiętnastego wieku do tych organizmów przypisywano różne nazwy, czasami przy czym ta sama nazwa była stosowana do różnych gatunków. Ostatnio nie tylko nastąpiły zmiany w nomenklaturze , ale także próby rozróżnienia między gatunkami, które uważa się za patogenne, komensalne lub oba. Ze względu na ich charakter asacharydowy i ogólny niedostatek pozytywnych wyników w rutynowych testach biochemicznych, laboratoryjna identyfikacja fusobakterii była trudna. Jednak zastosowanie nowych technik biologii molekularnej do taksonomii pozwoliło ustalić szereg nowych gatunków, wraz z subspecjacją Fusobacterium necrophorum i F. nucleatum , oraz dostarczyło nowych metod identyfikacji. Zaangażowanie fusobakterii w szerokim spektrum ludzkich infekcji powodujących martwicę tkanek i posocznicę jest od dawna znane, a ostatnio donoszono o ich znaczeniu w zakażeniach wewnątrzowodniowych, przedwczesnym porodzie i owrzodzeniach tropikalnych.
Od czasu pierwszych doniesień o Fusobacterium pod koniec XIX wieku, różnorodność nazw gatunkowych doprowadziła do zamieszania w obrębie rodzajów Fusobacterium i Leptotrichia . Jednak nowsze metody badawcze doprowadziły do lepszego zrozumienia taksonomii dzięki opisowi kilku nowych gatunków fusobakterii. Wśród nowych opisanych gatunków są F. ulcerans z tropikalnych wrzodów i kilka gatunków z jamy ustnej. Możliwa była również subspecjacja ważnych gatunków F. necrophorum i F. nucleatum . Jest prawdopodobne, że taksonomia fusobakterii może być dalej rozwijana w przyszłości.
Filogeneza
Obecnie przyjęta taksonomia jest oparta na Liście nazw prokariotycznych z Standing in Nomenclature (LSPN), a filogeneza oparta jest na wersji 123 LTP opartej na 16S rRNA opracowanej przez The All-Species Living Tree Project .
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Uwaga 1: Gatunki nieużywane w Projekcie Żywych Drzew Wszystkich Gatunków
- Leptotrichiaceae
- Caviibacter abscessus Eisenberg et al. 2016
- Oceanivirga salmonicida Eisenberg et al. 2016
- Streptobacillus felis Eisenberg i in. 2015
- Streptobacillus notomytis Eisenberg et al. 2015
- Streptobacillus ratti Eisenberg i in. 2015
- Sneathia amnionii ♠ Harwich et al. 2012
- Fusobacteriaceae
- Ilyobacter delafieldii Janssen i Harfoot 1991
- Ilyobacter psychrophilus ♠ Qoura & Antranikian 2005a
- Fusobacterium naviforme (Jungano 1909) Moore i Holdeman 1970
- Fusobacterium plautii corrig. Seguin 1928
- Fusobacterium polysaccharolyticum van Gylswyk 1981
- Fusobacterium prausnitzii (Hauduroy et al. 1937) Moore & Holdeman 1970
- Fusobacterium sulci Cato i in. 1985
Uwaga 2:
♠ Szczep znaleziony w National Center for Biotechnology Information (NCBI), ale niewymieniony w Liście nazw prokariotycznych ze statusem w nomenklaturze (LPSN)
Pojawiają się nowe dowody na to, że ta bakteria może powodować raka okrężnicy lub być z nim związana. W 2011 roku badacze zgłosili obecność fusobakterii w tkance raka okrężnicy (Genome Res 2012; 22:292), a nowe wieloośrodkowe badanie dostarcza dowodów na to, że niektóre przypadki, szczególnie prawostronne, mogą być spowodowane przez zakażenie Fusobakterią.(1)
1. Bullman S i in. Nauka 2017 15 grudnia; 358:1443.