Gemmatimonadetes - Gemmatimonadetes

Gemmatimonadetes
Klasyfikacja naukowa
Domena:	Bakteria
(bez rankingu):	Grupa FCB
Gromada:	Gemmatimonadetes Zhang i in. 2003
Klasa
Gemmatimonadetes
Synonimy
Gemmatimonadaeota Oren i in. 2015 „Gemmatimonadota” Whitman i in. 2018 „Glassbacteria” Anantharaman i in. 2016

W Gemmatimonadetes (alternatywnie Gemmatimonadota) są Phylum z bakterii określonych w 2003. Phylum zawiera dwie klasy Gemmatimonadetes i Longimicrobia.

Gatunek

Gatunek typowy Gemmatimonas aurantiaca szczep T-27 ^T został wyizolowany z osadu czynnego w oczyszczalni ścieków w 2003 roku. Jest to bakteria Gram-ujemna zdolna do wzrostu zarówno poprzez oddychanie tlenowe, jak i beztlenowe.

Drugim hodowanym gatunkiem był Gemmatirosa kalamazoonensis gen. lis., sp. lis. szczep KBS708, który został wyizolowany z uprawianej ekologicznie gleby rolniczej w Michigan USA.

Trzeci hodowany gatunek Gemmatimonas phototrophica szczep AP64 ^T został wyizolowany z płytkiego słodkowodnego pustynnego jeziora Tiān é hú (Jezioro Łabędzie) w północnych Chinach. Unikalną cechą tego organizmu jest obecność bakteryjnych centrów reakcji fotosyntezy. Prawdopodobnie nabyła geny do fotosyntezy anoksygenowej poprzez horyzontalny transfer genów . G. phototrophica jest fakultatywnym organizmem fotoheterotroficznym. Do wzrostu wymaga dostarczenia substratu organicznego, ale może uzyskać dodatkową energię do swojego metabolizmu ze światła.

Szczep CB-286315T Longimicrobium terrae wyizolowano z próbki gleby z typowego śródziemnomorskiego ekosystemu leśnego zlokalizowanego w Granadzie w Hiszpanii. Ze względu na tę dużą odległość filogenetyczną od innych hodowanych Gemmatimonade, ustanowiła nową klasę o nazwie Longimikrobia.

Dystrybucja środowiskowa

Dane z badań niezależnych od kultury wskazują, że Gemmatimonadetes są szeroko rozpowszechnione w wielu naturalnych siedliskach. Stanowią około 2% zbiorowisk bakterii glebowych i zostały zidentyfikowane jako jedna z dziewięciu najlepszych typów występujących w glebie; jednak obecnie istnieje tylko sześć hodowanych izolatów. Gemmatimonadetes znaleziono w różnych suchych glebach, takich jak łąki, łąki i pastwiska, a także w eutroficznych osadach jeziornych i glebach alpejskich. Ta szeroka gama środowisk, w których znaleziono Gemmatimonadetes, sugeruje przystosowanie do niskiej wilgotności gleby. Przeprowadzone badania wykazały, że rozmieszczenie Gemmatimonadetes w glebie jest bardziej zależne od dostępności wilgoci niż od agregacji, co wzmacnia przekonanie, że członkowie tej gromady preferują suche gleby. Mniejsze liczby znaleziono również w różnych środowiskach wodnych, takich jak wody słodkie i osady.

Taksonomia

Obecnie przyjęta taksonomia jest oparta na Liście nazw prokariotycznych z Standing in Nomenclature (LSPN), National Center for Biotechnology Information , All-Species Living Tree Project i GTDB 05-RS95 ( Genome Taxonomy Database ).

• Phylum Gemmatimonadetes Zhang i in. 2003
  • Klasa „ Glasbakterie ” (RIF5)
  • Klasa Gemmatimonadetes Zhang i in. 2003 [Longimikrobia Pascual i in. 2016 ]
    • Zamów Longimicrobiales Pascual et al. 2016
      • Rodzina Longimicrobiaceae Pascual et al. 2016
        • Rodzaj Longimicrobium Pascual i in. 2016
          • Gatunek L. terrae Pascual et al. 2016
    • Zamów Gemmatimonadales Zhang et al. 2003
      • Rodzina Gemmatimonadaceae Zhang et al. 2003
        • Rodzaj Roseisolibacter Pascual i in. 2018
          • Gatunek R. agri Pascual et al. 2018
        • Rodzaj Gemmatirosa DeBruyn i in. 2013
          • Gatunek G. kalamazoonesis DeBruyn et al. 2013
        • Rodzaj Gemmatimonas Zhang i in. 2003 pom. Zeng i in. 2015
          • Gatunek G. phototrophica Zeng et al. 2015
          • Gatunek G. aurantiaca Zhang et al. 2003 pom. Zeng i in. 2015

Zobacz też

• Lista zamówień bakteryjnych

Bibliografia

Zewnętrzne linki

• Krótka taksonomia
• Fawaz, Minnesota (2013). Ujawnienie ekologicznej roli Gemmatimonadetes poprzez uprawę i analizę molekularną gleb rolniczych. 44-60. Krótki przegląd gromady.