Halorubrum -Halorubrum

Halorubrum
Klasyfikacja naukowa
Domena:	Archea
Królestwo:	Euryarchaeota
Gromada:	Euryarchaeota
Klasa:	Halobakterie
Zamówienie:	Halobakterie
Rodzina:	Halobacteriaceae
Rodzaj:	Halorubrum McGenity i Grant 1996
Gatunek
H. aidingense H. alkaliphilum H. arcis H. californiensis H. coriense H. dystrybucja H. ejinorense H. ezzemoulense H. kocurii H. lacusprofundi H. lipolyticum H. litoreum H. luteum H. orientalis H. saccharovorum H. salsolis H. sodomizm H. tebenquichense H. terrestre H. tybetański H. trapanicum H. wakuolatum H. xinjiangense
Synonimy
Halorubrobacterium Kamekura i Dyall-Smith 1996

Halorubrum to rodzaj z rodziny Halobacteriaceae . Gatunki Halorubrum można znaleźć w Morzu Martwym , jeziorze Zabuye i innych wodach o wysokim stężeniu soli.

Wymiana genetyczna

Populacja haloarchaea Halorubrum w swoim naturalnym środowisku o wysokim stężeniu soli często wymieniała informacje genetyczne poprzez rekombinację. Ta populacja wykazywała stopień równowagi sprzężenia zbliżony do populacji płciowej.

Taksonomia

W taksonomii , Halorubrum to rodzaj z Halobacteriaceae .

Gatunek

Halorubrum ejinorense została po raz pierwszy wyizolowana z jeziora Ejinor w Mongolii Wewnętrznej , Chiny .

Halorubrum lacusprofundi zostało po raz pierwszy wyizolowane w latach 80. z Deep Lake na Antarktydzie . Jego genom , zsekwencjonowany w 2006 roku, składa się z dwóch chromosomów (jeden 2,74 Mb, a drugi 0,53 Mb) i jednego plazmidu (0,43 Mb). Jej enzym β-galaktozydaza został gruntownie przebadany, aby zrozumieć, w jaki sposób białka funkcjonują w niskotemperaturowych środowiskach o wysokim zasoleniu. Jeden szczep H. lacusprofundi zawiera plazmid do horyzontalnego transferu genów , który odbywa się poprzez mechanizm wykorzystujący cząstki wirusopodobne zamknięte w pęcherzyku.

Halorubrum sodomense został po raz pierwszy zidentyfikowany w Morzu Martwym w 1980 roku. Do wzrostu wymaga wyższego stężenia jonów Mg ²⁺ niż pokrewne halofile . Jej błona powierzchniowa zawiera Archaerhodopsynę-3 (AR3), białko fotoreceptorowe, które pobiera energię ze światła słonecznego w celu ustalenia siły napędowej protonów, która jest wykorzystywana do syntezy ATP . Mutanty AR3 są szeroko stosowane jako narzędzia w optogenetyce do badań neurologicznych.

Halorubrum tibetense została po raz pierwszy wyizolowana z jeziora Zabuye w Tybecie , Chinach .

Halorubrum xinjiangense została po raz pierwszy wyizolowana z Xiao-er-Kule jeziora w Xinjiang , Chiny .

Bibliografia

Dalsza lektura

Czasopisma naukowe

• Oren A, Ventosa A (2000). „Międzynarodowy Komitet ds. Systematycznej Bakteriologii Podkomitet ds. taksonomii Halobacteriaceae. Protokoły posiedzeń, 16 sierpnia 1999 r., Sydney, Australia” . wewn. J. Syst. Ewol. Mikrobiol . 50 (3): 1405-1407. doi : 10.1099/00207713-50-3-1405 . PMID  10843089 .
• Oren A, Ventosa A (1996). „Propozycja przeniesienia Halorubrobacterium distributum i Halorubrobacterium coriense do rodzaju Halorubrum jako odpowiednio Halorubrum distributum comb. nov. i Halorubrum coriense comb. nov.” . wewn. J. Syst. Bakteriol . 46 (4): 1180. doi : 10.1099/00207713-46-4-1180 .
• McGenity TJ, Grant WD (1995). „Przeniesienie Halobacterium saccharovorum, Halobacterium sodomense, Halobacterium trapanicum NRC 34021 i Halobacterium lacusprofundi do rodzaju Halorubrum gen. nov., jako Halorubrum saccharovorum comb. nov., Halorubrumsodomense comb. nov., Halorubrum combro-tranicus i combrofundi. .nov". Syst. Zał. Mikrobiol . 18 (2): 237–243. doi : 10.1016/s0723-2020(11)80394-2 .
• Kamekura M, Dyall-Smith ML (1995). „Taksonomia rodziny Halobacteriaceae oraz opis dwóch nowych rodzajów Halorubrobacterium i Natrialba” . J. Gen. Appl. Mikrobiol . 41 (4): 333–350. doi : 10.2323/jgam.41.333 .
• Papke T, Fullmer M, Soucy S, Swithers K, Makkay A, Wheeler R, Ventosa A, Gogarten P (11 kwietnia 2014). „Analiza populacji i genomu rodzaju Halorubrum” . Granice w mikrobiologii . 5 (nr artykułu: 140): 140. doi : 10.3389/fmicb.2014.00140 . PMC  3990103 . PMID  24782836 .

Książki naukowe

• Gibbons, NE (1974). „Rodzina V. Halobacteriaceae fam. nov.”. W RE Buchanan; NE Gibbons (red.). Bergey's Manual of Determinative Bacteriology (8th ed.). Baltimore: The Williams & Wilkins Co. ISBN 0-683-01117-0.

Naukowe bazy danych

• Referencje PubMed dla Halorubrum
• Referencje PubMed Central dla Halorubrum
• Referencje Google Scholar dotyczące Halorubrum

Zewnętrzne linki

• Strona taksonomii NCBI dla Halorubrum
• Wyszukaj strony taksonomii drzewa życia dla Halorubrum
• Strona wyszukiwania gatunków2000 dla Halorubrum
• Strona MicrobeWiki dla Halorubrum
• Strona LPSN dla Halorubrum
• Halorubrum w Bac Dive - Metadane dotyczące różnorodności bakterii