Ludzki metapneumowirus -Human metapneumovirus

Ludzki metapneumowirus
Patogeny-04-00682-g001.png
Struktura i genom ludzkiego metapneumowirusa (hMPV)
Klasyfikacja wirusów mi
(bez rankingu): Wirus
Królestwo : Rybowiria
Królestwo: Orthornavirae
Gromada: Negarnaviricota
Klasa: Monjiviricetes
Zamówienie: Mononegawirusy
Rodzina: Pneumoviridae
Rodzaj: Metapneumowirus
Gatunek:
Ludzki metapneumowirus

Ludzki metapneumowirus ( HMPV ) jest wirusem zjednoniciowym RNA o negatywnym znaczeniuz rodziny Pneumoviridae i jest blisko spokrewniony zpodgrupą C ptasiego metapneumowirusa (AMPV).TechnikaPCR (RNA arbitralnie startery PCR ) do identyfikacji nieznanych wirusów rosnących w hodowanych komórkach. Jest to druga najczęstsza przyczynainfekcji dolnych dróg oddechowych u małych dziecipo wirusie syncytium nabłonka oddechowego (RSV).

Szczytowy wiek hospitalizacji niemowląt z HMPV przypada na 6-12 miesięcy, nieco wcześniej niż szczyt RSV , który wynosi około 2-3 miesięcy. Objawy kliniczne i nasilenie HMPV są podobne do RSV. HMPV jest również ważną przyczyną choroby u osób starszych.

Taksonomia

Rodzaj Metapneumovirus : gatunki i ich wirusy
Rodzaj Gatunek Wirus (skrót) Identyfikator taksonomii NCBI
Metapneumowirus Ptasi metapneumowirus metapneumowirus ptaków (AMPV) 38525
Ludzki metapneumowirus ludzki metapneumowirus (HMPV) 162145

Epidemiologia

HMPV jest związane z 5% do 40% infekcji dróg oddechowych u dzieci hospitalizowanych i ambulatoryjnych. Wirus jest rozprzestrzeniony na całym świecie, aw regionach o klimacie umiarkowanym występuje sezonowo podobnie jak wirus RSV i grypy późną zimą i wiosną. Badania serologiczne wykazały, że w wieku pięciu lat praktycznie wszystkie dzieci na całym świecie były narażone na wirus. Pomimo niemal powszechnej infekcji we wczesnym okresie życia, reinfekcje są powszechne u starszych dzieci i dorosłych. Ludzki metapneumowirus może powodować łagodne zakażenie górnych dróg oddechowych ( przeziębienie ). Jednak wcześniaki, osoby z obniżoną odpornością i osoby starsze w wieku powyżej 65 lat są narażone na ryzyko ciężkiej choroby i hospitalizacji. W niektórych badaniach dotyczących hospitalizacji i wizyt w izbach przyjęć HMPV jest prawie tak powszechna i tak ciężka jak grypa u osób starszych. HMPV wiąże się z cięższą chorobą u osób z astmą i dorosłych z przewlekłą obturacyjną chorobą płuc ( POChP ). W placówkach opieki długoterminowej dla dzieci i dorosłych zgłoszono liczne epidemie HMPV , powodujące ofiary śmiertelne.

Genom

Organizacja genomowa HMPV jest podobna do RSV ; jednakże HMPV nie ma genów niestrukturalnych , NS1 i NS2, a genom antysensownego RNA HMPV zawiera osiem otwartych ramek odczytu w nieco innej kolejności genów niż RSV (tzn. 3'-NPMF-M2-SH-GL-5'). HMPV jest genetycznie podobny do ptasich metapneumowirusów A, B, aw szczególności typu C. Analiza filogenetyczna HMPV wykazała istnienie dwóch głównych linii genetycznych określanych jako podtyp A i B, zawierających odpowiednio podgrupy A1/A2 i B1/B2. Genotypowanie oparte na sekwencjach genów F i G wykazało, że podtyp B był związany z dłuższym czasem trwania kaszlu i zwiększonym ogólnym układem oddechowym w porównaniu z HMPV-A.

Wirusologia

HMPV infekuje komórki nabłonka dróg oddechowych w nosie i płucu. Uważa się, że HMPV przyłącza się do komórki docelowej poprzez interakcje białka glikoproteiny (G) z siarczanem heparanu i innymi glikozaminoglikanami. Białko fuzyjne HMPV (F) koduje motyw RGD (Arg-Gly-Asp), który angażuje integryny wiążące RGD jako receptory komórkowe, a następnie pośredniczy w fuzji błony komórkowej i otoczki wirusa w sposób niezależny od pH, prawdopodobnie w obrębie endosomów .

Wykrycie

Identyfikacja HMPV opierała się głównie na technologii reakcji łańcuchowej polimerazy z odwrotną transkryptazą ( RT-PCR ) do amplifikacji bezpośrednio z RNA wyekstrahowanego z próbek oddechowych. Zastosowano alternatywne, bardziej opłacalne podejścia do wykrywania HMPV za pomocą metod opartych na kwasach nukleinowych , które obejmują:

  1. wykrywanie antygenów hMPV w wydzielinie nosogardzieli za pomocą testu immunofluorescencyjnego na przeciwciała
  2. zastosowanie barwienia immunofluorescencyjnego z przeciwciałami monoklonalnymi do wykrywania HMPV w wydzielinie nosogardzieli i hodowlach fiolkowych z otoczki
  3. testy immunofluorescencyjne do wykrywania przeciwciał specyficznych dla hMPV
  4. zastosowanie przeciwciał poliklonalnych i bezpośrednia izolacja w hodowanych komórkach.

Przenoszenie

Do tej pory nie ma jednoznacznych badań; jednak prawdopodobne jest, że przeniesienie następuje przez kontakt z zanieczyszczonymi wydzielinami, za pośrednictwem wektorów kropelkowych, aerozolowych lub formitowych . Zgłaszano zakażenia szpitalne ludzkim metapneumowirusem. Wykazano, że HMPV krąży w miesiącach jesiennych i zimowych, z naprzemienną przewagą jednego podtypu każdego roku.

Leczenie

Nie jest jeszcze znane żadne leczenie, ale rybawiryna wykazała skuteczność w modelu zwierzęcym.

Amerykańska korporacja farmaceutyczna Moderna przeprowadziła badanie kliniczne kandydata na szczepionkę modRNA przeciwko metapneumowirusowi. Od października 2019 r. kandydat na szczepionkę przeszedł przez fazę I , z doniesieniami, że szczepionka jest dobrze tolerowana przy wszystkich poziomach dawek po dwóch miesiącach i wywołuje odpowiedź immunologiczną, która zwiększa produkcję przeciwciał neutralizujących .

Ewolucja

Metapneumowirus ludzki został po raz pierwszy zgłoszony w 2001 roku, a metapneumowirus ptasi w latach 70. XX wieku. Istnieją co najmniej cztery linie ludzkiego metapneumowirusa — A1, A2, B1 i B2. Ptasi metapneumowirus został podzielony na cztery podgrupy — A, B, C i D. Szacunki Bayesa sugerują, że ludzki metapneumowirus pojawił się 119–133 lata temu i oddzielił się od ptasiego metapneumowirusa około 1800 roku.

Bibliografia

Zewnętrzne linki