Region międzygenowy - Intergenic region

Ilustracja międzygenowego DNA

Obszar międzygenowy (IGR) jest odcinek DNA sekwencji znajdujących się pomiędzy genami . Regiony międzygenowe stanowią podzbiór niekodującego DNA . Czasami niektóre międzygenowe DNA kontrolują pobliskie geny, ale większość z nich nie ma obecnie znanej funkcji. Jest to jedna z sekwencji DNA nazywanych czasami śmieciowym DNA , chociaż jest to tylko jedno zjawisko tak oznaczone, aw dzisiejszych badaniach naukowych termin ten jest rzadziej używany. Niedawno transkrybowane RNA z fragmentów DNA w regionach międzygenowych były znane jako „ciemna materia” lub „transkrypty ciemnej materii”.

Nieruchomości

Inter regiony genowe są różne od wewnątrz regionów uczuleń (lub intronami ), które są krótkie, niekodujących regionów, które znajdują się w obrębie genów, szczególnie w genach eukariotycznych organizmów.

Zgodnie z badaniami nad ludzkim genomem przeprowadzonych w ramach projektu ENCODE , ze względu na „zarówno ekspansję regionów genowych poprzez odkrycie nowych izoform, jak i identyfikację nowych transkryptów międzygenowych, nastąpił wyraźny wzrost liczby regionów międzygenowych 60 250) ze względu na ich fragmentację i zmniejszenie ich długości (z 14 170  pz do 3949 pz mediany długości) "

Naukowcy teraz sztucznie zsyntetyzowali białka z regionów międzygenowych.

Funkcje

Historycznie rzecz biorąc, regiony międzygenowe były czasami nazywane śmieciowym DNA, co sugeruje, że nie mają one żadnej funkcji. Jednak od dawna wiadomo, że regiony te zawierają funkcjonalnie ważne elementy, takie jak promotory i wzmacniacze. W szczególności regiony międzygenowe często zawierają sekwencje wzmacniające DNA, które mogą aktywować ekspresję dyskretnych zestawów genów na odległości kilku tysięcy par zasad. Zmiany w białkach związanych ze wzmacniaczami przeprogramowują ekspresję genów i wpływają na fenotyp komórki. Również regiony międzygenowe mogą zawierać jeszcze niezidentyfikowane geny, takie jak niekodujące RNA . Chociaż niewiele o nich wiadomo, uważa się, że pełnią one funkcje regulacyjne. W ostatnich latach w ramach projektu ENCODE bardziej szczegółowo badano międzygenowe regiony człowieka. Opracowano specjalnie metody statystyczne do wykrywania regionów związanych z cechami lub chorobami, zlokalizowanych w regionie międzygenowym, przy użyciu danych z sekwencjonowania całego genomu , w tym procedury przesuwanego okna i procedury dynamicznego okna.

Regiony międzygenowe w organizmach

U ludzi regiony międzygenowe stanowią około 50% genomu , podczas gdy liczba ta jest znacznie mniejsza w przypadku bakterii (15%) i drożdży (30%).

W Plasmodium falciparum w wielu regionach międzygenowych zawartość AT wynosi 90%.

Zobacz też

Bibliografia

Zewnętrzne linki