Kompleks Mycobacterium tuberculosis - Mycobacterium tuberculosis complex
Mycobacterium tuberculosis kompleks ( MTC lub MTBC ) jest genetycznie związany z grupą Mycobacterium gatunków, które mogą być przyczyną gruźlicy u ludzi lub innych zwierząt.
Obejmuje:
- Prątek gruźlicy
- Mycobacterium africanum
- Mycobacterium orygis
- Mycobacterium bovis i szczep Bacillus Calmette–Guérin
- Mycobacterium microti
- Mycobacterium canetti
- Mycobacterium caprae
- Mycobacterium pinnipedii
- Mycobacterium suricattae
- Mycobacterium mungi
Ponadto istnieją dwie gałęzie, które mają podobieństwa filogenetyczne, ale nie są w pełni opisane: pałeczki dassie i oryx. Laseczki Oryx zostały niedawno przeklasyfikowane do osobnego podgatunku, orygis.
Członków MTC można odróżnić od wszystkich innych bakterii dzięki obecności 63 konserwatywnych wskaźników sygnatur (CSI) obecnych w różnych białkach, które są wspólne wyłącznie dla tych patogenów. Ze względu na ich wyłączność na kompleks MTC i obecność w wysoce konserwatywnych regionach białek, te CSI dostarczają nowych środków do badań funkcjonalnych i diagnostycznych (w tym potencjalnych celów do opracowania nowych leków).
Filogenetyka
Ponieważ MTBC rozdzieliły się na różne linie, podobnie jak ekspresja kluczowych i metabolicznych genów patogennych, w wyniku mutacji wprowadzających nowe skrzynki TANNNT Pribnowa i mutacje, które upośledzają funkcję represorów Transcripcionales. Dostarcza to wyraźnych dowodów na to, że linie MTBC prawdopodobnie odzwierciedlają adaptację do różnych populacji ludzkich. W rzeczywistości modyfikowanie ekspresji genów może być szybkim mechanizmem fizjologicznej adaptacji do nowego środowiska bez konieczności zasadniczej zmiany genomu.
Można to zaobserwować w sposobie, w jaki różne klady MTBC mają swój własny podpis transkryptomiczny. Nawet jednopunktowe mutacje mogą całkowicie zmienić profil transkrypcyjny szczepu. Przykładem jest szczep N1177, który niesie pojedynczą mutację w genie rpoB, która nadaje oporność na ryfampicynę, która modyfikuje poziomy transkrypcji wielu genów.
Rola metylacji jest bardziej nieuchwytna, wzór inaktywacji mutacji wydaje się potwierdzać, że metylazy nie są zachowane w mtBC. Adaptacja transkrypcyjna może pozwolić izolatom M. tuberculosis na optymalizację ich zakaźności i przenoszenia w subtelnie różnych środowiskach zapewnianych przez różne populacje ludzkich gospodarzy.