PubMed Central - PubMed Central

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
PubMed Central
Producent Narodowa Biblioteka Medyczna Stanów Zjednoczonych (Stany Zjednoczone)
Historia 2000 do przedstawienia
Dostęp
Koszt Wolny
Pokrycie
Dyscypliny Lekarstwo
Rekordowa głębokość Indeks, streszczenie i pełny tekst
Zakres formatu artykuły prasowe
Spinki do mankietów
Stronie internetowej https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/
Lista tytułów https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/journals/

PubMed Central ( PMC ) to darmowe cyfrowe repozytorium że archiwa otwarty dostęp pełnotekstowych artykułów naukowych, które zostały opublikowane w biomedycznych i life sciences czasopism. Jako jedna z głównych baz danych badawczych opracowanych przez National Center for Biotechnology Information (NCBI), PubMed Central to coś więcej niż repozytorium dokumentów. Zgłoszenia do PMC są indeksowane i formatowane pod kątem rozszerzonych metadanych , ontologii medycznej i unikalnych identyfikatorów, które wzbogacają ustrukturyzowane dane XML dla każdego artykułu. Treści w PMC można łączyć z innymi bazami danych NCBI i uzyskiwać do nich dostęp za pośrednictwem systemów wyszukiwania i pobierania Entrez , co dodatkowo zwiększa zdolność społeczeństwa do odkrywania, czytania i rozwijania wiedzy biomedycznej.

PubMed Central różni się od PubMed . PubMed Central to bezpłatne cyfrowe archiwum pełnych artykułów, dostępne dla każdego z dowolnego miejsca za pośrednictwem przeglądarki internetowej (z różnymi możliwościami ponownego wykorzystania). Z drugiej strony, chociaż PubMed jest przeszukiwania bazy danych biomedycznych cytatów i streszczeń, rezyduje w artykule pełnotekstowych gdzie indziej (w druku lub w Internecie, za darmo lub za abonenta paywall ).

W grudniu 2018 r. Archiwum PMC zawierało ponad 5,2 miliona artykułów, z wkładami pochodzącymi od wydawców lub autorów składających swoje rękopisy w repozytorium zgodnie z Polityką dostępu publicznego NIH . Z wcześniejszych danych wynika, że ​​od stycznia 2013 r. Do stycznia 2014 r. Depozyty zainicjowane przez autorów przekroczyły 103 000 artykułów w okresie 12 miesięcy. PMC identyfikuje około 4000 czasopism, które w pewnym stopniu uczestniczą w deponowaniu opublikowanych treści w repozytorium PMC. Niektórzy wydawcy opóźniają publikację swoich artykułów w PubMed Central o określony czas po publikacji, nazywany „okresem embarga”, wynoszący od kilku miesięcy do kilku lat, w zależności od czasopisma. (Najbardziej powszechne są embarga trwające od sześciu do dwunastu miesięcy). PubMed Central jest kluczowym przykładem „systematycznej dystrybucji zewnętrznej przez stronę trzecią”, która jest nadal zabroniona na mocy umów z współautorami wielu wydawców.

Przyjęcie

Uruchomione w lutym 2000 r. Repozytorium szybko się rozrosło, ponieważ Polityka dostępu publicznego NIH została zaprojektowana tak, aby wszystkie badania finansowane przez National Institutes of Health (NIH) były swobodnie dostępne dla każdego, a ponadto wielu wydawców współpracuje z NIH zapewnić swobodny dostęp do swoich dzieł. Pod koniec 2007 r. Ustawa o skonsolidowanych środkach budżetowych z 2008 r. (HR 2764) została podpisana i zawiera postanowienie zobowiązujące NIH do zmiany polityki i wymaga włączenia do PubMed Central kompletnych kopii elektronicznych ich recenzowanych badań i ustaleń z finansowanych przez NIH Badania. Artykuły te należy zamieścić w ciągu 12 miesięcy od publikacji. To pierwszy raz, kiedy rząd USA zażądał od agencji zapewnienia otwartego dostępu do badań i jest to ewolucja w stosunku do polityki z 2005 roku, w której NIH poprosił naukowców o dobrowolne dodanie swoich badań do PubMed Central.

Brytyjska wersja systemu PubMed Central, UK PubMed Central (UKPMC) , została opracowana przez Wellcome Trust i British Library jako część dziewięcioosobowej grupy brytyjskich sponsorów badań. System ten został uruchomiony w styczniu 2007 roku. 1 listopada 2012 roku stał się Europe PubMed Central . Kanadyjski członek sieci PubMed Central International, PubMed Central Canada , został uruchomiony w październiku 2009 roku.

National Library of Medicine "NLM Journal Publishing Tag Set" Journal artykuł język znaczników jest swobodnie dostępne. Association of Learned i Professional Society Publishers komentuje, że „ma szansę stać się standardem dla przygotowania materiałów naukowych dla obu książkach i czasopismach”. Powiązane DTD jest dostępne dla książek. Biblioteka Kongresu i Biblioteka Brytyjska zapowiedziały wsparcie dla NLM DTD. Jest również popularny wśród dostawców usług czasopism.

Wraz z wydaniem publicznych planów dostępu dla wielu agencji poza NIH, PMC jest w trakcie stania się repozytorium dla szerszej gamy artykułów. Obejmuje to treści NASA z interfejsem oznaczonym jako „PubSpace”.

Technologia

Artykuły są wysyłane do PubMed Central przez wydawców w formacie XML lub SGML , przy użyciu różnych DTD artykułów . Starsi i więksi wydawcy mogą mieć własne, wewnętrzne DTD, ale wielu z nich korzysta z NLM Journal Publishing DTD (patrz wyżej).

Otrzymane artykuły są konwertowane przez XSLT do bardzo podobnego NLM Archiving and Interchange DTD. Ten proces może ujawnić błędy, które są zgłaszane do wydawcy w celu poprawienia. Grafika jest również konwertowana do standardowych formatów i rozmiarów. Oryginalne i przekonwertowane formularze są archiwizowane. Przekonwertowana forma jest przenoszona do relacyjnej bazy danych wraz z powiązanymi plikami graficznymi, multimedialnymi lub innymi powiązanymi danymi. Wielu wydawców udostępnia również artykuły w formacie PDF , które są udostępniane bez zmian.

Cytaty bibliograficzne są analizowane i automatycznie łączone z odpowiednimi streszczeniami w PubMed, artykułami w PubMed Central i zasobami w witrynach internetowych wydawców. Linki PubMed również prowadzą do PubMed Central. Nierozwiązywalne odniesienia, takie jak czasopisma lub określone artykuły, które nie są jeszcze dostępne w jednym z tych źródeł, są śledzone w bazie danych i automatycznie włączają się, gdy zasoby stają się dostępne.

Wewnętrzny system indeksowania umożliwia wyszukiwanie i zna terminologię biologiczną i medyczną , taką jak nazwy leków generycznych i zastrzeżonych oraz nazwy alternatywne organizmów, chorób i części anatomicznych.

Gdy użytkownik uzyskuje dostęp do numeru czasopisma, automatycznie generowany jest spis treści poprzez pobranie wszystkich artykułów, listów, artykułów redakcyjnych itp. Dotyczących tego numeru. Kiedy osiągnięty zostanie rzeczywisty element, taki jak artykuł, PubMed Central konwertuje znaczniki NLM do formatu HTML w celu dostarczenia i udostępnia łącza do powiązanych obiektów danych. Jest to wykonalne, ponieważ różnorodność przychodzących danych została najpierw przekonwertowana na standardowe DTD i formaty graficzne.

W oddzielnym strumieniu zgłoszeń autorzy finansowani przez NIH mogą deponować artykuły w PubMed Central za pomocą NIH Manuscript Submission (NIHMS). Artykuły przesłane w ten sposób zazwyczaj przechodzą przez znaczniki XML w celu przekonwertowania ich na NLM DTD.

Przyjęcie

Reakcje społeczności wydawców na PubMed Central wahają się od autentycznego entuzjazmu niektórych do ostrożnej troski innych.

Chociaż PMC jest mile widzianym partnerem dla wydawców z otwartym dostępem, jeśli chodzi o jego zdolność do zwiększania odkrywania i rozpowszechniania wiedzy biomedycznej, ta sama prawda powoduje, że inni martwią się o przekierowanie ruchu z opublikowanej wersji rekordu , a także o konsekwencje ekonomiczne mniejszej liczby czytelników. jako wpływ na utrzymanie wspólnoty uczonych w społeczeństwach uczonych. Analiza z 2013 roku wykazała mocne dowody na to, że publiczne repozytoria opublikowanych artykułów były odpowiedzialne za „odciągnięcie znacznej liczby czytelników od stron internetowych czasopism” oraz że „efekt PMC narasta w czasie”.

Biblioteki, uniwersytety, zwolennicy otwartego dostępu, grupy obrońców zdrowia konsumentów i organizacje zajmujące się prawami pacjentów pochwaliły PubMed Central i mają nadzieję, że podobne repozytoria dostępu publicznego zostaną opracowane przez inne federalne agencje finansujące, aby swobodnie udostępniać wszelkie publikacje badawcze, które były wynikiem wsparcia podatników .

Badanie Antelmana nad publikacjami otwartego dostępu wykazało, że w filozofii, naukach politycznych, elektrotechnice i elektronice oraz matematyce publikacje otwartego dostępu miały większy wpływ badawczy. Randomizowane badanie wykazało wzrost liczby pobrań treści publikacji ogólnodostępnych, bez przewagi cytowań nad dostępem do subskrypcji rok po publikacji.

Polityka NIH i prace nad repozytoriami otwartego dostępu zainspirowały dyrektywę prezydencką z 2013 r., Która pobudziła działania również w innych agencjach federalnych.

W marcu 2020 PubMed Central przyspieszył procedury wpłaty pełnego tekstu publikacji na temat koronawirusa . NLM zrobił to na wniosek Biura Polityki Nauki i Technologii Białego Domu oraz międzynarodowych naukowców, aby poprawić dostęp naukowców, dostawców opieki zdrowotnej, innowatorów zajmujących się eksploracją danych , badaczy zajmujących się leczeniem sztucznej inteligencji i ogółu społeczeństwa.

PMCID

PMCID (identyfikator PubMed Central), znany również jako numer referencyjny PMC, jest identyfikatorem bibliograficznym bazy danych PubMed Central, podobnie jak PMID jest identyfikatorem bibliograficznym bazy danych PubMed . Te dwa identyfikatory są jednak różne. Składa się z „PMC”, po którym następuje ciąg siedmiu cyfr. Format to:

  • PMCID: PMC1852221

Autorzy ubiegający się o nagrody NIH muszą dołączyć do wniosku PMCID.

Zobacz też

Bibliografia

Linki zewnętrzne