R. Sankararamakrishnan - R. Sankararamakrishnan

Ramasubbu Sankararamakrishnan to indyjski biolog obliczeniowy, bioinformatyk i profesor na Wydziale Nauk Biologicznych i Bioinżynierii Indyjskiego Instytutu Technologii w Kanpur . Jest znany ze swoich badań obliczeniowych nad funkcją białek błonowych . Wydział Biotechnologii rządu Indii przyznał mu Narodowy nagrodę Bioscience rozwoju zawodowego , jednej z najwyższych indyjskich nagród naukowych, za jego wkład do nauk biologicznych w 2008 roku.

Biografia

Indyjski Instytut Nauki

Inhibitor rybonukleazy w kształcie podkowy (pokazany jako szkielet) tworzy interakcję białko-białko z białkiem rybonukleazy

R. Sankararamakrishnan, który ukończył wczesną edukację na Uniwersytecie Madurai Kamaraj w 1986 r., zrobił studia doktoranckie w Indyjskim Instytucie Nauki, a po uzyskaniu doktoratu w 1992 r. przeniósł się do Wielkiej Brytanii, gdzie prowadził badania podoktoranckie w zakresie biologia obliczeniowa na Uniwersytecie Oksfordzkim . Odbył kolejną pracę podoktorancką na Uniwersytecie Illinois w Urbana-Champaign i rozpoczął karierę w 1996 roku jako instruktor (później asystent profesora badań) w Icahn School of Medicine w Mount Sinai . W kwietniu 2002 r. wrócił do Indii, aby dołączyć do Indyjskiego Instytutu Technologii w Kanpur (IITK) jako adiunkt i jest profesorem na Wydziale Nauk Biologicznych i Bioinżynierii (BSBE). Następnie założył Laboratorium Bioinformatyki i Symulacji Biomolekularnej w IITK, gdzie gości kilku naukowców. Pełni również funkcję zasobu Centrum Biologii Matematycznej Wydziału Nauki i Techniki .

Spuścizna

Badania Sankaramakrishnana koncentrują się na mechanizmie funkcji białek błonowych przy użyciu metod obliczeniowych . Znany jest, że badania prowadzone na akwaporyna genów w roślinach, zwojów Asx , dynamicznych cząsteczkowej symulacji oddziaływania białko-białko , GPCR, hormonów peptydowych , a także nonAUG kodonów start AUG i kodony . Jego badania zostały udokumentowane szeregiem artykułów, a w internetowym repozytorium artykułów naukowych ResearchGate znajduje się 98 z nich. Poza tym napisał także rozdziały w książkach wydawanych przez innych, a jego artykuły były wielokrotnie cytowane. Jest współautorem MIPModDB , bazy danych modeli struktur głównych białek wewnętrznych . Wygłaszał również przemówienia na zaproszenie lub przemówienia na różnych seminariach krajowych i międzynarodowych.

Sankararamakrishnan jest członkiem National Network for Mathematical and Computational Biology, agencji finansowanej przez Radę ds. Badań Naukowych i Inżynieryjnych rządu Indii w celu promowania badań naukowych i zaawansowanych szkoleń w tej dyscyplinie. Jest także dożywotnim członkiem Narodowej Akademii Nauk w Indiach , jednej z trzech głównych indyjskich akademii naukowych.

Nagrody i wyróżnienia

Wydział Biotechnologii rządu Indii przyznał mu Narodowy nagrodę Bioscience rozwoju zawodowego , jednej z najwyższych indyjskich nagród naukowych w roku 2008. On również zajmował Joy Gill Chair profesora na Wydziale młodych i USV Krzesło profesury Instytutu Indyjskim of Technology, Kanpur odpowiednio w latach 2007-2010 i 2011-2014.

Wybrana bibliografia

Rozdziały

• Międzynarodowe Towarzystwo Biometryczne. Region Indii. Konferencja; R. Sankararamakrishnan (autor rozdziału) (2006). „Wyszukiwanie wzorców w sekwencjach białek i DNA” . Postępy statystyczne w naukach biologicznych i bioinformatyce . Sprzymierzeni wydawcy. s. 106–. Numer ISBN 978-81-7764-968-0.

Artykuły

• Iyer, Abhishek Hariharan; Kryszna Deepak, Rama Nagesh Venkata; Sankararamakrishnan, Ramasubbu (27 grudnia 2017). „Azoty imidazolowe dwóch reszt histydyny uczestniczących w wiązaniach wodorowych NH…N w strukturach białkowych: podejście bioinformatyki strukturalnej w połączeniu z obliczeniami chemicznymi kwantowymi”. Czasopismo Chemii Fizycznej B . 122 (3): 1205-1212. doi : 10.1021/acs.jpcb.7b11737 . ISSN  1520-6106 . PMID  29278913 .
• Kryszna Deepak, RNV; Chandrakar, Brijesh; Sankararamakrishnan, Ramasubbu (2017). „Porównanie siły wiązania metali między resztami metioniny i cysteiny: Implikacje dla projektowania motywów wiązania metali w białkach”. Chemia biofizyczna . 224 : 32–39. doi : 10.1016/j.bpc.2017.02.007 . PMID  28363089 .
• Kryszna Deepak, RNV; Sankararamakrishnan, Ramasubbu (12 lipca 2016). „N-H···N wiązania wodorowe z udziałem atomów azotu imidazolu histydyny: nowa rola strukturalna dla pozostałości histydyny w białkach” . Biochemia . 55 (27): 3774–3783. doi : 10.1021/acs.biochem.6b00253 . ISSN  0006-2960 . PMID  27305350 .

Zobacz też

Uwagi

Bibliografia

Dalsza lektura

• "Instytut Bioinformatyki" . www.bii.a-star.edu.sg . Źródło 9 stycznia 2018 .
• „Zastosowania symulacji molekularnych w biologii Struktura biomolekuł: przegląd” (wideo na YouTube) . Pokaz slajdów. 27 grudnia 2017 r . Źródło 11 stycznia 2018 .

Zewnętrzne linki

• Rudolfa Wernera (1998). Gap Junctions: Materiały z 8. Międzynarodowej Konferencji Gap Junction, Key Largo, Floryda . IOS Naciśnij. s. 71–. Numer ISBN 978-90-5199-374-5.
• Biologia molekularna receptora . Elsevier. 22 marca 1995. s. 427-. Numer ISBN 978-0-08-053644-6.