Nić kodująca - Coding strand
Odnosząc się do transkrypcji DNA, The nici kodującej (lub informacyjnej nici ) jest DNA, nić, której podstawa sekwencja jest identyczna z sekwencją zasad RNA transkryptu wytworzonego (choć z tyminę zastępuje uracyl ). To właśnie ta nić zawiera kodony , podczas gdy nić niekodująca zawiera antykodony . Podczas transkrypcji RNA Pol II wiąże się z niekodującą nicią matrycy , odczytuje antykodon i dokonuje transkrypcji ich sekwencji, aby zsyntetyzować transkrypt RNA z komplementarnymi zasadami.
Zgodnie z konwencją, nić kodująca to nić używana do prezentacji sekwencji DNA. Jest prezentowany w kierunku od 5' do 3' .
Wszędzie tam, gdzie w cząsteczce DNA występuje gen , jedna nić jest nicią kodującą (lub nicią sensowną ), a druga jest nicią niekodującą (zwaną także nicią antysensowną, nicią antykodującą, nicią matrycową lub nicią transkrybowaną ).
Nici w bańce transkrypcji
Podczas transkrypcji , polimeraza RNA odwija krótki odcinek DNA podwójnej helisy w pobliżu początku genu (względem miejsca startu transkrypcji). Ta odwinięta sekcja jest znana jako bańka transkrypcyjna . Polimeraza RNA, a wraz z nią bańka transkrypcyjna, wędruje wzdłuż nici niekodującej w kierunku przeciwnym, 3' do 5', jak również polimeryzuje nowo zsyntetyzowaną nić w kierunku 5' do 3' lub w dół . Podwójna helisa DNA jest przewijana przez polimerazę RNA z tyłu bańki transkrypcyjnej. Podobnie jak w przypadku dwóch sąsiednich zamków, gdy są ściągnięte razem, rozpinają się i ponownie zapinają, gdy poruszają się w określonym kierunku. Różne czynniki mogą powodować pękanie dwuniciowego DNA; w ten sposób zmienić kolejność genów lub spowodować śmierć komórki.
Hybryda RNA-DNA
Tam, gdzie helisa jest rozwinięta, nić kodująca składa się z niesparowanych zasad, podczas gdy nić matrycowa składa się z kompozytu RNA:DNA, po którym następuje pewna liczba niesparowanych zasad z tyłu. Ta hybryda składa się z ostatnio dodanych nukleotydów transkryptu RNA, komplementarnych sparowanych zasad z nicią matrycową. Liczba par zasad w hybrydzie jest badana, ale sugerowano, że hybryda jest utworzona z ostatnich 10 dodanych nukleotydów.
Zobacz też
Bibliografia
Bibliografia
- Griffiths, AJF; i in. (2005). Wprowadzenie do analizy genetycznej (wyd. 8). WH Freemana. Numer ISBN 0-7167-4939-4.
- Lewin, B. (2000). Geny VII . Nowy Jork: Oxford University Press. Numer ISBN 0-19-879277-8.