TCF12 - TCF12

TCF12
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	2KNH , 4JOL
Identyfikatory
Skróty	TCF12 , CRS3, HEB, HTF4, HsT17266, bHLHb20, TCF-12, czynnik transkrypcyjny 12, p64
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 600480 MGI : 101877 HomoloGene : 40774 Karty genowe : TCF12
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 15 (człowiek)
Kończyć się	57 299 281 pb
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 9 (mysz)
Kończyć się	72 111 871 pz
Wzór ekspresji RNA
	Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• wiążące DNA ; • Białko Aktywność dimeryzacji ; • aktywność homodimeryzację białka ; • GO: 0001131 GO: 0001151 GO: 0001130 GO: 0001204 DNA aktywności wiązania czynnika transkrypcji ; • domena wiążąca pole HMG ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213 , GO:0001211, GO:0001205 Aktywność aktywatora transkrypcji wiązania DNA, swoiste dla polimerazy RNA II ; • wiązanie czynnika transkrypcyjnego ; • GO:0000980 wiązanie DNA specyficzne dla sekwencji regionu cis-regulatora RNA polimerazy II ; • wiązanie czynnika transkrypcyjnego bHLH ; • wiązanie E-box ; • GO: białko wiążące 0001948 ; • aktywność heterodimeryzacji białko ; • SMAD wiązania ; • element odpowiedzi na cAMP wiążącego ; • GO: 0001200, 0001133,: GO GO: 0001201 DNA aktywności wiązania czynnika transkrypcji RNA polimerazy II-specyficzne;
Składnik komórkowy	• cytoplazma ; • transkrypcji regulator kompleks ; • RNA polimerazy II regulator transkrypcji kompleks ; • jądro ; • plamka atomowej ; • wewnątrzkomórkowego organellum ograniczonym membraną ; • nukleoplazmą;
Proces biologiczny	• różnicowanie komórek ; • regulacja transkrypcji na podstawie DNA ; • regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • rozwój narządów mięśni ; • transkrypcja na podstawie DNA ; • rozwój układu nerwowego ; • rozwój organizmu wielokomórkowego ; • pozytywna regulacja transkrypcji na podstawie DNA ; • pozytywna regulacja ekspresja genów ; • pozytywna regulacja różnicowania neuronów ; • odpowiedź immunologiczna ; • pozytywna regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • transkrypcja przez polimerazę RNA II ; • regulacja różnicowania krwiotwórczych komórek macierzystych;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	6938
	21406
	ENSG00000140262
	ENSMUSG00000032228
	Q99081
	Q61286
NM_001306219 ; NM_001306220 ; NM_003205 ; NM_207036 ; NM_207037;
	NM_207038 ; NM_207040 ; NM_001322151 ; NM_001322152 ; NM_001322154 ; NM_001322156 ; NM_001322157 ; NM_001322158 ; NM_001322159 ; NM_001322161 ; NM_001322162 ; NM_001322164 ; NM_001322165
	NM_001253862 ; NM_001253863 ; NM_001253864 ; NM_001253865 ; NM_011544
NP_001293148 ; NP_001293149 ; NP_001309080 ; NP_001309081 ; NP_001309083;
	NP_001309085 ; NP_001309086 ; NP_001309087 ; NP_001309088 ; NP_001309090 ; NP_001309091 ; NP_001309093 ; NP_001309094 ; NP_003196 ; NP_996919 ; NP_996920 ; NP_996921 ; NP_996923
	NP_001240791 ; NP_001240792 ; NP_001240793 ; NP_001240794 ; NP_035674
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Czynnik transkrypcyjny 12 to białko, które u ludzi jest kodowane przez gen TCF12 .

Białko kodowane przez ten gen jest członkiem rodziny podstawowych białek E typu basic helisa-loop-helix (bHLH), które rozpoznaje miejsce wiązania konsensusu (E-box) CANNTG. To kodowane białko ulega ekspresji w wielu tkankach, między innymi w mięśniach szkieletowych, grasicy, komórkach B i T, i może uczestniczyć w regulacji ekspresji genów specyficznych dla linii poprzez tworzenie heterodimerów z innymi białkami E bHLH. Opisano kilka wariantów transkrypcyjnych tego genu po alternatywnym splicingu, ale nie ustalono pełnej długości charakteru niektórych z tych wariantów. TCF12 został spekulatywnie powiązany z ludzką seksualnością mężczyzn poprzez badanie GWAS wskazujące na związek z powiązanym polimorfizmem pojedynczego nukleotydu . Mutacje w tym genie powiązano również z przypadkami kraniosynostozy wieńcowej .

TCF12 jest głównym heterodimeryzującym partnerem TCF21 , genu supresorowego guza i celem aktywności SRY / SOX9 .

Bibliografia

Dalsza lektura

Bain G, Murre C (kwiecień 1998). „Rola białek E w rozwoju limfocytów B i T”. Seminaria z Immunologii . 10 (2): 143-53. doi : 10.1006/smim.1998.0116 . PMID 9618760 .
Hu JS, Olson EN, Kingston RE (marzec 1992). „HEB, białko helisa-pętla-helisa spokrewnione z E2A i ITF2, które może modulować zdolność wiązania DNA miogenicznych czynników regulacyjnych” . Biologia molekularna i komórkowa . 12 (3): 1031–42. doi : 10.1128/MCB.12.3.1031 . PMC 369535 . PMID 1312219 .
Zhang Y, Bina M (1992). „Sekwencja nukleotydowa cDNA ludzkiego czynnika transkrypcyjnego HTF4a”. Sekwencja DNA . 2 (6): 397-403. doi : 10.3109/10425179209020819 . PMID 1446075 .
Zhang Y, Doyle K, Bina M (wrzesień 1992). „Interakcje HTF4 z motywami E-box w długich powtórzeniach końcowych ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1” . Czasopismo Wirusologii . 66 (9): 5631–4. doi : 10.1128/JVI.66.9.5631-5634.1992 . PMC 289128 . PMID 1501295 .
Sommer L, Hagenbüchle O, Wellauer PK, Strubin M (listopad 1991). „Kierowanie jądrowe czynnika transkrypcyjnego PTF1 odbywa się za pośrednictwem podjednostki białkowej, która nie wiąże się z sekwencją pokrewną PTF1”. Komórka . 67 (5): 987–94. doi : 10.1016/0092-8674(91)90371-5 . PMID 1720355 . S2CID 1315068 .
Zhang Y, Flejter WL, Barcroft CL, Rivière M, Szpirer J, Szpirer C, Bina M (1995). „Lokalizacja ludzkiego genu czynników transkrypcyjnych HTF4 4 (TCF12) do chromosomu 15q21”. Cytogenetyka i Genetyka Komórkowa . 68 (3-4): 235-8. doi : 10.1159/000133921 . PMID 7842744 .
Doyle K, Zhang Y, Baer R, Bina M (kwiecień 1994). „Rozróżnialne wzory oddziaływań białko-DNA obejmujących kompleksy podstawowych białek helisa-pętla-helisa” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 269 (16): 12099–105. doi : 10.1016/S0021-9258(17)32686-8 . PMID 8163514 .
Langlands K, Yin X, Anand G, Prochownik EV (sierpień 1997). „Różnicowe oddziaływania białek Id z czynnikami transkrypcyjnymi basic-helix-loop-helix” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 272 (32): 19785-93. doi : 10.1074/jbc.272.32.19785 . PMID 9242638 .
Goldfarb AN, Lewandowska K, Pennell CA (styczeń 1998). „Identyfikacja wysoce konserwatywnego modułu w białkach E wymaganego do dimeryzacji helisa-pętla-helisa in vivo” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 273 (5): 2866-73. doi : 10.1074/jbc.273.5.2866 . PMID 9446597 .
Massari ME, Rivera RR, Voland JR, Quong MW, Breit TM, van Dongen JJ, et al. (czerwiec 1998). „Charakterystyka ABF-1, nowego podstawowego czynnika transkrypcyjnego helisa-pętla-helisa wyrażanego w aktywowanych limfocytach B” . Biologia molekularna i komórkowa . 18 (6): 3130–9. doi : 10.1128/mcb.18.6.3130 . PMC 108895 . PMID 9584154 .
Adell T, Gómez-Cuadrado A, Skoudy A, Pettengill OS, Longnecker DS, Real FX (marzec 2000). „Rola podstawowego czynnika transkrypcyjnego helisa-loop-helix p48 w fenotypie różnicowania komórek zewnątrzwydzielniczego raka trzustki”. Wzrost i różnicowanie komórek . 11 (3): 137–47. PMID 10768861 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonowanie DNA przy użyciu rekombinacji miejscowo-specyficznej in vitro” . Badania genomu . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W i in. (marzec 2001). „W kierunku katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych kompletnych białek kodujących ludzkie cDNA” . Badania genomu . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 . PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (wrzesień 2000). „Systematyczna lokalizacja subkomórkowa nowych białek zidentyfikowanych przez sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Raporty EMBO . 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-raporty/kvd058 . PMC 1083732 . PMID 11256614 .
Mandolesi G, Gargano S, Pennuto M, Illi B, Molfetta R, Soucek L, et al. (styczeń 2002). „Zależna od NGF i specyficzna tkankowo transkrypcja vgf jest regulowana przez interakcję CREB-p300 i czynnika bHLH”. Listy FEBS . 510 (1–2): 50–6. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03227-6 . PMID 11755530 . S2CID 19201396 .
Knöfler M, Meinhardt G, Bauer S, Loregger T, Vasicek R, Bloor DJ i in. (luty 2002). "Human Hand1 basic helix-loop-helix (bHLH) białko: pozaembrionalny wzór ekspresji, partnerzy interakcji i identyfikacja jego domen represorowych transkrypcji" . Czasopismo Biochemiczne . 361 (Pt 3): 641-51. doi : 10.1042/0264-6021:3610641 . PMC 1222348 . PMID 11802795 .
Tremblay M, Herblot S, Lecuyer E, Hoang T (kwiecień 2003). „Regulacja ekspresji genu pT alfa przez dawkowanie E2A, HEB i SCL” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 278 (15): 12680-7. doi : 10.1074/jbc.M209870200 . PMID 12566462 .

Zewnętrzne linki

FactorBook TCF12

Ten artykuł o genie na ludzkim chromosomie 15 to skrót . Możesz pomóc Wikipedii, rozwijając ją .

Languages

In other projects

TCF12 - TCF12

Bibliografia

Dalsza lektura

Zewnętrzne linki