Zgodnie z ustaleniami i upoważnieniem Rady Państwa biuro zajmuje się odpowiednimi przygotowaniami do negocjacji i porozumień z tym, co Chiny kontynentalne nazywają „władzami Tajwanu” (tj. rządem Republiki Chińskiej i upoważnionymi przez niego organizacjami rządowymi). Agencja administruje i koordynuje bezpośrednie powiązania w poczcie, transporcie i handlu przez Cieśninę Tajwańską , zajmuje się mediami i pracą reklamową związaną z Tajwanem, cenzuruje i publikuje wiadomości i informacje dotyczące spraw tajwańskich oraz zajmuje się poważnymi incydentami związanymi z Tajwanem.
Tajwańska Rada ds. Spraw jest również odpowiedzialna za koordynację z ogólnym planowaniem stosunków gospodarczych i handlowych związanych z Tajwanem oraz wymian i współpracy w takich dziedzinach jak finanse, kultura, badania naukowe , sport, nauka i technologia, zdrowie i inne z zainteresowanymi wydziałami . Zarządza również wymianą personelu, obserwacjami i sympozjami między obiema stronami oraz odpowiednią pracą na międzynarodowych konferencjach z udziałem Tajwanu.
Członkowie Biura ds. Tajwanu są jednocześnie członkami Komitetu Centralnego Komunistycznej Partii Chin i Biura Zadaniowego Tajwanu. Ten ostatni tytuł jest używany w kontaktach z urzędnikami na Tajwanie na zasadzie „party-to-party”.