MAPY LIPIDOWE - LIPID MAPS

LIPID MAPS (Lipid Metabolites and Pathways Strategy) to portal internetowy zaprojektowany jako brama do zasobów Lipidomiki . Zasób ten zainicjował klasyfikację biologicznych lipidów , dzieląc je na osiem ogólnych kategorii. LIPID MAPS zapewnia wystandaryzowane metodologie analizy lipidów metodą spektrometrii mas, np

LIPID MAPS jest cytowany jako dowód rosnącego uznania dla badań metabolizmu lipidów oraz szybkiego rozwoju i standaryzacji dziedziny lipidomiki

Kluczowe zasoby LIPID MAPS obejmują:

• LIPID MAPS Structure Database (LMSD) - baza danych struktur i adnotacji biologicznie istotnych lipidów, zawierająca ponad 44 000 różnych lipidów. Artykuł opisujący to źródło był, według PubMed , cytowany ponad 200 razy.
• LIPID MAPS In-Silico Structure Database (LMISSD) - baza danych przewidywanych obliczeniowo lipidów generowanych przez rozszerzenie grup czołowych dla powszechnie występujących klas lipidów
• LIPID MAPS Gene / Proteome Database (LMPD) - baza genów i produktów genów zaangażowanych w metabolizm lipidów

Narzędzia dostępne w LIPID MAPS umożliwiają naukowcom identyfikację prawdopodobnych lipidów w ich próbkach na podstawie danych ze spektrometrii mas , co jest powszechną metodą analizy lipidów w próbkach biologicznych. W szczególności LipidFinder umożliwia analizę danych MS. Na stronie dostępne są również samouczki i materiały edukacyjne dotyczące lipidów.

W styczniu 2020 LIPID MAPS stał się usługą ELIXIR .

Historia

LIPID MAPS została założona w 2003 roku dzięki dofinansowaniu z NIH . Od 2016 roku jest to wspólny projekt Uniwersytetu w Cardiff kierowany przez prof. Valerie O'Donnell, Instytut Babraham pod kierownictwem Michaela Wakelama oraz naukowców z UCSD Shankara Subramaniama i Eda Dennisa, finansowany przez Wellcome Trust . Nekrolog Wakelama opisuje LIPID MAPS jako ujednolicenie dziedziny lipidomiki.

LIPID MAPS jest sponsorowany przez Avanti Polar lipids i Cayman Chemicals

Bibliografia