Lista baz danych neuronauki - List of neuroscience databases

Dostępnych jest wiele internetowych baz danych neuronaukowych, które dostarczają informacji dotyczących ekspresji genów , neuronów , makroskopowej struktury mózgu oraz zaburzeń neurologicznych lub psychiatrycznych . Niektóre bazy danych zawierają dane opisowe i liczbowe, inne dotyczące funkcji mózgu, inne oferują dostęp do „surowych” danych obrazowania, takich jak pośmiertne sekcje mózgu lub obrazy 3D MRI i fMRI . Niektóre skupiają się na ludzkim mózgu, inne na nie-ludziach.

Wraz ze wzrostem liczby baz danych, które dążą do rozpowszechniania informacji o budowie, rozwoju i funkcji mózgu, rośnie potrzeba samodzielnego zestawiania tych zasobów. W rezultacie istnieją obecnie bazy danych neuronauki, z których niektóre sięgają ponad 3000 wpisów.

Bazy danych neuronauki

Nazwa Opis Organizm Poziom (gen, neuron, makroskopowy) Dane (MRI, fMRI, obrazy, opisowe, numeryczne) Nieład Zarejestruj się, aby wyświetlić dane? Nr ref.
Atlas mózgu Allena Atlas, wybarwione skrawki mózgu wykazujące rozwój i ekspresję genów Mysz, Człowiek Makroskopowy, Gene Obrazy Zdrowy Nie
Inicjatywa Neuroobrazowania w Chorobie Alzheimera (ADNI) Obrazy strukturalne MRI Człowiek Makroskopijny Zbiory danych MRI Zdrowe i choroba Alzheimera tak
Duży mózg Rekonstrukcja 3D całego mózgu z wycinków histologicznych barwionych na ciele komórki przy izotropowej rozdzielczości 20 mikronów Człowiek Mikroskopijny Obrazy Zdrowy Nie
BIRN fMRI i dane MRI fMRI, MRI skany i atlasy mózgów ludzi i myszy Mysz, Człowiek Wielopoziomowe: regiony mózgu, połączenia, neurony, wzorce ekspresji genów Zbiory danych MRI, zbiory danych fMRI Zdrowe, Starsze Nie
Baza danych neuroobrazowania zaburzeń afektywnych dwubiegunowych Metaanaliza i baza danych badań MRI Człowiek Makroskopijny Opisowe, liczbowe Zaburzenie afektywne dwubiegunowe Nie
System zarządzania architekturą mózgu Zasoby online zawierające informacje o obwodach neuronowych Szczur, mysz, człowiek Wielopoziomowe: regiony mózgu, połączenia, neurony, wzorce ekspresji genów Opisowe, liczbowe Zdrowy Nie
Chmura mózgu Ekspresja genów w korze przedczołowej człowieka Człowiek Wzorce ekspresji genów Opisowe, liczbowe Zdrowy Nie
Mózg-KOD Multimodalna platforma obejmująca różne zaburzenia dla zintegrowanych badań i danych z dziedziny neuronauki prowadzona przez Ontario Brain Institute . Człowiek, zwierzę Multimodalne zbiory danych (kliniczne, obrazowe, molekularne itp.) Opisowe, numeryczne, obrazowe, molekularne, genetyka Neurorozwojowy, mózgowy porażenie dziecięce, epilepsja, depresja, neurodegeneracja, wstrząs mózgu tak
Brain-Development.org Obrazy strukturalne MRI i atlasy Człowiek Makroskopijny Zbiory danych MRI Płody, zdrowe i przedwcześnie urodzone noworodki tak
Braingraph.org Wykresy mózgów obliczone na podstawie danych projektu Human Connectome Project Człowiek Makroskopowo, do 1015 węzłów grafy skierowane i nieskierowane w formacie GraphML z anatomicznie adnotacjami Zdrowy Nie
Informacje o mózgu Atlas, schematyczny atlas Macaca fascicularis Makak Makroskopijny Schematyczne obrazy Zdrowy tak
Platforma interfejsu maszyny mózgowej Różne rodzaje danych związanych z interfejsem maszyny mózgowej Człowiek, Małpa Makroskopowy, Neuron Obrazy, numeryczne Zdrowy Nie
BrainMap.org baza współrzędnych fMRI Człowiek Makroskopijny Opisowy Zdrowy tak
MózgMapy Atlas, poplamione sekcje mózgów w wysokiej rozdzielczości Człowiek, naczelne i inne niż naczelne (w sumie 14 gatunków) Neuron i makroskopowe Obrazy Zdrowy Nie
Portal danych Mózg/UMYSŁY Atlas, skany MRI in-vivo i ex-vivo, zapisy ECoG Marmozeta zwyczajna, człowiek Makroskopijny Obrazy Zdrowy Nie
Baza danych Brede baza współrzędnych fMRI i PET Człowiek Makroskopijny Opisowy Zdrowy Nie
Brainmuseum.org / MSU Bank Bioróżnorodności Mózgu Atlas, wybarwione skrawki mózgu i obrazy MRI Człowiek i 62 inne gatunki Makroskopijny Obrazy Zdrowy Nie
Mózgomika/lokalizator Skany fMRI i MRI, dane behawioralne Człowiek Makroskopijny Obrazy, numeryczne Zdrowy Nie
Atlas podkorowy Caltech Skany MRI Człowiek Makroskopijny MRI Zdrowy Nie
Cambridge Centre for Aging and Neuroscience (Cam-CAN) Dane MRI, fMRI, MEG dla ~700 zdrowych osób dorosłych w wieku 18-88 lat Człowiek Makroskopijny Obrazy, opisowe, liczbowe Zdrowy Nie
Archiwum Obrazowania Nowotworów Obrazowanie MRI, CT i PET pacjentów onkologicznych wraz z potwierdzającymi danymi klinicznymi (w wielu przypadkach) Człowiek Makroskopijny Obrazy, opisowe, liczbowe Nowotwór Nie
Baza danych transkryptomów rozwoju móżdżku Atlas, wybarwione wycinki z mózgów myszy ukazujące rozwój móżdżku i ekspresję genów Mysz Makroskopowy, Gene Obrazy Zdrowy Nie
Wspólne badania w neuronauce obliczeniowej CRCNS.org Wiele rodzajów wyników neuronaukowych, które są istotne dla modelowania Człowiek i kilka innych gatunków Wieloskalowy Pociągi z kolcami, LFP, MUA, MRI Zdrowy tak
Baza danych do eksperymentów i modeli (DREAM) Dotarcie do danych (behawioralne, uogólniające, adaptacyjne, uczące się, skokowe, fMRI, niepewność) Człowiek i małpa Makroskopijny Kinematyka, Spike, fMRI Zdrowy tak
Centrum danych fMRI Zbiory danych fMRI z opublikowanych badań Człowiek Makroskopijny zbiory danych fMRI Zdrowy tak
Projekt GLIMPS (obrazowanie glukozy w zespołach parkinsonowskich) Międzynarodowa baza danych chorób neurodegeneracyjnych skanów FDG-PET Człowiek Makroskopijny Obrazy FDG-PET choroba Parkinsona (PD), choroba Alzheimera (AD), zanik wieloukładowy (MSA), postępujące porażenie nadjądrowe (PSP) itp. tak
Portal hipokampowy Obwody, typy neuronowe, elektrofizjologia Dorosły człowiek Neuron Morfologia komórki, elektrofizjologia, budowa regionu, łączność Zdrowy tak
Międzynarodowa Baza Elektrofizjologii Padaczki (IEEG.org) EEG, metadane, obrazowanie, adnotacje na danych Modele epilepsji u ludzi i zwierząt EEG, pola lokalne, mikro-ECoG Elektrofizjologia Niezdrowe, kilka zdrowych tak
Międzynarodowa inicjatywa udostępniania danych neuroobrazowania (INDI) Dane o łączności funkcjonalnej z wielu różnych grup Bezkręgowce (w sumie 47 gatunków) Makroskopijny Łączność funkcjonalna Zdrowe, niezdrowe tak
Platforma mózgu bezkręgowców Zdjęcia rozwarstwień układu nerwowego bezkręgowców Bezkręgowce (w sumie 47 gatunków) Makroskopijny Zdjęcia Zdrowy Nie
Fantom ludzki in vivo Dane MRI o ultrawysokiej rozdzielczości pojedynczego uczestnika, w tym angiografia 150 μm ToF, 250 μm T1 ważona MPRAGE, 330 μm QSM, 450 μm T2 ważona TSE, 800 μm DTI, ciągła godzina 1,8 mm rs-fMRI i dane strukturalne zebrane przez więcej niż dekada Człowiek Mezoskopowe MRI strukturalne z różnymi kontrastami, MRI mikrostrukturalne i funkcjonalne MRI Zdrowy Nie
Atlas JuBrain Probabilistyczne cytoarchitektoniczne mapy 3D ludzkiego mózgu Człowiek Mezoskopowe Strukturalny Zdrowy Nie
Kymata Atlas Atlas funkcjonalny ludzkiej kory mózgowej Człowiek Makroskopijny Funkcjonalny Zdrowy Nie
Baza danych neuroobrazowania głównych zaburzeń depresyjnych Metaanaliza i baza danych badań MRI Człowiek Makroskopijny Opisowe, liczbowe Ciężkie zaburzenie depresyjne Nie
Atlas genów marmozety Ekspresja genów w całym mózgu marmozety pospolitej Marmozeta zwyczajna Makroskopowy, Gene Obrazy Zdrowy Nie
Biblioteka mózgu myszy Atlas, poplamione skrawki mózgów myszy Mysz Makroskopijny Obrazy Zdrowy Nie
NeuroDane Zbiory danych wolumetrycznych, atlasy i badania konektomiczne Wiele Wieloskalowy Obrazy (3D, 4D) Różny Nie
Neuroelectro.org Elektrofizjologia neuronów Człowiek, inni Neuron Właściwości i dane elektrofizjologiczne Zdrowy Nie
Neuromorpho.org Modele 3D prawdziwych neuronów Człowiek, szczur , mysz , małpa , inne Neuron Obrazy i dane 3D Zdrowy Nie
Neuromorfometria.pl Ręcznie oznaczone MRI Brain Scans Człowiek Makroskopijny MRI T1 ważone, oznaczone objętości Zdrowy Nie
NeuronDB Baza danych właściwości i klasyfikacji neuronów Człowiek Neuron Opisowy Zdrowy Nie
Neuroimaging Tools and Resources Collaboratory (NITRC) Nagradzana bezpłatna współpraca z ponad 1000 neuroinformatycznych narzędzi programowych, zestawami danych obrazowania i zasobami społeczności, w tym forami i wydarzeniami. Człowiek, mysz, szczur, inne Mikroskopowe, makroskopowe Zbiory danych Zdrowi i chorzy Nie
Seria badań obrazowania otwartego dostępu (OASIS) Obrazy strukturalne MRI Człowiek Makroskopijny Zbiory danych MRI Zdrowe i choroba Alzheimera tak
Otwórz projekt połączenia Baza danych różnych struktur obwodów i zestawów danych neuroobrazowania, w tym zestawów danych wolumetrycznych, atlasów i badań konektomicznych Człowiek, mysz, nietoperz, danio pręgowany, owad, inne Wielopoziomowe: regiony mózgu, połączenia, neurony, wzorce ekspresji genów Obrazy i dane 3D Zdrowy Nie
OpenNeuro Duży i zróżnicowany zbiór surowych danych z różnych badań naukowych rozpowszechnianych na podstawie liberalnych licencji ( CC0 i CC-BY ). Wszystkie zbiory danych są sformatowane zgodnie z tym samym formatem ( Brain Imaging Data Structure ) i są dostępne za pośrednictwem Amazon S3 . Człowiek Makroskopijny Funkcjonalne, strukturalne, dyfuzyjne MRI i zestawy danych magnetoencefalografii Zdrowe i różne choroby Nie
Otwórz archiwum MEG (OMEGA) Magnetoencefalografia , zestawy danych MRI strukturalne i dane demograficzne Człowiek Makroskopijny Zbiory danych MEG, T1 MRI, dane demograficzne Zdrowe, ADHD , Pourazowe uszkodzenie mózgu tak
Repozytorium BÓLU Zestawy danych strukturalnych, dyfuzyjnych i funkcjonalnych MRI Człowiek Ludzki makroskopowy Zbiory danych MRI i metadane Zdrowe i bólowe warunki tak
Atlas mózgu świni Pig Brain Atlas to trójwymiarowy uśredniony mózg i atlas nowonarodzonych prosiąt (Sus scrofa) oparty na MRI. Świnia (Sus scrofa) Makroskopijny MRI strukturalne Zdrowy tak
Baza danych typów komórek naczelnych PrimateDatabase.com, publicznie dostępne archiwum wewnątrzkomórkowych nagrań patch clamp i bardzo szczegółowych trójwymiarowych cyfrowych rekonstrukcji morfologii neuronów. Naczelne inne niż człowiek i człowiek Neuron Elektrofizjologia, morfologia i rekonstrukcje trójwymiarowe Zdrowy Nie
SchizConnect SchizConnect to otwarta, publiczna wirtualna baza danych do wyszukiwania i pobierania obrazów neuroobrazowania schizofrenii (MRI) i powiązanych danych. Człowiek Makroskopijny Zestawy danych MRI strukturalnego, dyfuzyjnego i funkcjonalnego, oceny poznawcze i kliniczne Schizofrenia (+ rodzeństwo), choroba afektywna dwubiegunowa, kontrola (+ rodzeństwo) tak
Świątynia EEG Baza danych Ponad 30 000 klinicznych zapisów EEG i towarzyszących im raportów neurologa Człowiek Makroskopijny EEG Zdrowe i różne choroby tak
Zestaw danych rezonansu magnetycznego całego mózgu o ultrawysokiej rozdzielczości T1-ważonych Dane MR T1 ważone uzyskane przy użyciu prospektywnej korekcji ruchu w ultrawysokiej rozdzielczości izotropowej 250 µm. Człowiek Mezoskopowe Zestaw danych MRI strukturalnego, w tym dane surowe do przetworzonych skanera Zdrowy Nie
UNC-Wisconsin Neurodevelopment Baza danych Rhesus MRI Obrazy MRI strukturalne i dyfuzyjne w przestrzeni natywnej i Atlas Space Makak Makroskopijny Zbiory danych MRI Zdrowy Nie
Atlas całego mózgu Atlas, strukturalne obrazy MRI i obrazy PET Człowiek Makroskopijny Obrazy Zdrowe i różne choroby Nie
NeuroVault Bezprogowe mapy statystyczne z badań MRI i PET. Człowiek Makroskopijny Obrazy Zdrowe i różne choroby Nie

Bazy danych neuronaukowych baz danych

Nazwa Opis Organizm Poziom (gen, neuron, makroskopowy) Dane (MRI, fMRI, obrazy, opisowe, numeryczne) Nieład Zarejestruj się, aby wyświetlić dane? Nr ref.
Ramy informacyjne neuronauki Metabaza danych istotnych dla neuronauki obejmująca ponad 100 baz danych. Człowiek, mysz, szczur, robak Mikroskopowe, makroskopowe Zbiory danych Zdrowi i chorzy Nie

Agregatory artykułów o neuronauce

Kanał neuronauki w RightRelevance.

Zobacz też

Bibliografia