Małe RNA - Small RNA
Małe RNA to polimeryczne cząsteczki RNA o długości mniejszej niż 200 nukleotydów i zwykle niekodujące . Wyciszanie RNA jest często funkcją tych cząsteczek, a najczęstszym i dobrze zbadanym przykładem jest interferencja RNA (RNAi), w której ulegający endogennej ekspresji mikroRNA (miRNA) lub egzogennie wyprowadzony mały interferujący RNA (siRNA) indukuje degradację komplementarnego informacyjnego RNA . Zidentyfikowano inne klasy małego RNA, w tym RNA oddziałujący z piwi (piRNA) i jego podgatunki powtarzają związane z nim małe interferujące RNA (rasiRNA). Mały RNA „nie jest w stanie wywoływać samego RNAi, a aby wykonać zadanie, musi tworzyć rdzeń kompleksu RNA-białko zwanego kompleksem wyciszającym indukowanym RNA (RISC), w szczególności z białkiem Argonaute”.
Małe RNA zostały wykryte lub zsekwencjonowane za pomocą szeregu technik, w tym bezpośrednio poprzez sekwencjonowanie MicroRNA na kilku platformach sekwencjonowania lub pośrednio poprzez sekwencjonowanie i analizę genomu. Identyfikacja miRNA została oceniona w wykrywaniu chorób człowieka, takich jak rak piersi. Ekspresję miRNA komórek jednojądrzastych krwi obwodowej (PBMC) badano jako potencjalny biomarker dla różnych zaburzeń neurologicznych, takich jak choroba Parkinsona , stwardnienie rozsiane . Ocena małego RNA jest przydatna w niektórych rodzajach badań, ponieważ jego cząsteczki „nie muszą być fragmentowane przed przygotowaniem biblioteki”.
Rodzaje małych RNA obejmują:
- mikroRNA (miRNA)
- RNA oddziałujące z Piwi (piRNA)
- małe interferujące RNA (siRNA)
- małe jądrowe RNA (snRNA), powszechnie określane również jako U-RNA
- małe jąderkowe RNA (snoRNA)
- małe RNA pochodzące z rDNA (srRNA)
- małe RNA pochodzące z tRNA (tsRNA)
W roślinach
Pierwszą znaną funkcję w roślinach odkryto u mutantów Arabidopsis . W szczególności ze spadkiem mutacji funkcji dla polimerazy RNA zależnej od RNA i produkcji podobnej do DICER . To osłabienie w rzeczywistości zwiększyło odporność Arabidopsis na Heterodera schachtii i Meloidogyne javanica . Podobnie, mutanty o obniżonej funkcji Argonaute - ago1-25 , ago1-27 , ago2-1 oraz połączone mutanty z ago1-27 i ago2-1 - miały większą odporność na Meloidogyne incognita . W sumie wskazuje to na dużą zależność pasożytnictwa nicieni od własnych małych RNA roślin.
Bibliografia
 |
Ten artykuł dotyczący mikrobiologii jest skrótem . Możesz pomóc Wikipedii, rozwijając ją . |