Transporter związany z przetwarzaniem antygenu - Transporter associated with antigen processing

Transporter związany z kompleksem białkowym do przetwarzania antygenu ( TAP ) należy do rodziny transporterów kasetowych wiążących ATP . Zapewnia peptydów do cytozolu do siateczki śródplazmatycznej (ER), gdzie wiążą się one z pojawiającego się z MHC klasy I cząsteczek.

Struktura TAP składa się z dwóch białek: TAP-1 i TAP-2 , z których każde ma jeden region hydrofobowy i jeden region wiążący ATP. Łączą się w heterodimer, co skutkuje transporterem czterodomenowym.

Funkcjonować

Transporter TAP znajduje się w świetle ER związanym z kompleksem ładującym peptyd (PLC). Ten kompleks mikroglobuliny β2 , kalretykuliny , ERp57, TAP, tapasyny i MHC klasy I utrzymuje cząsteczki MHC, dopóki nie zostaną w pełni naładowane peptydami.

Transport peptydów

Transport peptydów za pośrednictwem TAP jest procesem wieloetapowym. Kieszeń wiążąca peptyd jest tworzona przez TAP-1 i TAP-2. Asocjacja z TAP jest zdarzeniem niezależnym od ATP, „w szybkim etapie asocjacji dwucząsteczkowej peptyd wiąże się z TAP, po czym następuje powolna izomeryzacja kompleksu TAP”. Sugeruje się, że zmiana konformacyjna w strukturze wyzwala hydrolizę ATP, a tym samym inicjuje transport peptydów.

Obie domeny wiążące nukleotydy (NBD) są wymagane do translokacji peptydów, ponieważ każda NBD nie może hydrolizować samego ATP. Dokładny mechanizm transportu nie jest znany; jednakże odkrycia wskazują, że wiązanie ATP z TAP-1 jest początkowym etapem procesu transportu i że ATP związane z TAP-1 indukuje wiązanie ATP w TAP-2. Wykazano również, że oddokowanie obciążonego MHC klasy I jest związane z cyklem transportu TAP wywołanym sygnałami z podjednostki TAP-1.

Transport mRNA z jądra

Białko drożdżowe Mex67p i ludzki NXF1, zwany także TAP, to dwa najlepiej scharakteryzowane NXF (czynniki transportu jądrowego). TAP pośredniczą w interakcji między posłańcami cząstek rybonukleoproteinowych (mRNP) a kompleksem porów jądrowych (NPC). NXF nie przypominają prototypowych receptorów transportu jądrowego z rodziny importyno-eksportyna (karioferyna) i nie mają charakterystycznej domeny wiążącej Ran, którą można znaleźć we wszystkich karioferyny.

Specyficzność

Aktywność ATPazy TAP jest silnie zależna od obecności właściwego substratu, a wiązanie peptydu jest warunkiem wstępnym hydrolizy ATP. Zapobiega to marnowaniu ATP poprzez hydrolizę niezależną od peptydów.

Swoistość białek TAP po raz pierwszy zbadano przez wyłapywanie peptydów w ER przy użyciu glikozylacji. TAP wiąże się z peptydami o długości od 8 do 16 reszt z równym powinowactwem, podczas gdy translokacja jest najbardziej wydajna w przypadku peptydów o długości od 8 do 12 reszt. Wydajność zmniejsza się dla peptydów dłuższych niż 12 reszt. Jednak translokowano peptydy o ponad 40 resztach, aczkolwiek z niską wydajnością. Peptydy o niskim powinowactwie do cząsteczki MHC klasy I są transportowane z ER przez wydajne białko eksportowe zależne od ATP. Te opisane mechanizmy mogą reprezentować mechanizm zapewniający, że tylko peptydy o wysokim powinowactwie są wiązane z MHC klasy I.

Zobacz też

• Retikulum endoplazmatyczne
• Klasa MHC I
• System odprnościowy

Bibliografia

Linki zewnętrzne

• transporter+skojarzony+z+antygenem+przetwarzanie+(TAP) w amerykańskiej National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)