Erez Lieberman Aiden - Erez Lieberman Aiden
Erez Lieberman Aiden | |
|---|---|
 Lieberman Aiden w 2011 r.
| |
| Urodzić się |
Erez Lieberman
1980 (wiek 40–41) |
| Alma Mater |
Princeton University (BS) Yeshiva University (MA) Harvard University (PhD) |
| Małżonkowie | Aviva Presser Aiden ( M. 2005) |
| Nagrody | Lemelson-MIT Student Prize , Technology Review TR35 |
| Kariera naukowa | |
| Pola |
Matematyka stosowana Biologia molekularna Biofizyka |
| Instytucje | Baylor College of Medicine |
| Praca dyplomowa | Ewolucja i pojawienie się struktury (2010) |
| Doradca doktorski |
Eric Lander Martin Nowak |
| Strona internetowa | erez |
Erez Lieberman Aiden (ur. 1980, ne Erez Lieberman) jest amerykańskim naukowcem aktywnym w wielu dziedzinach związanych z matematyką stosowaną . Jest adiunktem w Baylor College of Medicine , a wcześniej członkiem Harvard Society of Fellows i wizytującym członkiem wydziału w Google . Jest adiunktem w dziedzinie informatyki na Uniwersytecie Rice . Stosując podejścia matematyczne i obliczeniowe, badał ewolucję w różnych kontekstach, w tym sieci, teorię grafów ewolucyjnych i języki w dziedzinie kulturomiki . Opublikował artykuły naukowe z różnych dyscyplin.
Lieberman Aiden zdobył nagrody, w tym nagrodę studencką Lemelson-MIT oraz nagrodę Amerykańskiego Towarzystwa Fizycznego za wybitne badania doktoranckie w dziedzinie fizyki biologicznej. W 2009 roku Lieberman Aiden został uznany za jednego z 35 najlepszych innowatorów poniżej 35 roku życia przez Technology Review, a w 2011 roku był jednym z laureatów nagrody Presidential Early Career Award dla naukowców i inżynierów .
Wczesne życie i edukacja
Lieberman dorastał na Brooklynie z trójką rodzeństwa. Zaczął programować komputery w wieku siedmiu lat. Jego ojciec, Aharon Lieberman, był przedsiębiorcą technologicznym i właścicielem fabryki w New Jersey . Jako dziecko Lieberman Aiden mówił po hebrajsku i węgiersku , czyniąc z angielskiego swój trzeci język.
Lieberman Aiden studiował matematykę, fizykę i filozofię w Princeton i uzyskał tytuł magistra historii na Uniwersytecie Yeshiva . Następnie ukończył wspólny doktorat z matematyki i bioinżynierii w Harvard-MIT Division of Health Sciences and Technology , gdzie doradzali mu Eric Lander i Martin Nowak .
Badania i kariera
Lieberman Aiden wraz ze swoim promotorem, Martinem Nowakiem, przyczynił się do powstania teorii grafów ewolucyjnych . Od tego czasu zajmuje się badaniem trójwymiarowej struktury genomu ludzkiego oraz dziedziną kulturomiki .
Struktura genomu 3D
Lieberman Aiden był członkiem zespołu naukowców z University of Massachusetts Medical School i MIT, którzy jako pierwsi zasugerowali, że ludzkie DNA składa się w kulkę fraktalną, a nie kulkę równowagi. To odkrycie wyjaśnia, w jaki sposób genom każdej komórki może być mocno zagęszczony bez tworzenia węzła . Lieberman Aiden i współpracownicy wynaleźli wariant wychwytywania konformacji chromosomów o nazwie „Hi-C”, który wytwarza miarę prawdopodobieństwa kontaktu w całym genomie, która wskazuje na trójwymiarową strukturę genomu. Ta technika łączy istniejącą metodologię wychwytywania chromosomów z sekwencjonowaniem nowej generacji , umożliwiając pomiar wszystkich kontaktów chromatyny.
W 2009 roku praca ta została opublikowana w czasopiśmie Science i znalazła się na okładce. Po publikacji Lieberman Aiden był cytowany, mówiąc:
Od dawna wiemy, że w małej skali DNA to podwójna helisa… Ale gdyby podwójna helisa nie pofałdowała się dalej, genom w każdej komórce miałby dwa metry długości. Naukowcy tak naprawdę nie zrozumieli, w jaki sposób podwójna helisa składa się, aby dopasować się do jądra komórki ludzkiej o średnicy zaledwie jednej setnej milimetra. To nowe podejście umożliwiło nam zbadanie dokładnie tego pytania.
W 2014 roku był starszym autorem artykułu w Cell, który opisywał wyrafinowaną metodę Hi-C, którą jego zespół wykorzystał do opisania podstawowej organizacji DNA.
Kulturomika
Lieberman Aiden był zaangażowany w analizę zbioru około 5 milionów zdigitalizowanych książek, stosując techniki eksploracji danych w celu rozwoju nowej dziedziny kulturomiki. Leiberman Aiden był zaangażowany w projekt digitalizacji tekstów anglosaskich w 2004 roku, którego analiza dostarczyła dowodów potwierdzających regularyzację czasowników, proces, w którym czasowniki nieregularne stają się z czasem coraz bardziej regularne .
Po ogłoszeniu Google Books Lieberman Aiden zwrócił się do dyrektora ds. badań firmy Google, Petera Norviga, i otrzymał pozwolenie na statystyczną analizę danych. Jego praca przyczyniła się do powstania przeglądarki Google Ngram Viewer , wydanej w grudniu 2010 r., która wykorzystuje idee kulturomiki do tworzenia znormalizowanych trendów historycznych dla dowolnej sekwencji liter. W ramach tego projektu opublikowano szereg odkryć w czasopiśmie Science , w tym zmieniającą się dynamikę sławy i przypadki cenzury literackiej podczas II wojny światowej .
Nagrody i wyróżnienia
W 2008 roku Lieberman Aiden otrzymał nagrodę Lemelson-MIT Student Prize za pracę nad iShoe, mającym pomóc osobom starszym z problemami z równowagą i zapobiegać upadkom, które mogą spowodować obrażenia. W następnym roku iShoe został wymieniony jako jeden z „20 nowych przełomów biotechnologicznych, które zmienią medycynę” przez Popular Mechanics . Rok później Lieberman Aiden został uznany za jednego z 35 najlepszych innowatorów poniżej 35 roku życia ( TR35 ) przez magazyn Technology Review MIT .
W 2010 roku Amerykańskie Towarzystwo Fizyczne przyznało Liebermanowi Aidenowi nagrodę za wybitne badania doktoranckie w dziedzinie fizyki biologicznej za pracę zatytułowaną „Ewolucja i pojawienie się struktury”. Jego rozprawa doktorska została również nagrodzona Nagrodą Hertza . Lieberman Aiden jest również laureatem nagrody NIH Director's New Innovator Award i wraz z 95 innymi amerykańskimi badaczami został nazwany laureatem Presidential Early Career Award for Scientists and Engineers w 2011 roku.
Życie osobiste
Erez Lieberman poślubił Aviva Presser w 2005 roku; po ślubie zarówno mąż, jak i żona dołączyli do swoich nazwisk „Aiden”, co po hebrajsku oznacza Eden, a w języku gaelickim mały ogień. Mają syna o imieniu Gabriel Galileo, córkę o imieniu Maayan Amara i innego chłopca o imieniu Juda Abraham. Poza zainteresowaniami naukowymi Lieberman Aiden uczestniczył we współpracy w dziedzinie sztuki współczesnej z Nicholasem Kahnem i Richardem Selesnickiem, która była wystawiana w galeriach w Stanach Zjednoczonych i Europie.
Lieberman Aiden i jego żona założyli Bears Without Borders, organizację non-profit, która zajmuje się dystrybucją pluszowych zabawek w krajach rozwijających się.
Bibliografia