Forminy - Formins

forma 1
Identyfikatory
Symbol FMN1
Alt. symbolika LD, FMN
Gen NCBIBI 342184
HGNC 3768
OMIM 136535
RefSeq NM_001103184
UniProt Q68DA7
Inne dane
Umiejscowienie Chr. 15 q13-q14
forma 2
Identyfikatory
Symbol FMN2
Gen NCBIBI 56776
HGNC 14074
OMIM 606373
RefSeq XM_371352
UniProt Q9NZ56
Inne dane
Umiejscowienie Chr. 1 kwartał 43
Struktura domenowa białek forminowych w różnych typach.
Region Homologii Forminy 1
Identyfikatory
Symbol Drf_FH1
Pfam PF06346
InterPro IPR009408
Homologia Formin 2 Domena
PDB 1x4 EBI.jpg
struktury krystaliczne domeny homologii forminy-2 ujawniają architekturę uwiązanego dimeru
Identyfikatory
Symbol FH2
Pfam PF02181
InterPro IPR015425
MĄDRY FH2
SCOP2 1ux5 / zakres / SUPFAM
Przezroczysta domena FH3
PDB 1z2c EBI.jpg
struktura krystaliczna mdia1 gbd-fh3 w kompleksie z rhoc-gmppnp
Identyfikatory
Symbol Drf_FH3
Pfam PF06367
Klan Pfam CL0020
InterPro IPR010472
Domena autoregulacji DRF
PDB 2bap EBI.jpg
struktura krystaliczna n-końcowego regionu powtórzeń pancernika mdia1 i domeny dimeryzacji w kompleksie z domeną autoregulacyjną mdia1 (tata)
Identyfikatory
Symbol Drf_DAD
Pfam PF06345
InterPro IPR010465
Przezroczysta domena wiążąca GTPazę
PDB 1z2c EBI.jpg
struktura krystaliczna mdia1 gbd-fh3 w kompleksie z rhoc-gmppnp
Identyfikatory
Symbol Drf_GBD
Pfam PF06371
Klan Pfam CL0020
InterPro IPR010473

Formins (formin białek homologicznych) są grupą białek , które biorą udział w polimeryzacji z aktyny i wiążą się z szybko rosnącego końca (koniec kolczasty) aktynowych włókienek. Większość formin to białka efektorowe Rho-GTPazy . Forminy regulują cytoszkielet aktyny i mikrotubuli i są zaangażowane w różne funkcje komórkowe, takie jak polarność komórki , cytokineza , migracja komórek i aktywność transkrypcyjna SRF . Forminy są wielodomenowymi białkami, które oddziałują z różnymi cząsteczkami sygnałowymi i białkami cytoszkieletu , chociaż niektórym forminie przypisano funkcje w jądrze .

Różnorodność

Forminy znaleziono we wszystkich badanych eukariontach . U ludzi występuje 15 różnych białek forminy, które zostały sklasyfikowane w 7 podgrupach. Natomiast drożdże zawierają tylko 2-3 forminy.

Struktura i interakcje

Formins charakteryzują się obecnością trzech formin homologii (FH) domen (FH1, FH2 i FH3), chociaż z rodziny formin nie musi zawierać wszystkich trzech domenach. Ponadto zwykle obecne są inne domeny, takie jak domeny PDZ , DAD, WH2 lub FHA.

Prolina bogaty w FH1 domeny pośredniczy w interakcji z różnymi białkami, w tym białka wiążące aktynę profiliny , SH3 (SRC), +3 homologii białek domeny i domeny WW białek. Aktywność promująca nukleację aktyny formin S. cerevisiae została zlokalizowana w domenie FH2. Domena FH2 jest wymagana do samoasocjacji białek forminy poprzez zdolność domen FH2 do bezpośredniego wiązania się ze sobą i może również działać hamująco na polimeryzację aktyny. Domena FH3 jest słabiej konserwowana i jest wymagana do kierowania formin do właściwej lokalizacji wewnątrzkomórkowej , takiej jak wrzeciono mitotyczne lub końcówka wystająca podczas koniugacji . Ponadto, niektóre formins może zawierać GTPazy -binding domenę (GBD) wymagane do wiązania z Rho małych GTP- i C-końcowy konserwatywną domenę Dia-autoregulującą (DAD). GBD jest dwufunkcyjną domeną autohamującą, która oddziałuje i jest regulowana przez aktywowanych członków rodziny Rho. Ssacze Drf3 zawiera w swoim GBD motyw podobny do CRIB do wiązania się z Cdc42 , który jest wymagany do aktywacji i prowadzenia Drf3 w kierunku kory komórki, gdzie Cdc42 przebudowuje szkielet aktynowy. DAD wiąże N-końcowy GBD; to połączenie jest zerwane, gdy Rho związane z GTP wiąże się z GBD i aktywuje białko. Dodanie DAD do komórek ssaków indukuje tworzenie włókien aktynowych , stabilizuje mikrotubule i aktywuje transkrypcję za pośrednictwem SRF . Inną powszechnie spotykaną domeną jest region powtórzeń pancernych (ARR) zlokalizowany w domenie FH3.

Wykazano za pomocą krystalografii rentgenowskiej , że domena FH2 ma wydłużony, sierpowaty kształt zawierający trzy helikalne subdomeny.

Forminy również bezpośrednio wiążą się z mikrotubulami poprzez ich domenę FH2. Ta interakcja jest ważna w promowaniu wychwytywania i stabilizacji podzbioru mikrotubul zorientowanych w kierunku przedniej krawędzi migrujących komórek. Forminy sprzyjają również wychwytywaniu mikrotubul przez kinetochor podczas mitozy i ukierunkowaniu mikrotubul wzdłuż włókien aktynowych.

Bibliografia

Linki zewnętrzne

Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR010472
Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR015425
Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR010465
Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR010473