Ankyrin - Ankyrin

ANK1, erytrocytarny
Domena ankiryny R wiążąca błonę 1N11.png
Schemat wstążkowy fragmentu domeny wiążącej błonę ankiryny R.
Identyfikatory
Symbol ANK1
Alt. symbolika AnkyrinR, Band2.1
Gen NCBI 286
HGNC 492
OMIM 182900
PDB 1N11
RefSeq NM_000037
UniProt P16157
Inne dane
Umiejscowienie Chr. 8 s. 21.1-11.2
Ankyrin powtórz
Identyfikatory
Symbol Ank
Pfam PF00023
InterPro IPR002110
MĄDRY SM00248
PROSITE PDOC50088
SCOP2 1awc / zakres / SUPFAM
ANK2, neuronalny
Identyfikatory
Symbol ANK2
Alt. symbolika AnkyrinB
Gen NCBI 287
HGNC 493
OMIM 106410
RefSeq NM_001148
UniProt Q01484
Inne dane
Umiejscowienie Chr. 4 q25-q27
ANK3, węzeł Ranvier
Identyfikatory
Symbol ANK3
Alt. symbolika AnkyrinG
Gen NCBI 288
HGNC 494
OMIM 600465
RefSeq NM_020987
UniProt Q12955
Inne dane
Umiejscowienie Chr. 10 q21

Ankiryny to rodzina białek, które pośredniczą w przyłączaniu integralnych białek błonowych do cytoszkieletu błonowego opartego na spektrynie - aktynie . Ankiryny mają miejsca wiązania dla podjednostki beta spektyny i co najmniej 12 rodzin integralnych białek błonowych. Połączenie to jest wymagane w celu utrzymania integralności błony komórkowej i do zakotwiczenia specyficznych kanałów jonowych , wymieniacze jonowe i transportery jonowe w błonie komórkowej. Nazwa pochodzi od greckiego słowa ἄγκυρα ( ankyra ) oznaczającego „kotwicę”.

Struktura

Ankiryny zawierają cztery domeny funkcjonalne : domenę N-końcową, która zawiera 24 tandemowe powtórzenia ankiryny , domenę centralną, która wiąże się ze spektryną , domenę śmierci, która wiąże się z białkami zaangażowanymi w apoptozę oraz domenę regulatorową C-końcową, która jest wysoce zmienna między różnymi białka ankiryny.

Rozpoznawanie białek błonowych

24 tandemowe powtórzenia ankyryny są odpowiedzialne za rozpoznawanie szerokiego zakresu białek błonowych. Te 24 powtórzenia zawierają 3 strukturalnie różne miejsca wiązania w zakresie od powtórzeń 1-14. Te miejsca wiązania są quasi-niezależne od siebie i można je stosować w połączeniu. Oddziaływania, których miejsca używają do wiązania się z białkami błonowymi, są niespecyficzne i obejmują: wiązania wodorowe, oddziaływania hydrofobowe i elektrostatyczne. Te niespecyficzne interakcje dają ankirynie właściwość rozpoznawania szerokiego zakresu białek, ponieważ sekwencja nie musi być konserwowana, a jedynie właściwości aminokwasów . Quasi-niezależność oznacza, że ​​jeśli miejsce wiązania nie jest używane, nie będzie miało dużego wpływu na ogólne wiązanie. Te dwie właściwości w połączeniu dają początek szerokiemu repertuarowi białek, które może rozpoznać ankiryna.

Podtypy

Ankiryny są kodowane u ssaków przez trzy geny ( ANK1 , ANK2 i ANK3 ). Każdy gen z kolei wytwarza wiele białek poprzez alternatywny splicing .

ANK1

ANK1 gen koduje białka AnkyrinR. AnkyrinR został po raz pierwszy scharakteryzowany w ludzkich erytrocytach, gdzie tę ankirynę określano jako ankirynę erytrocytów lub prążek 2.1. AnkyrinR umożliwia erytrocytom przeciwstawienie się siłom ścinającym występującym w krążeniu. Osoby z obniżoną lub wadliwą ankirynąR mają postać niedokrwistości hemolitycznej zwanej dziedziczną sferocytozą . W erytrocytach AnkyrinR łączy szkielet membrany z wymieniaczem anionowym Cl - / HCO 3 - .

Ankyrin 1 łączy receptor błonowy CD44 z receptorem trifosforanu inozytolu i cytoszkieletem .

Sugerowano, że Ankyrin 1 wchodzi w interakcje z KAHRP (pokazane przez selektywne obniżenia, SPR i ELISA ).

ANK2

Lewa palmitoilacja (czerwona) zakotwicza Ankyrin G w błonie komórkowej. Dobrze Zamknij. Pozostałość palmitoilu na żółto.

Następnie w mózgu i mięśniach zidentyfikowano białka ankyrinB (produkty genu ANK2 ). Białka AnkyrinB i AnkyrinG są wymagane do spolaryzowanej dystrybucji wielu białek błonowych, w tym ATPazy Na + / K + , kanału Na + bramkowanego napięciem i wymieniacza Na + / Ca 2+ .

ANK3

Białka AnkyrinG (produkty genu ANK3 ) zidentyfikowano w komórkach nabłonka i neuronach. Analiza genetyczna na dużą skalę przeprowadzona w 2008 roku pokazuje możliwość, że ANK3 jest zaangażowany w chorobę afektywną dwubiegunową .

Zobacz też

  • DARPin (zaprojektowane białko powtórzenia ankiryny ), zmodyfikowany mimetyk przeciwciał oparty na strukturze powtórzeń ankiryny

Bibliografia

Zewnętrzne linki