Ankyrin - Ankyrin
ANK1, erytrocytarny | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Schemat wstążkowy fragmentu domeny wiążącej błonę ankiryny R.
| |||||||
Identyfikatory | |||||||
Symbol | ANK1 | ||||||
Alt. symbolika | AnkyrinR, Band2.1 | ||||||
Gen NCBI | 286 | ||||||
HGNC | 492 | ||||||
OMIM | 182900 | ||||||
PDB | 1N11 | ||||||
RefSeq | NM_000037 | ||||||
UniProt | P16157 | ||||||
Inne dane | |||||||
Umiejscowienie | Chr. 8 s. 21.1-11.2 | ||||||
|
Ankyrin powtórz | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||||
Symbol | Ank | ||||||||
Pfam | PF00023 | ||||||||
InterPro | IPR002110 | ||||||||
MĄDRY | SM00248 | ||||||||
PROSITE | PDOC50088 | ||||||||
SCOP2 | 1awc / zakres / SUPFAM | ||||||||
|
ANK2, neuronalny | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||
Symbol | ANK2 | ||||||
Alt. symbolika | AnkyrinB | ||||||
Gen NCBI | 287 | ||||||
HGNC | 493 | ||||||
OMIM | 106410 | ||||||
RefSeq | NM_001148 | ||||||
UniProt | Q01484 | ||||||
Inne dane | |||||||
Umiejscowienie | Chr. 4 q25-q27 | ||||||
|
ANK3, węzeł Ranvier | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Identyfikatory | |||||||
Symbol | ANK3 | ||||||
Alt. symbolika | AnkyrinG | ||||||
Gen NCBI | 288 | ||||||
HGNC | 494 | ||||||
OMIM | 600465 | ||||||
RefSeq | NM_020987 | ||||||
UniProt | Q12955 | ||||||
Inne dane | |||||||
Umiejscowienie | Chr. 10 q21 | ||||||
|
Ankiryny to rodzina białek, które pośredniczą w przyłączaniu integralnych białek błonowych do cytoszkieletu błonowego opartego na spektrynie - aktynie . Ankiryny mają miejsca wiązania dla podjednostki beta spektyny i co najmniej 12 rodzin integralnych białek błonowych. Połączenie to jest wymagane w celu utrzymania integralności błony komórkowej i do zakotwiczenia specyficznych kanałów jonowych , wymieniacze jonowe i transportery jonowe w błonie komórkowej. Nazwa pochodzi od greckiego słowa ἄγκυρα ( ankyra ) oznaczającego „kotwicę”.
Struktura
Ankiryny zawierają cztery domeny funkcjonalne : domenę N-końcową, która zawiera 24 tandemowe powtórzenia ankiryny , domenę centralną, która wiąże się ze spektryną , domenę śmierci, która wiąże się z białkami zaangażowanymi w apoptozę oraz domenę regulatorową C-końcową, która jest wysoce zmienna między różnymi białka ankiryny.
Rozpoznawanie białek błonowych
24 tandemowe powtórzenia ankyryny są odpowiedzialne za rozpoznawanie szerokiego zakresu białek błonowych. Te 24 powtórzenia zawierają 3 strukturalnie różne miejsca wiązania w zakresie od powtórzeń 1-14. Te miejsca wiązania są quasi-niezależne od siebie i można je stosować w połączeniu. Oddziaływania, których miejsca używają do wiązania się z białkami błonowymi, są niespecyficzne i obejmują: wiązania wodorowe, oddziaływania hydrofobowe i elektrostatyczne. Te niespecyficzne interakcje dają ankirynie właściwość rozpoznawania szerokiego zakresu białek, ponieważ sekwencja nie musi być konserwowana, a jedynie właściwości aminokwasów . Quasi-niezależność oznacza, że jeśli miejsce wiązania nie jest używane, nie będzie miało dużego wpływu na ogólne wiązanie. Te dwie właściwości w połączeniu dają początek szerokiemu repertuarowi białek, które może rozpoznać ankiryna.
Podtypy
Ankiryny są kodowane u ssaków przez trzy geny ( ANK1 , ANK2 i ANK3 ). Każdy gen z kolei wytwarza wiele białek poprzez alternatywny splicing .
ANK1
ANK1 gen koduje białka AnkyrinR. AnkyrinR został po raz pierwszy scharakteryzowany w ludzkich erytrocytach, gdzie tę ankirynę określano jako ankirynę erytrocytów lub prążek 2.1. AnkyrinR umożliwia erytrocytom przeciwstawienie się siłom ścinającym występującym w krążeniu. Osoby z obniżoną lub wadliwą ankirynąR mają postać niedokrwistości hemolitycznej zwanej dziedziczną sferocytozą . W erytrocytach AnkyrinR łączy szkielet membrany z wymieniaczem anionowym Cl - / HCO 3 - .
Ankyrin 1 łączy receptor błonowy CD44 z receptorem trifosforanu inozytolu i cytoszkieletem .
Sugerowano, że Ankyrin 1 wchodzi w interakcje z KAHRP (pokazane przez selektywne obniżenia, SPR i ELISA ).
ANK2
Następnie w mózgu i mięśniach zidentyfikowano białka ankyrinB (produkty genu ANK2 ). Białka AnkyrinB i AnkyrinG są wymagane do spolaryzowanej dystrybucji wielu białek błonowych, w tym ATPazy Na + / K + , kanału Na + bramkowanego napięciem i wymieniacza Na + / Ca 2+ .
ANK3
Białka AnkyrinG (produkty genu ANK3 ) zidentyfikowano w komórkach nabłonka i neuronach. Analiza genetyczna na dużą skalę przeprowadzona w 2008 roku pokazuje możliwość, że ANK3 jest zaangażowany w chorobę afektywną dwubiegunową .
Zobacz też
- DARPin (zaprojektowane białko powtórzenia ankiryny ), zmodyfikowany mimetyk przeciwciał oparty na strukturze powtórzeń ankiryny
Bibliografia
Zewnętrzne linki
- Ankyrins w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
- Proteopedia 1n11 Ankyrin-R