Zakładki (genetyczne) - Bookmarking (genetic)
Zakładki (również „ zakładki genów ” lub „ zakładki mitotyczne ”) odnoszą się do potencjalnego mechanizmu przenoszenia programów ekspresji genów poprzez podział komórki.
W czasie mitozy , transkrypcja genów ulega wyciszeniu i większość czynników transkrypcyjnych są usuwane z chromatyną . Termin zakładki porównuje transkrypcję do czytania z książki. Przerwa w transkrypcji podczas mitozy jest jak zamykanie księgi. „Zakładki molekularne” to czynniki, które umożliwiają wznowienie transkrypcji w uporządkowany sposób w nowonarodzonych komórkach po mitozie (po ponownym otwarciu książki).
Zakładki spełniają następujące kryteria:
- w pewnym punkcie przed rozpoczęciem mitozy , że promotory genów, które istnieją w transkrypcji stanie -competent stać się „oznaczony jako” w pewnym sensie
- ten „znak” utrzymuje się zarówno podczas mitozy , jak i po jej zakończeniu , oraz
- znakowanie przekazuje pamięć ekspresji genów, zapobiegając mitotycznemu zagęszczaniu DNA w tym locus lub ułatwiając ponowne składanie kompleksów transkrypcyjnych na promotorze , lub jedno i drugie.
Zakładki jako selektywne utrzymywanie otwartego stanu chromatyny
Termin zakładki został pierwotnie ukuty, aby opisać brak zagęszczania niektórych promotorów genów podczas mitozy . Niedawno dostępność genomu podczas interfazy i mitozy została bezpośrednio porównana w skali całego genomu. Chociaż promotory genów wydają się być lepiej zachowane niż dystalne elementy regulatorowe, w poszczególnych miejscach występują znaczne różnice.
Zakładki przez metylację DNA, modyfikację potranslacyjną histonów i warianty histonów
Niektóre wzorce modyfikacji histonów i obecność niektórych wariantów histonów na DNA pozostają niezmienione podczas mitozy i mogą potencjalnie działać jak zakładki. Wzory metylacji DNA są zasadniczo niezmienione i mogą również funkcjonować jako zakładki.
Zakładki według czynników transkrypcyjnych
Godne uwagi czynniki transkrypcyjne związane z zakładkami mitotycznymi obejmują: