PAX8 - PAX8

PAX8
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	2K27
Identyfikatory
Skróty	PAX8 , sparowane pudełko 8
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 167415 MGI : 97492 HomoloGene : 2589 Karty genetyczne : PAX8
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 2 (ludzki)
Kończyć się	113 278 921 pb
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 2 (mysz)
Kończyć się	24 475 599 pb
Wzór ekspresji RNA
	; ; ; ;
	Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• wiążące DNA ; • specyficznego względem sekwencji wiązania DNA ; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 DNA aktywności wiązania czynnika transkrypcji ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 aktywności aktywatora transkrypcji DNA wiązania RNA polimerazy II-specyficzne ; • GO: 0000980 RNA polimerazy II cis-regulacyjne specyficzne dla sekwencji regionu wiążącego DNA ; • aktywności receptora hormonu stymulującego tarczycę ; • GO: 0001948 białka wiążącego ; • RNA polimerazy II rdzenia sekwencja promotora swoiste wiązanie DNA ; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 aktywność czynnika transkrypcyjnego wiążącego DNA, swoista dla polimerazy RNA II;
Składnik komórkowy	• nukleoplazma ; • jądro;
Proces biologiczny	• regulacji procesu apoptozy ; • rozwój przednercze ; • regulacja metanephric nefronów kanalików różnicowania komórek nabłonkowych, ; • różnicowanie komórek ; • śródnercza rozwój kanalików ; • dodatnia regulacja rozgałęzienia zaangażowane w moczowodu bud morfogenezy ; • rozwój nabłonka nerki ; • Regulacja transkrypcji DNA na matrycy ; • pozytywnej regulacji różnicowanie komórek metanephric DCT ; • regulacja negatywna mezenchymalnych komórek apoptotycznych zachodzących procesów w metanephric morfogenezy nefronów ; • negatywnej regulacji procesu apoptozy zaangażowanych w metanephric zbiorczego rozwoju kanału ; • rozwoju nerek ; • pronephric określenia pola ; • dodatnia regulacja mezenchymalnych nabłonka przejścia zaangażowanych w nerka ostateczna morfogenezy ; • anatomicznych morfogeneza struktury ; • rozwój nabłonka metanefrycznego ; • przejście mezenchymalne do nabłonkowego zaangażowane w morfogenezę metanefrozy ; • transkrypcja przez polimerazę RNA II ; • regulacja wydzielania hormonu tyreotropowego ; • transkrypcji DNA na matrycy ; • rozwój pęcherzyków uszu ; • metanephric dystalnych kanalików rozwój ; • negatywnej regulacji mezenchymalnych komórek apoptotycznych procesu zaangażowanych w rozwój Nerka ostateczna ; • rozwoju śródnerczem ; • pozytywnej regulacji transkrypcji DNA na matrycy ; • metanephric nefronów kanalików formowania ; • wielokomórkowego rozwoju organizmu ; • rozwój ośrodkowego układu nerwowego ; • morfogeneza ciała w kształcie przecinka metanerkowego ; • rozgałęzienia zaangażowane w morfogenezę pączków moczowodowych ; • rozwój tarczycy ; • pozytywna regulacja wytwarzania hormonów tarczycy ; • ujemna regulacja procesu apoptotycznego zaangażowanego w rozwój kanalików nerkowych metanerycznych ; • morfogeneza ciała w kształcie litery S ; • ucho wewnętrzne morfogeneza ; • rozwój układu moczowo-płciowego ; • proces metabolizmu związków siarki ; • metanefryna morfogeneza ciała w kształcie litery S ; • rozwój metanefro ; • odpowiedź komórkowa na bodziec gonadotropinowy ; • pozytywna regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • znak hormonu tyreotropowego szlak lingu ; • ujemna regulacja procesu apoptozy komórek mięśnia sercowego ; • rozwój przegrody międzykomorowej;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	7849
	18510
	ENSG00000125618
	ENSMUSG00000026976
	Q06710
	Q00288
	NM_003466 ; NM_013951 ; NM_013952 ; NM_013953 ; NM_013992
	NM_011040
	NP_003457 ; NP_039246 ; NP_039247 ; NP_054698
	NP_035170
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Sparowany gen pudełkowy 8 , znany również jako PAX8 , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen PAX8 .

Funkcjonować

Gen ten należy do rodziny czynników transkrypcyjnych typu paired box ( PAX ) . Członkowie tej rodziny genów zazwyczaj kodują białka, które zawierają sparowaną domenę pudełkową , oktapeptyd i homeodomenę typu sparowanego . Rodzina genów PAX odgrywa ważną rolę w tworzeniu tkanek i narządów podczas rozwoju embrionalnego oraz w utrzymaniu prawidłowego funkcjonowania niektórych komórek po urodzeniu. Geny PAX podają instrukcje tworzenia białek, które przyczepiają się do pewnych obszarów DNA. To białko jądrowe jest zaangażowane w rozwój komórek pęcherzykowych tarczycy i ekspresję genów specyficznych dla tarczycy. PAX8 uwalnia hormony ważne dla regulacji wzrostu, rozwoju mózgu i metabolizmu. Działa również w bardzo wczesnych stadiach organogenezy nerek, układu müllera i grasicy. Dodatkowo PAX8 ulega ekspresji w nerkowym układzie wydalniczym, komórkach nabłonka szyjki macicy, endometrium, jajniku, jajowodzie, pęcherzyku nasiennym, najądrza, komórkach wysp trzustkowych i komórkach limfoidalnych. PAX8 i inne czynniki transkrypcyjne odgrywają rolę w wiązaniu się z DNA i regulowaniu genów odpowiedzialnych za syntezę hormonów tarczycy (Tg, TPO, Slc5a5 i Tshr).

PAX8 (i PAX2) jest jednym z ważnych regulatorów morfogenezy układu moczowo-płciowego. Odgrywają rolę w specyfikacji pierwszych komórek nerkowych embrionu i pozostają niezbędnymi graczami przez cały okres rozwoju.

Wykazano, że PAX8 wchodzi w interakcję z homeobox 1 NK2 .

Znaczenie kliniczne

Gen PAX8 jest również związany z wrodzoną niedoczynnością tarczycy spowodowaną dysgenezją tarczycy ze względu na jego rolę we wzroście i rozwoju tarczycy. Mutacja w genie PAX8 może uniemożliwić lub zakłócić normalny rozwój. Mutacje te mogą wpływać na różne funkcje białka, w tym wiązanie DNA, aktywację genów, stabilność białka i współpracę z koaktywatorem p300. Niedobory genu PAX mogą skutkować wadami rozwojowymi zwanymi wrodzonymi anomaliami nerek i dróg moczowych (CAKUT).

Nowotwór

Mutacje PAX8 są związane z różnymi formami raka.

Mechanizmy

PAX8 jest uważany za „czynnik transkrypcyjny głównego regulatora”. Jako główny regulator możliwe jest, że reguluje ekspresję genów innych niż specyficzne dla tarczycy. Kilka znanych genów supresorowych nowotworów, takich jak TP53 i WT1, zostało zidentyfikowanych jako cele transkrypcyjne w ludzkich komórkach gwiaździaka. Ponad 90% guzów tarczycy wywodzi się z pęcherzykowych komórek tarczycy. Białko fuzyjne, PAX8-PPAR-γ , jest związane z niektórymi rakami pęcherzykowymi tarczycy i rakiem brodawkowatym tarczycy typu pęcherzykowo-wariantowego. Mechanizm tej transformacji nie jest dobrze poznany, ale istnieje kilka proponowanych możliwości.

Hamowanie prawidłowej funkcji PPAR y przez chimeryczne białko PAX8/PPARy poprzez dominujący efekt negatywny
Aktywacja normalnych celów PPARy z powodu nadekspresji białka chimerycznego, które zawiera wszystkie funkcjonalne domeny PPARy typu dzikiego
Deregulacja funkcji PAX8
Aktywacja zestawu genów niezwiązanych zarówno ze szlakami PPARy typu dzikiego, jak i PAX8 typu dzikiego

Gen PAX 8 ma pewien związek z pęcherzykowymi guzami tarczycy. Zaobserwowano, że nowotwory PAX8/PPARy-dodatnie rzadko wyrażają mutacje RAS w połączeniu. Sugeruje to, że raki pęcherzykowe rozwijają się w dwóch różnych szlakach albo z PAX8/PPARy albo RAS .

Scharakteryzowano alternatywne warianty splicingu transkrypcyjnego, kodujące różne izoformy. Mechanizm włączania genów jest nieznany. Niektóre badania sugerują, że nerkowe geny PAX działają jako czynniki sprzyjające przeżyciu i pozwalają komórkom nowotworowym opierać się apoptozie. Regulacja w dół ekspresji genu PAX hamuje wzrost komórek i indukuje apoptozę. Może to być możliwa droga do celów terapeutycznych w raku nerki.

Niektóre badania sekwencjonowania całego genomu wykazały, że PAX8 celuje również w BRCA1 (karcynogeneza), szlaki MAPK (nowotwory tarczycy) oraz Ccnb1 i CCnb2 (procesy cyklu komórkowego). Wykazano, że PAX8 bierze udział w proliferacji i różnicowaniu komórek nowotworowych, transdukcji sygnału, apoptozie, polarności i transporcie komórek, ruchliwości i adhezji komórek.

Powiązane typy raka

Mutacje w tym genie powiązano z tarczycy gonad , tarczycy, pęcherzykowy rak i atypowe pęcherzykowy tarczycy, guzy .

Rearanżacja PAX8/PPARy odpowiada za 30-40% raków pęcherzykowych typu konwencjonalnego i mniej niż 5% raków onkocytarnych (inaczej nowotwory Hurthle-Cell).

Ekspresja PAX8 jest zwiększona w tkankach nowotworowych nerek, guzach Wilmsa, raku jajnika i rakach Müllera. Z tego powodu immunodetekcja PAX8 jest szeroko stosowana do diagnozowania pierwotnych i przerzutowych guzów nerki. Reaktywację ekspresji PAX8 (lub Pax2) odnotowano w pediatrycznych nowotworach Wilmsa, prawie wszystkich podtypach raka nerkowokomórkowego, gruczolakach nerkowych, komórkach raka jajnika, raku pęcherza moczowego, prostaty i endometrium. Ekspresja PAX8 jest również indukowana podczas rozwoju raka szyjki macicy.

Nowotwory z ekspresją PAX8/PPARy są zwykle obecne w młodym wieku, mają niewielki rozmiar, mają stały/zagnieżdżony wzór wzrostu i często wiążą się z inwazją naczyń.

Zobacz też

Geny Pax

Bibliografia

Dalsza lektura

Poleev A, Fickenscher H, Mundlos S, Winterpacht A, Zabel B, Fidler A, Gruss P, Plachov D (listopad 1992). „PAX8, ludzki gen sparowany box: izolacja i ekspresja w rozwijających się guzach tarczycy, nerek i Wilmsa”. Rozwój . 116 (3): 611–23. doi : 10.1242/dev.116.3.611 . PMID 1337742 .
Poleev A, Wendler F, Fickenscher H, Zannini MS, Yaginuma K, Abbott C, Plachov D (marzec 1995). „Wyraźne właściwości funkcjonalne trzech ludzkich sparowanych-box-białka, PAX8, izoformy generowane przez alternatywne składanie w guzach tarczycy, nerek i Wilmsa”. European Journal of Biochemistry / FEBS . 228 (3): 899-911. doi : 10.1111/j.1432-1033.1995.tb20338.x . PMID 7737192 .
Stapleton P, Weith A, Urbánek P, Kozmik Z, Busslinger M (kwiecień 1993). „Chromosomalna lokalizacja siedmiu genów PAX i klonowanie nowego członka rodziny, PAX-9”. Genetyka przyrody . 3 (4): 292–8. doi : 10.1038/ng0493-292 . PMID 7981748 . S2CID 21338655 .
Maruyama K, Sugano S (styczeń 1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA z oligorybonukleotydami”. Gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Kozmik Z, Kurzbauer R, Dörfler P, Busslinger M (październik 1993). „Alternatywne składanie transkryptów genu Pax-8 jest regulowane rozwojowo i generuje izoformy o różnych właściwościach transaktywacyjnych” . Biologia molekularna i komórkowa . 13 (10): 6024–35. doi : 10.1128/mcb.13.10.6024 . PMC 364662 . PMID 8413205 .
Pilz AJ, Povey S, Gruss P, Abbott CM (1993). „Mapowanie ludzkich homologów mysich genów zawierających sparowane pudełko”. Genom ssaków . 4 (2): 78–82. doi : 10.1007/BF00290430 . PMID 8431641 . S2CID 30845070 .
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (wrzesień 1996). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrycie genów” . Badania genomu . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (październik 1997). „Budowa i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej na końcu 5'”. Gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Fraizer GC, Shimamura R, Zhang X, Saunders GF (grudzień 1997). „PAX 8 reguluje transkrypcję ludzkiego WT1 poprzez nowe miejsce wiązania DNA” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 272 (49): 30678-87. doi : 10.1074/jbc.272.49.30678 . PMID 9388203 .
Macchia PE, Lapi P, Krude H, Pirro MT, Missero C, Chiovato L, Souabni A, Baserga M, Tassi V, Pinchera A, Fenzi G, Grüters A, Busslinger M, Di Lauro R (maj 1998). „Mutacje PAX8 związane z wrodzoną niedoczynnością tarczycy spowodowaną dysgenezją tarczycy”. Genetyka przyrody . 19 (1): 83–6. doi : 10.1038/ng0598-83 . PMID 9590296 . S2CID 33957230 .
Mansouri A, Chowdhury K, Gruss P (maj 1998). „Komórki pęcherzykowe tarczycy wymagają funkcji genu Pax8”. Genetyka przyrody . 19 (1): 87–90. doi : 10.1038/ng0598-87 . PMID 9590297 . S2CID 205342136 .
Powiedz G, Pellizzari L, Esposito G, Pucillo C, Macchia PE, Di Lauro R, Damante G (lipiec 1999). „Defekty strukturalne mutanta Pax8, które powodują wrodzoną niedoczynność tarczycy” . Czasopismo Biochemiczne . 341 (1): 89-93. doi : 10.1042/0264-6021:3410089 . PMC 1220333 . PMID 10377248 .
De Leo R, Miccadei S, Zammarchi E, Civitareale D (listopad 2000). „Rola p300 w indukcji przez Pax 8 ekspresji genu tyreoperoksydazy” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 275 (44): 34100-5. doi : 10.1074/jbc.M003043200 . PMID 10924503 .
Roberts EC, Deed RW, Inoue T, Norton JD, Sharrocks AD (styczeń 2001). „Białka Id helix-loop-helix antagonizują aktywność czynnika transkrypcyjnego pax poprzez hamowanie wiązania DNA” . Biologia molekularna i komórkowa . 21 (2): 524–33. doi : 10.1128/MCB.21.2.524-53.3.2001 . PMC 86614 . PMID 11134340 .
Vilain C, Rydlewski C, Duprez L, Heinrichs C, Abramowicz M, Malvaux P, Renneboog B, Parma J, Costagliola S, Vassart G (styczeń 2001). „Autosomalna dominująca transmisja wrodzonej hipoplazji tarczycy z powodu mutacji utraty funkcji PAX8”. Czasopismo Endokrynologii Klinicznej i Metabolizmu . 86 (1): 234–8. doi : 10.1210/jc.86.1.234 . PMID 11232006 .
Congdon T, Nguyen LQ, Nogueira CR, Habiby RL, Medeiros-Neto G, Kopp P (sierpień 2001). „Nowa mutacja (Q40P) w PAX8 związana z wrodzoną niedoczynnością tarczycy i niedorozwojem tarczycy: dowody na zmienność fenotypową u matki i dziecka” . Czasopismo Endokrynologii Klinicznej i Metabolizmu . 86 (8): 3962-7. doi : 10.1210/jc.86.8.3962 . PMID 11502839 .
Miccadei S, De Leo R, Zammarchi E, Natali PG, Civitareale D (kwiecień 2002). „Działanie synergistyczne tarczycowego czynnika transkrypcyjnego 1 i Pax 8 zależy od wzajemnego oddziaływania promotora/wzmacniacza” . Endokrynologia molekularna . 16 (4): 837–46. doi : 10.1210/me.16.4.837 . PMID 11923479 .
Marques AR, Espadinha C, Catarino AL, Moniz S, Pereira T, Sobrinho LG, Leite V (sierpień 2002). „Ekspresja rearanżacji PAX8-PPAR gamma 1 w obu pęcherzykowych rakach tarczycy i gruczolakach”. Czasopismo Endokrynologii Klinicznej i Metabolizmu . 87 (8): 3947–52. doi : 10.1210/jc.87.8.3947 . PMID 12161538 .
Di Palma T, Nitsch R, Mascia A, Nitsch L, Di Lauro R, Zannini M (styczeń 2003). „Czynnik Pax8 zawierający sparowaną domenę i czynnik TTF-1 zawierający homeodomenę bezpośrednio oddziałują i synergistycznie aktywują transkrypcję” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 278 (5): 3395-402. doi : 10.1074/jbc.M205977200 . PMID 12441357 .

Zewnętrzne linki

PAX8+białko,+człowiek w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)
„Gen Xenbase: Podsumowanie dla pax8, gatunek: Xenopus tropicalis” . Xenbaza . xenbase.org . Źródło 17.07.2009 . Zasób Xenopus laevis i tropicalis

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .

Languages

In other projects