RBPJ - RBPJ

RBPJ
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	2F8X , 3NBN , 3V79
Identyfikatory
Skróty	RBPJ , AOS3, CBF1, IGKJRB, IGKJRB1, KBF2, RBP-J, RBPJK, RBPSUH, SUH, csl, białko wiążące sygnał rekombinacji dla regionu kappa J immunoglobuliny, RBP-J kappa, RBP-JK, CBF-1
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 147183 MGI : 96522 HomoloGene : 7511 Karty genowe : RBPJ
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 4 (ludzki)
Kończyć się	26 435 131 pb
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 5 (mysz)
Kończyć się	53 657 362 pb
Wzór ekspresji RNA
	Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• Białko N-koniec wiązania ; • GO: 0001948 białko wiążące ; • nici DNA aktywność wymiany ; • chromatyny wiązania ; • GO: 0001077 GO: 0001212 GO: 0001213 GO: 0001211 GO: 0001205 DNA aktywności wiązania aktywatora transkrypcji RNA polimerazy II -specyficznej ; • wiązania DNA ; • aktywność czynnika transkrypcji RNA polimerazy II zasadniczy obszar promotora bliższy wiązania specyficznego dla sekwencji ; • GO: 0001131, 0001151,: GO GO: 0001130, GO: 0001204 DNA aktywności wiązania czynnika transkrypcji ; • sekwencja DNA specyficznie wiążące ; • Wiązanie czynnika transkrypcyjnego ; • GO:0000980 wiązanie DNA dla polimerazy RNA II w regionie regulatorowym cis Wiązanie DNA specyficzne dla sekwencji ; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 Aktywność czynnika transkrypcyjnego wiążącego DNA, swoiste dla polimerazy RNA II;
Składnik komórkowy	• jąderko ; • kompleks MAML1-RBP-Jkappa-ICN1 ; • kompleks regulatora transkrypcji ; • cytoplazma ; • jądro ; • nukleoplazma ; • kompleks represora transkrypcji;
Proces biologiczny	• morfogenezy tętnicy ; • Regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • neuronów różnicowania ; • naskórkowe przeznaczenie komórki specyfikacji ; • dodatnią regulację proliferacji populacji komórek ; • różnicowanie komórek klub ; • somatycznych komórek macierzystych utrzymanie populacji ; • rozwój wsierdzia ; • zaangażowanie przeznaczenie komórki ; • DNA rekombinacji ; • somitogenesis ; • dodatnią regulacja transkrypcji z promotora polimerazy RNA II w odpowiedzi na hipoksję ; • odpowiedź obronna na bakterię ; • regulacja czasu różnicowania komórek ; • regulacja transkrypcji, na podstawie DNA ; • humoralna odpowiedź immunologiczna ; • różnicowanie keratynocytów ; • dojrzewanie mieszków włosowych ; • negatywna regulacja proliferacji populacji komórek ; • rozwój przysadki ; • ujemna regulacja różnicowania komórek ; • sygnalizacja notch zaangażowana w rozwój serca ; • transkrypcja, matryca DNA ; • pozytywna regulacja ekspresji genów ; • zaangażowanie komórek śródbłonka w tętnicach ; • różnicowanie szpikowych komórek dendrytycznych ; • naczynia krwionośne r emodelowanie ; • wtórna specyfikacja pola serca ; • regulacja proliferacji populacji komórek ; • pozytywna regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • inicjacja transkrypcji z promotora polimerazy RNA II ; • rozwój gruczołów łojowych ; • pozytywna regulacja kanonicznego szlaku sygnałowego Wnt zaangażowanego w zaangażowanie komórek mięśnia sercowego ; • stan zapalny odpowiedź na bodziec antygenowy ; • rozwój serca ; • zaangażowanie komórek receptora słuchowego ; • różnicowanie limfocytów B ; • regulacja ekspresji genów ; • ścieżka sygnalizacyjna Notch ; • morfogeneza aorty grzbietowej ; • rozwój kanału przedsionkowo-komorowego ; • pozytywna regulacja szlaku sygnalizacyjnego receptora efryny ; • przejście nabłonkowe do mezenchymalne związane z wsierdziowym tworzenie poduszki ; • odpływu morfogenezy ; • lewej komory serca morfogenezy ; • regulacja negatywna transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • rozwoju naczyń labiryntowy warstwa krwi ; • naczyń krwionośnych lumenization ; • wsierdzia morfogenezy ; • komory trabecula m morfogeneza yocardium ; • negatywna regulacja kostnienia ; • pozytywna regulacja proliferacji komórek biorąca udział w morfogenezie serca ; • regulacja transkrypcji z promotora polimerazy RNA II zaangażowanego w różnicowanie komórek prekursorowych mięśnia sercowego ; • pozytywna regulacja proliferacji komórek mięśnia sercowego ; • angiogeneza ; • przejście nabłonka do mezenchymów ; • regulacja pozytywna ścieżki sygnałowej BMP ; • pozytywna regulacja ścieżki sygnałowej ERBB ; • specyfikacja losu komórek śródbłonka naczyń krwionośnych ; • negatywna regulacja transkrypcji, na podstawie DNA ; • pozytywna regulacja transkrypcji celu receptora Notch ; • pozytywna regulacja ścieżki sygnałowej Notch ; • hemopoeza ; • rozwój zastawki aortalnej ; • rozwój zastawki płucnej ; • morfogeneza przegrody międzykomorowej ; • ujemna regulacja termogenezy indukowanej zimnem;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	3516
	19664
	ENSG00000168214
	ENSMUSG00000039191
	Q06330
	P31266
NM_005349 ; NM_015874 ; NM_203283 ; NM_203284 ; NM_001363577;
	NM_001374400 ; NM_001374401 ; NM_001374402 ; NM_001374403 ; NM_001379406 ; NM_001379407 ; NM_001379408 ; NM_001379409
	NM_001080927 ; NM_001080928 ; NM_001277116 ; NM_009035 ; NM_001359152
NP_005340 ; NP_056958 ; NP_976028 ; NP_976029 ; NP_001350506;
	NP_001361329 ; NP_001361330 ; NP_001361331 ; NP_001361332 ; NP_001366335 ; NP_001366336 ; NP_001366337 ; NP_001366338
	NP_001074396 ; NP_001074397 ; NP_001264045 ; NP_033061 ; NP_001346081
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Białko wiążące sygnał rekombinacji dla regionu kappa J immunoglobuliny jest białkiem, które u ludzi jest kodowane przez gen RBPJ .

RBPJ znany również jako CBF1, jest ludzkim homologiem supresora genu Drosophila bezwłosego . Jego region promotora jest klasycznie używany do wykazania sygnalizacji Notch1 .

Interakcje

Wykazano, że RBPJ wchodzi w interakcje z:

WYCIĘCIE1
NCOR2 ,
PCAF ,
SND1 ,
SNW1 i
SOX18.

Bibliografia

Dalsza lektura

Oka C, Kawaichi M (1995). „Rekombinacja V (D) J genów immunoglobulin”. Postępy w biofizyce . 31 : 163–80. doi : 10.1016/0065-227X(95)99390-B . PMID 7625272 .
Matsunami N, Hamaguchi Y, Yamamoto Y, Kuze K, Kangawa K, Matsuo H i in. (1990). „Białko wiążące się z sekwencją rekombinacji J kappa genów immunoglobuliny zawiera sekwencję związaną z motywem integrazy”. Natura . 342 (6252): 934-7. doi : 10.1038/342934a0 . PMID 2556644 . S2CID 4370462 .
Tong X, Drapkin R, Yalamanchili R, Mosialos G, Kieff E (wrzesień 1995). „Domena kwasowa białka jądrowego 2 wirusa Epsteina-Barra tworzy kompleks z nowym koaktywatorem komórkowym, który może wchodzić w interakcje z TFIIE” . Biologia molekularna i komórkowa . 15 (9): 4735-44. doi : 10.1128/mcb.15.9.4735 . PMC 230717 . PMID 7651391 .
Zhao B, Marshall DR, Próbka CE (lipiec 1996). „Konserwatywna domena antygenów jądrowych wirusa Epsteina-Barra 3A i 3C wiąże się z oddzielną domeną Jkappa” . Czasopismo Wirusologii . 70 (7): 4228–36. doi : 10.1128/JVI.70.7.4228-4236.1996 . PMC 190353 . PMID 8676443 .
Tamura K, Taniguchi Y, Minoguchi S, Sakai T, Tun T, Furukawa T, Honjo T (grudzień 1995). „Fizyczne oddziaływanie między nową domeną receptora Notch a czynnikiem transkrypcyjnym RBP-J kappa/Su(H)”. Aktualna biologia . 5 (12): 1416–23. doi : 10.1016/S0960-9822(95)00279-X . hdl : 2433/202204 . PMID 8749394 . S2CID 18442572 .
Gress TM, Müller-Pillasch F, Geng M, Zimmerhackl F, Zehetner G, Friess H i in. (październik 1996). „Profil ekspresji specyficznej dla raka trzustki”. Onkogen . 13 (8): 1819–30. PMID 8895530 .
Hsieh JJ, Nofziger DE, Weinmaster G, Hayward SD (marzec 1997). „Unieśmiertelnienie wirusa Epsteina-Barra: Notch2 oddziałuje z CBF1 i blokuje różnicowanie” . Czasopismo Wirusologii . 71 (3): 1938-1945. doi : 10.1128/JVI.71.3.1938-1945.1997 . PKW 191274 . PMID 9032325 .
Aster JC, Robertson ES, Hasserjian RP, Turner JR, Kieff E, Sklar J (kwiecień 1997). „Onkogenne formy NOTCH1 pozbawione głównego miejsca wiązania dla RBP-Jkappa lub sekwencji lokalizacji jądrowej zachowują zdolność do łączenia się z RBP-Jkappa i aktywowania transkrypcji” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 272 (17): 11336-43. doi : 10.1074/jbc.272.17.11336 . PMID 9111040 .
Kao HY, Ordentlich P, Koyano-Nakagawa N, Tang Z, Downes M, Kintner CR i in. (sierpień 1998). „Kompleks korepresora deacetylazy histonowej reguluje szlak transdukcji sygnału Notch” . Geny i rozwój . 12 (15): 2269-77. doi : 10.1101/gad.12.15.2269 . PMC 317043 . PMID 9694793 .
Hsieh JJ, Zhou S, Chen L, Young DB, Hayward SD (styczeń 1999). „CIR, korepresor łączący czynnik wiążący DNA CBF1 z kompleksem deacetylazy histonowej” . Materiały Narodowej Akademii Nauk Stanów Zjednoczonych Ameryki . 96 (1): 23-8. Kod Bib : 1999PNAS...96...23H . doi : 10.1073/pnas.96.1.23 . PMC 15086 . PMID 9874765 .
Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, et al. (listopad 1999). „Antygeny rozpoznawane przez przeciwciała autologiczne u pacjentów z rakiem nerkowokomórkowym” . Międzynarodowy Dziennik Raka . 83 (4): 456–64. doi : 10.1002/(SICI)1097-0215(19991112)83:4<456::AID-IJC4>3.0.CO;2-5 . PMID 10508479 .
Callahan J, Aster J, Sklar J, Kieff E, Robertson ES (styczeń 2000). „Wewnątrzkomórkowe formy ludzkiego NOTCH1 oddziałują na wyraźnie różnych poziomach z RBP-jkappa w ludzkich komórkach B i T” . Białaczka . 14 (1): 84–92. doi : 10.1038/sj.leu.2401630 . PMID 10637481 .
Smith PR, de Jesus O, Turner D, Hollyoake M, Karstegl CE, Griffin BE, et al. (kwiecień 2000). „Struktura i zawartość kodująca RNA rodziny CST (BART) wirusa Epsteina-Barra” . Czasopismo Wirusologii . 74 (7): 3082–92. doi : 10.1128/JVI.74.7.3082-3092.2000 . PMC 111807 . PMID 10708423 .
Zhou S, Fujimuro M, Hsieh JJ, Chen L, Miyamoto A, Weinmaster G, Hayward SD (kwiecień 2000). „SKIP, białko związane z CBF1, oddziałuje z domeną powtórzeń ankyrynowych NotchIC w celu ułatwienia funkcji NotchIC” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (7): 2400-10. doi : 10.1128/MCB.20.7.2400-2410.2000 . PMC 85419 . PMID 10713164 .
Kurooka H, Honjo T (czerwiec 2000). „Funkcjonalne oddziaływanie między regionem wewnątrzkomórkowym mysiego notch1 a acetylotransferazami histonowymi PCAF i GCN5” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 275 (22): 17211-20. doi : 10.1074/jbc.M000909200 . PMID 10747963 .
Beatus P, Lundkvist J, Oberg C, Pedersen K, Lendahl U (czerwiec 2001). „Pochodzenie regionu powtórzeń ankirynowych w domenach wewnątrzkomórkowych Notch ma kluczowe znaczenie dla regulacji aktywności promotora HES” . Mechanizmy rozwoju . 104 (1–2): 3–20. doi : 10.1016/S0925-4773(01)00373-2 . PMID 11404076 . S2CID 9526831 .
Zhou S, Hayward SD (wrzesień 2001). „Jądrowa lokalizacja CBF1 jest regulowana przez interakcje z kompleksem korepresora SMRT” . Biologia molekularna i komórkowa . 21 (18): 6222–32. doi : 10.1128/MCB.21.18.6222-6232.2001 . PMC 87339 . PMID 11509665 .

Zewnętrzne linki

RBPJ+białko,+człowiek w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .

Languages

In other projects

RBPJ - RBPJ

Zawartość

Interakcje

Bibliografia

Dalsza lektura

Zewnętrzne linki