Terrabakteria - Terrabacteria
| Terrabakteria | |
|---|---|
|
|
| Zdjęcie z mikroskopu elektronowego z promieniowiec promienicy ( Actinobacteria ) | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | |
| (bez rankingu): |
Terrabakteria
Battistuzzi i in., 2004, Battistuzzi i żywopłoty, 2009
|
| Phyla | |
| Synonimy | |
|
|
Terrabacteria jest taksonem zawierającym około dwie trzecie (6157 sp.) gatunków prokariotów , w tym gatunków Gram-dodatnich ( Actinobacteria i Firmicutes ) oraz typu Cyanobacteria , Chloroflexi i Deinococcus-Thermus .
Wywodzi swoją nazwę ( terra = "ziemia") od ewolucyjnych nacisków życia na lądzie. Terrabacteria posiadają ważne adaptacje, takie jak odporność na zagrożenia środowiskowe (np. wysuszenie, promieniowanie ultrafioletowe i wysokie zasolenie) oraz fotosyntezę tlenową . Również unikalne właściwości ściany komórkowej taksonów Gram-dodatnich, które prawdopodobnie wyewoluowały w odpowiedzi na warunki lądowe, przyczyniły się do patogenności u wielu gatunków. Wyniki te otwierają teraz możliwość, że adaptacje ziemskie mogły odegrać większą rolę w ewolucji prokariontów, niż jest to obecnie rozumiane.
Terrabacteria została zaproponowana w 2004 roku dla Actinobacteria, Cyanobacteria i Deinococccus-Thermus, a później została rozszerzona o Firmicutes i Chloroflexi. Inne analizy filogenetyczne potwierdziły bliskie związki tych typów. Większość gatunków prokariotów, które nie zostały umieszczone w Terrabacteria, zaliczono do taksonu Hydrobacteria (3203 sp.), w związku z wilgotnym środowiskiem wnioskowanym dla wspólnego przodka tych gatunków. Wywnioskowano, że Terrabacteria i Hydrobacteria rozdzieliły się około 3 miliardy lat temu, co sugeruje, że ziemia (kontynenty) była w tym czasie skolonizowana przez prokariota. Razem Terrabacteria i Hydrobacteria tworzą dużą grupę zawierającą 99% (9360 sp.) wszystkich Eubacteria znanych do 2009 roku i umieszczonych w taksonie Selabacteria, w nawiązaniu do ich zdolności fototroficznych ( selas = światło) (chociaż niektóre ostatnie analizy obaliły - Selabakterie znajdują się poza nim, czyniąc z niego całkowitą domenę bakteryjną).
Terrabacteria nie należy mylić z niedawno opisanym taksonem „ Glidobacteria ”, który obejmuje tylko niektórych członków Terrabacteria, ale wyklucza Firmicutes i Actinobacteria, i nie jest poparty danymi filogenetycznymi molekularnymi.
Filogeneza
Drzewo filogenetyczne według analiz filogenetycznych Battistuzziego (2009) jest następujące iz kalibracją zegara molekularnego .
Ostatnie analizy molekularne wykazały mniej więcej następujące zależności, w tym inne typy, których relacje były niepewne.
| Terrabakteria |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Z drugiej strony Coleman i wsp. (2020) nazwali klad złożony z Thermotogae , Deinococcus-Thermus , Synergistetes i spokrewniony jako DST, a ponadto analiza sugeruje, że ultramałe bakterie (grupa CPR) mogą należeć do Terrabacteria, które są bardziej spokrewnione z Chloroflexi . Według tego badania gromada Aquificae czasami zaliczana do Gracilicutes, a gromada Fusobacteria może należeć zarówno do Terrabacteria, jak i Gracilicutes. Wynik był następujący:
| Terrabakteria |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Możliwe, że Terrabacteria jest również kladem parafiletycznym według innych analiz filogenetycznych.