CUL3 - CUL3

CUL3
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	2MYL , 2MYM , 4AP2 , 4APF , 4EOZ , 4HXI
Identyfikatory
Skróty	CUL3 , CUL-3, PHA2E, kullina 3, NEDAUS
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 603136 MGI : 1347360 HomoloGene : 2661 Karty genetyczne : CUL3
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 2 (ludzki)
Kończyć się	224 585 397 pz
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 1 (mysz)
Kończyć się	80 340 480 bp
Wzór ekspresji RNA
	; ; ; ;
	Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• domena wiążąca POZ ; • aktywność homodimeryzację białka ; • 1904264 GO:: 1904822 GO: 0090622 GO: GO 0090302 ubikwityny proteiny ligazy aktywności ; • aktywność białkowa ubikwityny transferazy ; • GO: 0001948 białko wiążące ; • aktywność heterodimeryzacji białka ; • ubikwityny proteiny ligazy wiązania ; • wiązanie cyklinowe ; • Wiązanie typu Notch;
Komponent komórkowy	• cytoplazma ; • kompleks ligazy ubikwitynowej cullin-RING ; • cytozol ; • aparat Golgiego ; • membrana ; • kompleks ligazy ubikwitynowej Cul3-RING ; • nukleoplazma ; • mikrotubula polarna ; • egzosom zewnątrzkomórkowy ; • jądro ; • błona Golgiego ; • rzęska ; • kompleks ligazy ubikwitynowej SCF ; • rzęska ruchoma ; • wić plemnika ; • projekcja komórkowa;
Proces biologiczny	• rozszczepienie zarodka ; • regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • faza G1 ; • ujemna regulacja transdukcji sygnału białka Rho ; • poliubikwitynacja białek ; • w rozwoju płodowym ; • negatywna regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • szlak sygnałowy Wnt ; • monoubikwitynacja białek ; • zespół włókien stresowych ; • Kaskada MAPK ; • pozytywna regulacja cytokinezy ; • wewnętrzna ścieżka sygnalizacji apoptotycznej ; • retikulum endoplazmatyczne do transportu za pośrednictwem pęcherzyków aparatu Golgiego ; • pozytywna regulacja mitotycznej przemiany metafaza/anafaza ; • powłoka pęcherzyków COPII ; • proces apoptotyczny fibroblastów ; • organizacja projekcji komórek ; • gastrulacja ; • podział komórek macierzystych ; • ubikwitynacja białek ; • morfogeneza komórkowa ; • pozytywna regulacja proliferacji populacji komórek ; • mitotyczny cykl komórkowy GO:0007067 ; • szlak sygnalizacyjny, w którym pośredniczą integryny ; • mitotyczna metafaza rozwoju płytki ; • migracja komórek ; • ujemna regulacja kanonicznego szlaku sygnalizacyjnego Wnt ; • transport za pośrednictwem pęcherzyków ; • morp wątroby hogenesis ; • pośredniczą proteasomy ubikwityna-zależnego białka procesu katabolicznego ; • trophectodermal morfogenezy komórek ; • zależny od ubikwityny procesu katabolicznego białka ; • anafaza wspomagające kompleks zależnej Proces kataboliczne ; • białko jądra kontroli jakości przez system ubikwityna-proteasom ; • potranslacyjna modyfikacja białka ; • transportowej ; • Przejście G1/S mitotycznego cyklu komórkowego ; • Proces kataboliczny białek zależny od SCF zależny od proteasomów ubikwityny ; • pozytywna regulacja ubikwitynacji białek ; • destabilizacja białek;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	8452
	26554
	ENSG00000036257
	ENSMUSG00000004364
	Q13618
	Q9JLV5
	NM_001257197 ; NM_001257198 ; NM_003590
	NM_016716 ; NM_001313728
	NP_001244126 ; NP_001244127 ; NP_003581
	NP_001300657 ; NP_057925
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Cullin 3 to białko, które u ludzi jest kodowane przez gen CUL3 .

Białko Cullin 3 należy do rodziny kulin, która u ssaków zawiera osiem białek (Cullin 1, Cullin 2, Cullin 3, Cullin 4A, Cullin 4B, Cullin 5, Cullin 7 i Cullin 9). Białka Cullin są ewolucyjnie konserwowaną rodziną białek u drożdży, roślin i ssaków.

Funkcja białka

Cullin 3 jest składnikiem kompleksów ligaz ubikwitynowych (CRL) Cullin- RING E3, które biorą udział w ubikwitylacji białek i stanowią część układu ubikwityna–proteasom (UPS). Dodanie cząsteczek ubikwityny do reszty lizyny przez CRL następnie kieruje białko do degradacji proteasomalnej. Ligazy ubikwityny Cullin- RING E3 są zaangażowane w wiele procesów komórkowych odpowiedzialnych za regulację cyklu komórkowego, reakcję na stres, transport białek, transdukcję sygnału, replikację DNA, transkrypcję, kontrolę jakości białek, zegar dobowy i rozwój.

Delecja genu CUL3 u myszy powoduje śmiertelność embrionów.

Cullin 3-RING E3 ligazy ubikwityny

Kompleks Cullin 3-RING składa się z białka Cullin 3, białka RING-box 1 ( RBX1 ), które rekrutuje enzym sprzęgający ubikwitynę (E2) oraz białka Bric-a-brac/Tramtrack/Broad (BTB), rozpoznającego substrat podjednostka. Białko Cullin 3 jest białkiem szkieletowym koordynującym inne składniki kompleksu CRL. Kompleksy Cullin 3-RING mogą również dimeryzować poprzez swoje domeny BTB, co prowadzi do powstania dwóch receptorów substratowych i dwóch katalitycznych domen RING.

Aktywacja kompleksu jest regulowana przez przyłączanie ubikwitynopodobnego białka NEDD8 do konserwatywnej reszty Lys w domenie homologii kulliny, proces zwany neddylacją . Deneddylacja jest prowadzona przez ośmiopodjednostkowy kompleks CSN, który pośredniczy w rozszczepianiu wiązania izopeptydowego między NEDD8 a białkiem kulliny. Innym białkiem, które oddziałuje z kulliną, jest CAND1, które wiąże się z deneddylowaną formą białka kulliny i zakłóca interakcję między kulliną a innymi podjednostkami kompleksu, prowadząc do zahamowania aktywności ligazy ubikwityny E3. Dlatego dynamiczna neddylacja i dendylacja kulliny jest ważna dla regulacji aktywności kompleksu CRL.

Znaczenie kliniczne

Rodzinne nadciśnienie hiperkaliemiczne

Mutacje w genie CUL3 są związane z rodzinnym nadciśnieniem hiperkaliemicznym. Kompleks CRL zawierający Cullin 3 kontroluje aktywność kotransportera Na ⁺ Cl ⁻ (NCC) w nerkach poprzez regulację proteasomalnej degradacji kinaz bez lizyny [K] WNK1 i WNK4 . Wykazano, że mutacje w genie CUL3 prowadzą do akumulacji WNK. Obfitość tych kinaz prowadzi do zwiększonej fosforylacji NCC i jego aktywacji. W konsekwencji wzrasta reabsorpcja Na ^+, co prowadzi do wysokiego ciśnienia krwi.

Nowotwór

Deregulację poziomu ekspresji Cullin 3 zaobserwowano w ludzkich nowotworach. Wykazano, że Cullin 3 ulega nadekspresji w nowotworach inwazyjnych, a poziom ekspresji białka dodatnio koreluje ze stopniem zaawansowania nowotworu. W raku piersi nadekspresja białka Cullin 3 powoduje spadek poziomu białka Nrf2 . Białko to jest czynnikiem transkrypcyjnym regulującym ekspresję niektórych enzymów detoksykacyjnych i antyoksydacyjnych. Innym substratem kompleksu CRL jest kandydujące białko supresorowe nowotworu RhoBTB2 .

Interakcje

Wykazano, że CUL3 wchodzi w interakcje z:

Bibliografia

Dalsza lektura

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (kwiecień 1996). „Metoda „podwójnego adaptera” dla ulepszonej konstrukcji biblioteki strzelb”. Biochemia analityczna . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (kwiecień 1997). „Sekwencjonowanie cDNA konkatenacji na dużą skalę” . Badania genomu . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
Michel JJ, Xiong Y (czerwiec 1998). „Ludzki CUL-1, ale nie inni członkowie rodziny cullin, selektywnie oddziałuje z SKP1, tworząc kompleks z SKP2 i cykliną A”. Wzrost i różnicowanie komórek . 9 (6): 435–49. PMID 9663463 .
Du M, Sansores-Garcia L, Zu Z, Wu KK (wrzesień 1998). „Klonowanie i analiza ekspresji nowego genu tłumionego salicylanami, Hs-CUL-3, członka rodziny cullin/Cdc53” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 273 (38): 24289-92. doi : 10.1074/jbc.273.38.24289 . PMID 9733711 .
Ishikawa K, Nagase T, Suyama M, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (czerwiec 1998). „Przewidywanie sekwencji kodujących niezidentyfikowanych ludzkich genów. X. Kompletne sekwencje 100 nowych klonów cDNA z mózgu, które mogą kodować duże białka in vitro” . Badania DNA . 5 (3): 169-76. doi : 10.1093/dnares/5.3.169 . PMID 9734811 .
Ohta T, Michel JJ, Schottelius AJ, Xiong Y (kwiecień 1999). „ROC1, homolog APC11, reprezentuje rodzinę partnerów kulliny z powiązaną aktywnością ligazy ubikwityny”. Komórka molekularna . 3 (4): 535–41. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80482-7 . PMID 10230407 .
Piosenkarz JD, Gurian-West M, Clurman B, Roberts JM (wrzesień 1999). „Cullina-3 celuje w cyklinę E do ubikwitynacji i kontroluje fazę S w komórkach ssaków” . Geny i rozwój . 13 (18): 2375–87. doi : 10.1101/gad.13.18.2375 . PMC 317026 . PMID 10500095 .
Hori T, Osaka F, Chiba T, Miyamoto C, Okabayashi K, Shimbara N, Kato S, Tanaka K (listopad 1999). „Kowalencyjna modyfikacja wszystkich członków ludzkich białek z rodziny kullin przez NEDD8” . Onkogen . 18 (48): 6829-34. doi : 10.1038/sj.onc.1203093 . PMID 10597293 .
Maeda I, Ohta T, Koizumi H, Fukuda M (kwiecień 2001). „Ubikwitynacja in vitro cykliny D1 przez ROC1-CUL1 i ROC1-CUL3” . Listy FEBS . 494 (3): 181–5. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02343-2 . PMID 11311237 . S2CID 40693441 .
Lyapina S, Cope G, Szewczenko A, Serino G, Tsuge T, Zhou C, Wolf DA, Wei N, Szewczenko A, Deshaies RJ (maj 2001). „Promocja rozszczepiania koniugatu NEDD-CUL1 przez sygnałosom COP9”. Nauka . 292 (5520): 1382-5. Kod Bibcode : 2001Sci...292.1382L . doi : 10.1126/science.1059780 . PMID 11337588 . S2CID 14224920 .
Min KW, Hwang JW, Lee JS, Park Y, Tamura TA, Yoon JB (maj 2003). „TIP120A łączy się z kulinami i moduluje aktywność ligazy ubikwityny” . Czasopismo Chemii Biologicznej . 278 (18): 15905-10. doi : 10.1074/jbc.M213070200 . PMID 12609982 .
Kobayashi A, Kang MI, Okawa H, Ohtsuji M, Zenke Y, Chiba T, Igarashi K, Yamamoto M (sierpień 2004). „Czujnik stresu oksydacyjnego Keap1 działa jako adapter dla ligazy E3 opartej na Cul3 w celu regulacji proteasomalnej degradacji Nrf2” . Biologia molekularna i komórkowa . 24 (16): 7130-9. doi : 10.1128/MCB.24.16.7130-7139.2004 . PMC 479737 . PMID 15282312 .
Beausoleil SA, Jędrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (sierpień 2004). „Wielkoskalowa charakterystyka fosfoprotein jądrowych komórek HeLa” . Materiały Narodowej Akademii Nauk Stanów Zjednoczonych Ameryki . 101 (33): 12130-5. Kod Bib : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Grzebień MJ (styczeń 2005). „Profilowanie immunopowinowactwa fosforylacji tyrozyny w komórkach nowotworowych”. Biotechnologia przyrodnicza . 23 (1): 94-101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
Furukawa M, Xiong Y (styczeń 2005). „Białko BTB Keap1 celuje w antyoksydacyjny czynnik transkrypcyjny Nrf2 do ubikwitynacji przez ligazę Cullin 3-Roc1” . Biologia molekularna i komórkowa . 25 (1): 162–71. doi : 10.1128/MCB.25.1.162-171.2005 . PMC 538799 . PMID 15601839 .
Hernández-Muñoz I, Lund AH, van der Stoop P, Boutsma E, Muijrers I, Verhoeven E, Nusinow DA, Panning B, Marahrens Y, van Lohuizen M (maj 2005). „Stabilna inaktywacja chromosomu X obejmuje kompleks PRC1 Polycomb i wymaga histonu MACROH2A1 oraz ligazy ubikwityny E3 CULLIN3/SPOP” . Materiały Narodowej Akademii Nauk Stanów Zjednoczonych Ameryki . 102 (21): 7635-40. doi : 10.1073/pnas.0408918102 . PMC 1140410 . PMID 15897469 .
Lu L, Zhou ZM, Huang XY, Xu M, Yin LL, Wang H, Xu ZY, Sha JH (czerwiec 2005). „Identyfikacja i charakterystyka cul-3b, nowy wariant transkrypcyjny hominine CUL-3” . Azjatycki Dziennik Andrologii . 7 (2): 205–11. doi : 10.1111/j.1745-7262.2005.00024.x . PMID 15897978 .

Zewnętrzne linki

Lokalizacja ludzkiego genomu CUL3 i strona szczegółów genu CUL3 w przeglądarce genomu UCSC .

Languages

In other projects