IRF3 - IRF3

IRF3
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	3QU6 , 1J2F , 1QWT , 1T2K , 1ZOQ , 2O61 , 2O6G , 2PI0 , 3A77 , 5JEO , 5JEK , 5JER , 5JEM , 5JEL , 5JEJ
Identyfikatory
Skróty	IRF3 , entrez:3661, IIAE7, interferonowy czynnik regulacyjny 3
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 603734 MGI : 1859179 HomoloGene : 1208 Karty genowe : IRF3
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 19 (człowiek)
Kończyć się	49 665 875 pb
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 7 (mysz)
Kończyć się	45 002 848 pz
Wzór ekspresji RNA
	Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• Wiązanie DNA ; • Aktywność homodimeryzacji białek ; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 Aktywność czynnika transkrypcyjnego wiążącego DNA ; • GO:0001104 Aktywność koregulatora transkrypcji ; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA- aktywność wiązania represora transkrypcji RNA polimerazy II-specyficzne ; • GO: 0001948 białko wiążące ; • domena białka wiążącego ; • GO: 0000980 polimerazę RNA wiązania II cis-regulacyjnego region DNA sekwencji specyficznych ; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO:0001211, GO:0001205 Aktywność aktywatora transkrypcji wiążącego DNA, swoista dla polimerazy RNA II ; • wiązanie DNA swoiste dla sekwencji ; • wiązanie identyczne z białkami ; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 Aktywność czynnika transkrypcyjnego wiążącego DNA, polimeraza RNA II-specyficzne;
Składnik komórkowy	• cytoplazma ; • nukleoplazma ; • jądro ; • cytozol;
Proces biologiczny	• proces apoptotyczny ; • pozytywna regulacja szlaku sygnałowego, w którym pośredniczy interferon typu I ; • apoptotyczny proces makrofagów ; • regulacja transkrypcji, na podstawie DNA ; • odpowiedź na bakterię ; • odpowiedź na egzogenne dsRNA ; • pozytywna regulacja wytwarzania interferonu-alfa ; • ścieżka sygnalizacyjna MDA-5 ; • szlak sygnałowy, w którym pośredniczy interferon-gamma ; • proces układu odpornościowego ; • negatywna regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • transkrypcja przez polimerazę RNA II ; • odpowiedź komórkowa na dsRNA ; • transkrypcja, matryca DNA ; • odpowiedź komórkowa na bodziec uszkodzenia DNA ; • opłaty zależne od TRIF podobny szlak sygnalizacyjny receptora ; • odpowiedź na lipopolisacharyd ; • odpowiedź obronna na wirusa ; • szlak sygnalizacyjny interferonu typu I ; • pozytywna regulacja sygnalizacji kinazy I-kappaB/NF-kappaB ; • negatywna regulacja wytwarzania interferonu typu I ; • zaprogramowana martwicza śmierć komórek ; • wirus GO:0022415 proces ; • odpowiedź komórkowa na lipopolisacharyd ; • pozytywna regulacja produkcji interferonu typu I ; • lipop szlak sygnałowy za pośrednictwem oligosacharydów ; • pozytywna regulacja produkcji interferonu-beta ; • wrodzona odpowiedź immunologiczna ; • regulacja wytwarzania interferonu typu I ; • pozytywna regulacja transkrypcji przez polimerazę RNA II ; • negatywna regulacja odpowiedzi obronnej na wirusa przez gospodarza ; • regulacja ekspresji genów ; • regulacja odpowiedzi zapalnej ; • odpowiedź komórkowa na egzogenne dsRNA ; • pozytywna regulacja transkrypcji, na matrycy DNA;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	3661
	54131
	ENSG00000126456
	ENSMUSG000000003184
	Q14653
	P70671
NM_001197122 ; NM_001197123 ; NM_001197124 ; NM_001197125 ; NM_001197126;
	NM_001197127 ; NM_001197128 ; NM_001571
	NM_016849
NP_001184051 ; NP_001184052 ; NP_001184053 ; NP_001184054 ; NP_001184055;
	NP_001184056 ; NP_001184057 ; NP_001562 ; NP_001184053.1 ; NP_001184056.1 ; NP_001184057.1
	NP_058545
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Czynnik regulatorowy interferonu 3 , znany również jako IRF3 , jest czynnikiem regulatorowym interferonu .

Funkcjonować

IRF3 jest członkiem rodziny regulatorowych czynników transkrypcyjnych interferonu (IRF). IRF3 została pierwotnie odkryta jako homolog z IRF1 i IRF2 . IRF3 został dalej scharakteryzowany i wykazano, że zawiera kilka domen funkcjonalnych, w tym sygnał eksportu jądrowego, domenę wiążącą DNA , C-końcową domenę asocjacyjną IRF i kilka regulatorowych miejsc fosforylacji . IRF3 znajduje się w nieaktywnej postaci cytoplazmatycznej, która po fosforylacji seryny/treoniny tworzy kompleks z CREBBP . Kompleks przemieszcza się do jądra w celu aktywacji transkrypcji interferonów alfa i beta oraz dalszych genów indukowanych interferonem.

IRF3 odgrywa ważną rolę w odpowiedzi wrodzonego układu odpornościowego na infekcję wirusową . Stwierdzono, że zagregowane MAVS aktywują dimeryzację IRF3. Badanie z 2015 roku pokazuje, że fosforylacja wrodzonych białek adaptorowych MAVS, STING i TRIF w konserwatywnym motywie pLxIS rekrutuje i określa fosforylację i aktywację IRF3 przez kinazę białkową serynowo-treoninową TBK1, aktywując w ten sposób produkcję interferonów typu I. Inne badanie wykazało, że nokauty IRF3-/- chronią przed zawałem mięśnia sercowego. W tym samym badaniu zidentyfikowano odpowiedź IRF3 i IFN typu I jako potencjalny cel terapeutyczny w kardioprotekcji po zawale mięśnia sercowego .

Szlak sygnałowy receptorów Toll-podobnych. Szare linie przerywane reprezentują nieznane skojarzenia

Interakcje

Wykazano, że IRF3 oddziałuje z IRF7 .

Bibliografia

Dalsza lektura

Pitha PM, Au WC, Lowther W, Juang YT, Schafer SL, Burysek L, Hiscott J, Moore PA (1999). „Rola czynników regulatorowych interferonu (IRF) w sygnalizacji za pośrednictwem wirusa i regulacji wzrostu komórek”. Biochimie . 80 (8–9): 651–8. doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . PMID 9865487 .
Yoneyama M, Suhara W, Fujita T (2002). „Kontrola aktywacji IRF-3 przez fosforylację”. J. Interferon Cytokine Res . 22 (1): 73–6. doi : 10.1089/07999002753452674 . PMID 11846977 .
Au WC, Moore PA, Lowther W, Juang YT, Pitha PM (1996). „Identyfikacja członka rodziny czynników regulatorowych interferonu, który wiąże się z elementem odpowiedzi stymulowanej interferonem i aktywuje ekspresję genów indukowanych interferonem” . Proc. Natl. Acad. Nauka. Stany Zjednoczone . 92 (25): 11657-61. doi : 10.1073/pnas.92.25.11657 . PMC 40461 . PMID 8524823 .
Yoneyama M, Suhara W, Fukuhara Y, Fukuda M, Nishida E, Fujita T (1998). „Bezpośrednie wyzwalanie układu interferonowego typu I przez infekcję wirusową: aktywacja kompleksu czynnika transkrypcyjnego zawierającego IRF-3 i CBP/p300” . EMBO J . 17 (4): 1087–95. doi : 10.1093/emboj/17.4.1087 . PMC 1170457 . PMID 9463386 .
Tkacz BK, Kumar KP, Reich NC (1998). „Czynnik regulatorowy interferonu 3 i białko wiążące CREB/p300 są podjednostkami czynnika transkrypcji aktywowanego dwuniciowym RNA DRAF1” . Mol. Komórka. Biol . 18 (3): 1359–68. doi : 10.1128/MCB.18.3.1359 . PMC 108849 . PMID 9488451 .
Lin R, Heylbroeck C, Pitha PM, Hiscott J (1998). „Zależna od wirusa fosforylacja czynnika transkrypcji IRF-3 reguluje translokację jądrową, potencjał transaktywacji i degradację za pośrednictwem proteasomów” . Mol. Komórka. Biol . 18 (5): 2986–96. doi : 10.1128/MCB.18.5.2986 . PMC 110678 . PMID 9566918 .
Ronco LV, Karpova AY, Vidal M, Howley PM (1998). „Onkoproteina 16 E6 wirusa brodawczaka ludzkiego wiąże się z czynnikiem regulatorowym interferonu-3 i hamuje jego aktywność transkrypcyjną” . Geny Dev . 12 (13): 2061–72. doi : 10.1101/gad.12.13.2061 . PMC 316980 . PMID 9649509 .
Bellingham J, Gregory-Evans K, Gregory-Evans CY (1999). „Mapowanie ludzkiego czynnika regulatorowego interferonu 3 (IRF3) do chromosomu 19q13.3-13.4 za pomocą wewnątrzgenowego markera polimorficznego” . Roczniki Genetyki Człowieka . 62 (Pt 3): 231–4. doi : 10.1046/j.1469-1809.1998.6230231.x . PMID 9803267 . S2CID 46070705 .
Lowther WJ, Moore PA, Carter KC, Pitha PM (1999). „Klonowanie i analiza funkcjonalna ludzkiego promotora IRF-3”. Biol DNA komórki . 18 (9): 685–92. doi : 10.1089/104454999314962 . PMID 10492399 .
Kim T, Kim TY, Song YH, Min IM, Yim J, Kim TK (1999). „Aktywacja czynnika regulacyjnego interferonu 3 w odpowiedzi na czynniki uszkadzające DNA” . J. Biol. Chem . 274 (43): 30686-9. doi : 10.1074/jbc.274.43.30686 . PMID 10521456 .
Kumar KP, McBride KM, Weaver BK, Dingwall C, Reich NC (2000). „Regulowana lokalizacja jądrowo-cytoplazmatyczna czynnika regulacyjnego interferonu 3, podjednostka czynnika aktywowanego dwuniciowym RNA 1” . Mol. Komórka. Biol . 20 (11): 4159–68. doi : 10.1128/MCB.20.11.4159-4168.2000 . PMC 85785 . PMID 10805757 .
Suhara W, Yoneyama M, Iwamura T, Yoshimura S, Tamura K, Namiki H, Aimoto S, Fujita T (2000). „Analizy wywołanych wirusem homomerycznych i heteromerycznych asocjacji białek między IRF-3 i koaktywatorem CBP/p300”. J. Biochem . 128 (2): 301-7. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022753 . PMID 10920266 .
Sługa MJ, dziesięć Oever B, LePage C, Conti L, Gessani S, Julkunen I, Lin R, Hiscott J (2001). „Identyfikacja odrębnych szlaków sygnałowych prowadzących do fosforylacji czynnika regulacyjnego interferonu 3” . J. Biol. Chem . 276 (1): 355–63. doi : 10.1074/jbc.M007790200 . PMID 11035028 .
Smith EJ, Marié I, Prakash A, García-Sastre A, Levy DE (2001). „Fosforylacja IRF3 i IRF7 w komórkach zakażonych wirusem nie wymaga dwuniciowej zależnej od RNA kinazy białkowej R lub kinazy Ikappa B, ale jest blokowana przez białko E3L wirusa krowianki” . J. Biol. Chem . 276 (12): 8951-7. doi : 10.1074/jbc.M008717200 . PMID 11124948 .
Au WC, Yeow WS, Pitha PM (2001). „Analiza domen funkcjonalnych interferonu czynnika regulacyjnego 7 i jego związek z IRF-3” . Wirusologia . 280 (2): 273-82. doi : 10.1006/viro.2000.0782 . PMID 11162841 .
Barnes BJ, Moore PA, Pitha PM (2001). „Swoista dla wirusa aktywacja nowego czynnika regulacyjnego interferonu, IRF-5, powoduje indukcję różnych genów interferonu alfa” . J. Biol. Chem . 276 (26): 23382-90. doi : 10.1074/jbc.M101216200 . PMID 11303025 .
Mach CM, Hargrove BW, Kunkel GR (2002). „Białko aktywujące gen Small RNA, czynnik SphI pooktamerowy wiążący czynnik homologii/czynnik aktywujący transkrypcję genu tRNA selenocysteiny, stymuluje transkrypcję ludzkiego genu regulatorowego czynnika 3 interferonu” . J. Biol. Chem . 277 (7): 4853-8. doi : 10.1074/jbc.M108308200 . PMID 11724783 .
Morin P, Bragança J, Bandu MT, Lin R, Hiscott J, Doly J, Civas A (2002). „Preferencyjne miejsca wiązania dla czynników regulatorowych interferonu 3 i 7 zaangażowanych w transkrypcję genu interferonu-A”. J. Mol. Biol . 316 (5): 1009–22. doi : 10.1006/jmbi.2001.5401 . PMID 11884139 .
Dang O, Navarro L, Anderson K, David M (2004). „Przełomowa: śmiertelna toksyna wąglika hamuje aktywację czynnika regulującego IFN 3 przez lipopolisacharyd” . Czasopismo Immunologii . 172 (2): 747–51. doi : 10.4049/jimmunol.172.2.747 . PMID 14707042 .

Zewnętrzne linki

Interferon+Regulatory+Factor-3 w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)
FactorBook IRF3

Languages

In other projects