Kompleks dehydrogenazy bursztynianowej podjednostka C - Succinate dehydrogenase complex subunit C

SDHC
PDB 1zp0 EBI.png
Identyfikatory
Skróty SDHC , CYB560, CYBL, PGL3, QPS1, SDH3, podjednostka kompleksu dehydrogenazy bursztynianowej C
Identyfikatory zewnętrzne OMIM : 602413 MGI : 1913302 Homologen : 2256 Karty genowe : SDHC
Ortologi
Gatunki Człowiek Mysz
Entrez
Zespół
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_001035511
NM_001035512
NM_001035513
NM_001278172
NM_003001

NM_025321

RefSeq (białko)

NP_001030588
NP_001030589
NP_001030590
NP_001265101
NP_002992

NP_079597

Lokalizacja (UCSC) Chr 1: 161,31 – 161,36 Mb Kr 1: 171,13 – 171,15 Mb
Wyszukiwanie w PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Podjednostka C kompleksu dehydrogenazy bursztynianowej , znana również jako podjednostka cytochromu b560 dehydrogenazy bursztynianowej, mitochondrialna , jest białkiem, które u ludzi jest kodowane przez gen SDHC . Gen ten koduje jedną z czterech podjednostek kodowanych w jądrze, które obejmują dehydrogenazę bursztynianową , znaną również jako kompleks mitochondrialny II, kluczowy kompleks enzymatyczny cyklu kwasów trikarboksylowych i tlenowych łańcuchów oddechowych mitochondriów. Kodowane białko jest jednym z dwóch integralnych białek błonowych, które zakotwiczają inne podjednostki kompleksu, tworzące rdzeń katalityczny, do wewnętrznej błony mitochondrialnej . Istnieje kilka powiązanych pseudogenów dla tego genu na różnych chromosomach. Mutacje w tym genie powiązano z guzami chromochłonnymi i przyzwojakami . Opisano alternatywne warianty transkrypcyjne poddane splicingowi.

Struktura

Gen kodujący białko SDHC jest jądrowy, mimo że białko znajduje się w wewnętrznej błonie mitochondriów . Lokalizacja genu u ludzi znajduje się na pierwszym chromosomie w q21. Gen podzielono na 6 eksonów . Gen SDHC wytwarza białko o masie 18,6 kDa złożone ze 169 aminokwasów.

Białko SDHC jest jedną z dwóch podjednostek transbłonowych czteropodjednostkowego kompleksu białkowego dehydrogenazy bursztynianowej (Kompleks II), który znajduje się w wewnętrznej błonie mitochondrialnej . Drugą podjednostką transbłonową jest SDHD . Dimer SDHC/ SDHD jest połączony z podjednostką transportu elektronów SDHB, która z kolei jest połączona z podjednostką SDHA .

Funkcjonować

SuccDeh.svg

Białko SDHC jest jedną z czterech kodowanych w jądrze podjednostek zawierających dehydrogenazę bursztynianową , znaną również jako kompleks II łańcucha transportu elektronów , kluczowy kompleks enzymatyczny cyklu kwasu cytrynowego i tlenowych łańcuchów oddechowych mitochondriów. Kodowane białko jest jednym z dwóch integralnych białek błonowych, które zakotwiczają inne podjednostki kompleksu, tworzące rdzeń katalityczny, do wewnętrznej błony mitochondrialnej.

SDHC stanowi część dimeru białka transbłonowego z SDHD, który zakotwicza Kompleks II w wewnętrznej błonie mitochondrialnej. Dimer SDHC/ SDHD zapewnia miejsca wiązania ubichinonu i wody podczas transportu elektronów w Kompleksie II . Początkowo SDHA utlenia bursztynian poprzez deprotonowanie w FAD miejsca wiązania, tworzące FADH 2 pozostawiając fumaran , luźno związane z miejscem aktywnym, swobodnie opuścić białka. Elektrony pochodzące z tunelu bursztynianu wzdłuż przekaźnika [Fe-S] w podjednostce SDHB, aż osiągną klaster siarki żelaza [3Fe-4S] . Elektrony są następnie przenoszone do oczekującej cząsteczki ubichinonu w miejscu aktywnym puli Q w dimerze SDHC/ SDHD . Karbonylowy tlen O1 z ubichinonu jest zorientowany w miejscu aktywnym (rysunek 4) przez oddziaływania wiązaniami wodorowymi z Tyr83 SDHD . Obecność elektronów w klastrze siarki żelaza [3Fe-4S] indukuje ruch ubichinonu w drugą orientację. Ułatwia to drugą interakcję wiązania wodorowego między grupą karbonylową O4 ubichinonu i Ser27 w SDHC. Po pierwszym etapie redukcji pojedynczych elektronów powstaje rodnik semichinonowy . Drugi elektron przybywa z klastra [3Fe-4S], aby zapewnić pełną redukcję ubichinonu do ubichinolu .

Znaczenie kliniczne

Mutacje w tym genie powiązano z przyzwojakami . Stwierdzono, że ponad 30 mutacji w genie SDHC zwiększa ryzyko dziedzicznego przyzwojaka-guza chromochłonnego typu 3. Osoby z tym schorzeniem mają przyzwojaki, guzy chromochłonne lub oba. Odziedziczona mutacja genu SDHC predysponuje osobę do choroby, a mutacja somatyczna, która usuwa normalną kopię genu SDHC, jest potrzebna do wywołania dziedzicznego przyzwojaka-guza chromochłonnego typu 3. Większość odziedziczonych mutacji genu SDHC zmienia pojedyncze aminokwasy w SDHC sekwencji białkowej lub spowodować skrócenie białka. W rezultacie aktywność enzymu SDH jest niewielka lub nie ma jej wcale. Ponieważ zmutowany enzym SDH nie może przekształcić bursztynianu w fumaran , bursztynian gromadzi się w komórce. Nadmiar bursztynianu nieprawidłowo stabilizuje czynniki indukowane hipoksją (HIF), które również gromadzą się w komórkach. Nadmiar HIF stymuluje komórki do podziału i powoduje wytwarzanie naczyń krwionośnych, gdy nie są one potrzebne. Szybki i niekontrolowany podział komórek wraz z powstawaniem nowych naczyń krwionośnych może prowadzić do rozwoju nowotworów u osób z dziedzicznym przyzwojakiem-guzem chromochłonnym.

Interaktywna mapa ścieżek

Kliknij poniżej geny, białka i metabolity, aby połączyć się z odpowiednimi artykułami.

[[Plik:
TCACycle_WP78Go to article Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to WikiPathways Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
[[
]]
TCACycle_WP78Go to article Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to article Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to WikiPathways Go to HMDB Go to article Go to WikiPathways Go to article Go to HMDB Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article Go to article
|alt=TCACycle_WP78 edytuj ]]
Edycja TCACycle_WP78

Bibliografia

Dalsza lektura

Linki zewnętrzne

Ten artykuł zawiera tekst z Narodowej Biblioteki Medycznej Stanów Zjednoczonych , która jest własnością publiczną .