CTBP1 - CTBP1

CTBP1
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
	1MX3 , 4LCE , 4U6Q
Identyfikatory
Skróty	CTBP1 , C-końcowe białko wiążące 1, BARS, HADDTS
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 602618 MGI : 1201685 HomoloGene : 1015 Karty genowe : CTBP1
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.	Chromosom 4 (człowiek)
Kończyć się	1 249 953 bp
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.	Chromosom 5 (mysz)
Kończyć się	33 274 994 pz
Wzór ekspresji RNA
	; ; ; ;
	Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów
Funkcja molekularna	• aktywność oksydoreduktazy, działającej na grupę donorów CH-OH, NAD lub NADP jako akceptor ; • aktywność korepresora transkrypcji GO:0001106 ; • specyficzne wiązanie domeny białka ; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 wiązanie DNA aktywność czynnika transkrypcji ; • NAD wiązania ; • czynnika transkrypcji ; • wiązania białka C-koniec, ; • GO: białko wiążące 0001948 ; • aktywności oksydoreduktazy ; • wiązania identyczne białko ; • hydroxypyruvate aktywność reduktazy ; • glioksylanu reduktazy (NADP +) aktywność ; • aktywność homodimeryzacja białka;
Komponent komórkowy	• cytoplazma ; • transkrypcji regulator kompleks ; • kompleksu represora transkrypcji ; • nukleoplazmą ; • jądro ; • cytosolu ; • presynaptycznej strefie aktywnej składnik cytoplazmatyczny ; • glutaminergicznego synapsy ; • GABA-ergicznych synapsy;
Proces biologiczny	• pozytywna regulacja deacetylacji histonów ; • różnicowanie komórek ; • regulacja transkrypcji, na podstawie DNA ; • replikacja genomu wirusa ; • negatywna regulacja transkrypcji przez polimerazę II RNA ; • transkrypcja, na podstawie DNA ; • regulacja cyklu komórkowego ; • negatywna regulacja acetylacji histonów H4 ; • białko fosforylacja ; • różnicowanie białych komórek tłuszczowych ; • metabolizm ; • proces wirusowy GO:0022415 ; • negatywna regulacja transkrypcji, na podstawie DNA ; • negatywna regulacja acetylacji histonów ; • negatywna regulacja proliferacji populacji komórek ; • organizacja chromatyny zaangażowana w negatywną regulację transkrypcji ; • wyciszanie chromatyny;
	Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
	1487
	13016
	ENSG00000159692
	ENSMUSG00000037373
	Q13363
	O88712
NM_001012614 ; NM_001328 ; NM_001377186 ; NM_001377187 ; NM_001377188;
	NM_001377189 ; NM_001377190 ; NM_001377191 ; NM_001377192 ; NM_001377193
	NM_001198859 ; NM_001198860 ; NM_001198861 ; NM_013502 ; NM_001310535
NP_001012632 ; NP_001319 ; NP_001364115 ; NP_001364116 ; NP_001364117;
	NP_001364118 ; NP_001364119 ; NP_001364120 ; NP_001364121 ; NP_001364122
	NP_001185788 ; NP_001185789 ; NP_001185790 ; NP_001297464 ; NP_038530
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Białko wiążące C-końcowe 1, znane również jako CtBP1 jest białkiem, które u ludzi jest kodowane przez gen CTBP1 . CtBP1 jest jednym z dwóch białek CtBP, drugim białkiem jest CtBP2.

Funkcjonować

Białko CtBP1 zostało pierwotnie zidentyfikowane jako białko ludzkie, które wiąże motyw PLDLS na C-końcu białek adenowirusa E1A. Wykazano później, że to i pokrewne białko CTBP2 działają jako korepresory transkrypcyjne . To znaczy białka regulacyjne, które wiążą się z białkami wiążącymi DNA specyficznymi dla sekwencji i pomagają wyłączyć geny. CtBP robią to poprzez rekrutację enzymów modyfikujących histony, które dodają represyjne znaczniki histonowe i usuwają znaczniki aktywujące. Białka CtBP mogą również łączyć się ze sobą i prawdopodobnie łączyć kompleksy regulatorowe genów.

CtBP1 ulega szerokiej ekspresji od zarodka do osoby dorosłej, podczas gdy CtBP2 ma nieco bardziej ograniczony wzór ekspresji. CtBP pełnią wiele ról biologicznych i wydają się być najważniejsze w regulacji przejścia z nabłonka do mezenchymów, a także wpływaniu na metabolizm. Robią to drugie, wiążąc NADH w pierwszej kolejności z NAD+, wyczuwając w ten sposób stosunek NADH/NAD+ . Po związaniu ulega zmianie konformacyjnej, która pozwala mu dimeryzować i łączyć się z białkami partnerskimi oraz wyciszać określone geny.

Podczas rozwoju szkieletu i limfocytów T, CtBP1 i CtBP2 wiążą się z domeną PLDLSL δEF1, komórką białkiem homeodomeny palca cynkowego, a tym samym wzmagają wyciszanie transkrypcji indukowane przez δEF1. CtBP wiąże również rodzinę czynników Kruppel-podobnych białek palca cynkowego KLF3 , KLF8 i KLF12 . Ponadto CtBP tworzy kompleksy z CtIP, białkiem o masie 125 kDa, które rozpoznaje wyraźnie różne motywy białkowe od CtBP. CtIP wiąże się z powtórzeniami BRCT w obrębie genu raka piersi BRCA1 i umożliwia CtBP wpływanie na aktywność BRCA1. Obydwa białka mogą również oddziaływać z kompleksem białek z grupy policomb, który uczestniczy w regulacji ekspresji genów podczas rozwoju. Alternatywny splicing transkryptów z tego genu skutkuje wieloma wariantami transkryptu.

Białko oddziałujące z białkiem wiążącym C-terminal (CtIP) jest partnerem wiążącym z CtBP, które przyczyniają się do hamowania transkrypcji i regulacji cyklu komórkowego oraz odgrywają rolę w odpowiedzi komórkowej na uszkodzenie DNA .

Interakcje

Wykazano, że CTBP1 wchodzi w interakcje z:

ACTL6B ,
SPZ ,
EVI1
FOXP2 ,
HDAC1 ,
IKZF1 ,
IKZF4 ,
KLF3 ,
KLF8 ,
Mdm2 ,
MLL ,
NRIP1 ,
Pinin ,
RBBP8 i
TGIF1 .
GATA1 .

Bibliografia

Dalsza lektura

Chinnaduraj G (2002). „CtBP, niekonwencjonalny korepresor transkrypcyjny w rozwoju i onkogenezie” . Mol. Komórka . 9 (2): 213–24. doi : 10.1016/S1097-2765(02)00443-4 . PMID 11864595 .
Schaeper U, Boyd JM, Verma S i in. (1995). „Klonowanie molekularne i charakterystyka fosfoproteiny komórkowej, która oddziałuje z konserwatywną domeną C-końcową adenowirusa E1A zaangażowaną w ujemną modulację transformacji onkogennej” . Proc. Natl. Acad. Nauka. Stany Zjednoczone . 92 (23): 10467-71. Kod Bib : 1995PNAS...9210467S . doi : 10.1073/pnas.92.23.10467 . PMC 40632 . PMID 7479821 .
Boyd JM, Subramanian T, Schaeper U, et al. (1993). „Region w C-końcu białka E1a adenowirusa 2/5 jest wymagany do połączenia z komórkową fosfoproteiną i jest ważny dla negatywnej modulacji transformacji za pośrednictwem T24-ras, onkogenezy i przerzutów” . EMBO J . 12 (2): 469–78. doi : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb05679.x . PMC 413230 . PMID 8440238 .
Schaeper U, Subramanian T, Lim L, et al. (1998). „Oddziaływanie między białkiem komórkowym, które wiąże się z regionem C-końcowym adenowirusa E1A (CtBP) a nowym białkiem komórkowym, jest zakłócane przez E1A poprzez konserwowany motyw PLDLS” . J. Biol. Chem . 273 (15): 8549-52. doi : 10.1074/jbc.273.15.8549 . PMID 9535825 .
Sundqvist A, Sollerbrant K, Svensson C (1998). „Region C-końcowy adenowirusa E1A aktywuje transkrypcję poprzez celowanie w kompleks białko wiążące C-końcowo-deacetylaza histonowa” . FEBS Lett . 429 (2): 183–8. doi : 10.1016/S0014-5793(98)00588-2 . PMID 9650586 . S2CID 20660291 .
Fuks F, Milner J, Kouzarides T (1998). „BRCA2 wiąże się z aktywnością acetylotransferazy po związaniu z P/CAF” . Onkogen . 17 (19): 2531-4. doi : 10.1038/sj.onc.1202475 . PMID 9824164 .
Sewalt RG, Gunster MJ, van der Vlag J, et al. (1999). „Białko wiążące C-terminal jest represorem transkrypcyjnym, który oddziałuje z określoną klasą białek Polycomb kręgowców” . Mol. Komórka. Biol . 19 (1): 777–87. doi : 10.1128/MCB.19.1.777 . PMC 83934 . PMID 9858600 .
Li S, Chen PL, Subramanian T, et al. (1999). „Wiązanie CtIP z powtórzeniami BRCT BRCA1 biorącymi udział w regulacji transkrypcji p21 zostaje zakłócone po uszkodzeniu DNA” . J. Biol. Chem . 274 (16): 11334-8. doi : 10.1074/jbc.274.16.11334 . PMID 10196224 .
Postigo AA, Dziekan DC (1999). „ZEB hamuje transkrypcję poprzez interakcję z korepresorem CtBP” . Proc. Natl. Acad. Nauka. Stany Zjednoczone . 96 (12): 6683-8. Kod bib : 1999PNAS...96.6683P . doi : 10.1073/pnas.96.12.6683 . PMC 21975 . PMID 10359772 .
Criqui-Filipe P, Ducret C, Maira SM, Wasylyk B (1999). „Net, TCF z ujemnym przełączaniem Ras, zawiera drugą domenę hamowania, CID, która pośredniczy w represji poprzez interakcje z CtBP i deacetylację” . EMBO J . 18 (12): 3392-403. doi : 10.1093/emboj/18.12.3392 . PMC 1171419 . PMID 10369679 .
Holmes M, Turner J, Fox A, i in. (1999). „hFOG-2, nowe białko palca cynkowego, wiąże korepresor mCtBP2 i moduluje aktywację za pośrednictwem GATA” . J. Biol. Chem . 274 (33): 23491-8. doi : 10.1074/jbc.274.33.23491 . PMID 10438528 .
Furusawa T, Moribe H, Kondoh H, Higashi Y (2000). „Identyfikacja CtBP1 i CtBP2 jako korepresorów czynnika homeodomeny palca cynkowego δEF1” . Mol. Komórka. Biol . 19 (12): 8581–90. doi : 10.1128/mcb.19.12.8581 . PMC 84984 . PMID 10567582 .
Yu X, Baer R (2000). „Lokalizacja jądrowa i specyficzna dla cyklu komórkowego ekspresja CtIP, białka, które wiąże się z supresorem guza BRCA1” . J. Biol. Chem . 275 (24): 18541-9. doi : 10.1074/jbc.M909494199 . PMID 10764811 .
Koipally J, Georgopoulos K (2000). „Interakcje Ikarosa z CtBP ujawniają mechanizm represji, który jest niezależny od aktywności deacetylazy histonowej” . J. Biol. Chem . 275 (26): 19594-602. doi : 10.1074/jbc.M000254200 . PMID 10766745 .
Melhuish TA, Wotton D (2001). „Interakcja białka wiążącego koniec karboksylowy z korepresorem TGIF Smad jest zakłócona przez mutację holoprosencephaly w TGIF” . J. Biol. Chem . 275 (50): 39762-6. doi : 10.1074/jbc.C000416200 . PMID 10995736 .
Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN (2001). „Stowarzyszenie białka wiążącego koniec COOH (CtBP) i represora transkrypcji oddziałującego z MEF2 (MITR) przyczynia się do hamowania transkrypcji czynnika transkrypcyjnego MEF2” . J. Biol. Chem . 276 (1): 35-9. doi : 10.1074/jbc.M007364200 . PMID 11022042 .
Izutsu K, Kurokawa M, Imai Y, et al. (2001). „Korepresor CtBP oddziałuje z Evi-1, hamując sygnalizację transformującego czynnika wzrostu beta” . Krew . 97 (9): 2815-22. doi : 10.1182/krew.V97.9.2815 . PMID 11313276 .
Palmer S, Brouillet JP, Kilbey A i in. (2001). „W aktywnościach transformujących i represorowych Evi-1 pośredniczą białka korepresorowe CtBP” . J. Biol. Chem . 276 (28): 25834-40. doi : 10.1074/jbc.M102343200 . PMID 11328817 .
Schuierer M, Hilger-Eversheim K, Dobner T, et al. (2001). „Indukcja ekspresji AP-2alfa przez infekcję adenowirusową obejmuje inaktywację korepresora transkrypcji AP-2rep CtBP1” . J. Biol. Chem . 276 (30): 27944-9. doi : 10.1074/jbc.M100070200 . PMID 11373277 .

Zewnętrzne linki

Lokalizacja genomu ludzkiego CTBP1 i strona szczegółów genu CTBP1 w przeglądarce genomu UCSC .
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : Q13363 (białko wiążące C-terminal 1) w PDBe-KB .

Languages

In other projects