DLG4 - DLG4

DLG4
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów : PDBe RCSB Lista kodów identyfikacyjnych PDB 1KEF , 3I4W , 3K82 , 3ZRT
Identyfikatory
Skróty	DLG4 , PSD95, SAP-90, SAP90, Dlgh4, PSD-95, SAP90A, dysk duży homolog 4, dyski duże białko rusztowania MAGUK 4, MRD62
Identyfikatory zewnętrzne	OMIM : 602887 MGI : 1277959 HomoloGene : 1047 Karty genowe : DLG4
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Chromosom 17 (ludzki) Zespół muzyczny 17p13.1 Początek 7187 187 bp Kończyć się 7 219 841 pz
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Chromosom 11 (mysz) Zespół muzyczny 11|11 B3 Początek 70 016 942 pz Kończyć się 70 047 522 pz
Wzór ekspresji RNA Więcej danych o wyrażeniach referencyjnych
Ontologia genów Funkcja molekularna • p-1 adrenergiczny receptor • domenę PDZ wiązania • GO: 0032403 kompleksu wiążącego zawierającej białko • białko rusztowania wiązania • kinazy guanylanowej aktywność • wiązania receptora P2Y1 nukleotydów • wiązania receptora acetylocholiny • kinazy wiązania • wiązania białka C-koniec, • GO: 0001948 białko wiążące • jonotropowych receptorów glutaminianu wiązania • D1 wiązaniu receptora dopaminy • wiążącego fosfatazy białkowej • białka rodziny neuroligin wiązania • ligand bramkowane aktywności kanału jonowego Składnik komórkowy • cytoplazma • juxtaparanode region aksonów • endocytozy pęcherzyków błony • synaptycznych błon • postsynaptycznej membrany • projekcja komórek • membrana • GO: 0097483 GO: 0097481 postsynaptycznego gęstość • synaptycznych pęcherzyków • zewnętrzny element cytoplazmatycznej części osocza membrana • bramkowanych napięciem kanałów potasowych kompleks • korowej cytoszkieletu • osoczu membrana • dendrytycznych kręgosłupa • Synapsę • pobudzającym synapsy • móżdżku omszony włókna • Axon • komórek węzeł • dendrytów • podstawnoboczne osoczu membrana • retikulum endoplazmatyczne • neuronów kręgosłupa • AMPA receptor glutaminianowy kompleks • dendrytów cytoplazma • jonotropowych glutaminian kompleks receptora • koniec projekcji neuronów • obrzeża komórek • cytozol • postsynaptyczna błona gęstości • postsynapsa • połączenie nerwowo-mięśniowe • projekcja neuronów • synapsa glutaminergiczna Proces biologiczny • lokalizacja receptora w synapsie • regulacja zachowań pielęgnacyjnych • regulacja długoterminowej plastyczności synaptycznej neuronów • proces nerwowo-mięśniowy kontrolujący równowagę • negatywna regulacja internalizacji receptora • ustalenie lokalizacji białek • pozytywna regulacja stężenia cytozolowych jonów wapnia • uczenie się • rozwój układu nerwowego • Kaskada MAPK • zachowanie eksploracji lokomotorycznej • regulacja aktywności receptora NMDA • grupowanie receptorów AMPA glutaminianowych • dendrytyczna morfogeneza kręgosłupa • zachowanie wokalizacyjne • pozytywna regulacja transmisji synaptycznej • ustalenie lub utrzymanie biegunowości wierzchołkowej/podstawnej komórek nabłonka • pozytywna regulacja pobudzającego potencjału postsynaptycznego • społeczne zachowanie • synaptycznych pęcherzyków dojrzewania • lokalizacja białka do synapsy • transdukcji sygnału • proces metaboliczny GMP • PKB proces metaboliczny • chemiczny transmisja synaptyczna • transport przezbłonowy • odpowiedź komórkową, jon potasu • receptora klastrów • dodatni R regulacja aktywności białkowej kinazy tyrozynowej • składanie kompleksu zawierającego białko • adhezja komórka-komórka • pułapkowanie dyfuzji receptora postsynaptycznego neuroprzekaźnika • pozytywna regulacja arboryzacji projekcji neuronów • lokalizacja receptora neuroprzekaźnika w błonie specjalizacji postsynaptycznej Źródła: Amigo / QuickGO
Ortologi
Gatunek	Człowiek	Mysz
Entrez	1742	13385
Zespół	ENSG00000132535	ENSMUSG00000020886
UniProt	P78352 O14909	Q62108
RefSeq (mRNA)	NM_001128827 NM_001365 NM_001321074 NM_001321075 NM_001321076 NM_001321077 NM_001369566	NM_001109752 NM_007864 NM_001370671 NM_001370672 NM_001370674 NM_001370675
RefSeq (białko)	NP_001122299 NP_001308003 NP_001308004 NP_001308005 NP_001308006 NP_001356	NP_001103222 NP_031890
Lokalizacja (UCSC)	Chr 17: 7.19 – 7.22 Mb	Chr 11: 70.02 – 70.05 Mb
Wyszukiwanie w PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

PSD-95 (białko o gęstości postsynaptycznej 95), znany również jako SAP-90 (białko związane z synaps, 90) jest białkiem , które dla ludzi są kodowane przez DLG4 (płyty z dużą homologicznym 4) genu .

PSD-95 należy do rodziny kinaz guanylanowych związanych z błoną (MAGUK). Z PSD-93 jest rekrutowany do tych samych klastrów receptora NMDA i kanałów potasowych . Te dwa białka MAGUK mogą oddziaływać w miejscach postsynaptycznych, tworząc multimeryczne rusztowanie do grupowania receptorów, kanałów jonowych i powiązanych białek sygnałowych. PSD-95 jest najlepiej zbadanym członkiem rodziny białek MAGUK zawierających domenę PDZ . Podobnie jak wszystkie białka z rodziny MAGUK, jego podstawowa struktura obejmuje trzy domeny PDZ, domenę SH3 i domenę podobną do kinazy guanylanowej (GK) połączone nieuporządkowanymi regionami łącznikowymi. Znajduje się prawie wyłącznie w postsynaptycznej gęstości neuronów i bierze udział w zakotwiczeniu białek synaptycznych. Bezpośredniej i pośredniej partnerów wiązania należą neuroligin , receptory NMDA , receptory AMPA i kanałów potasowych . Odgrywa ważną rolę w plastyczności synaptycznej i stabilizacji zmian synaptycznych podczas długotrwałego wzmocnienia .

Nadrodzina MAGUK i domeny składowe

PSD-95 (kodowany przez DLG4) jest członkiem nadrodziny MAGUK i częścią podrodziny, która obejmuje również PSD-93 , SAP97 i SAP102 . MAGUK są definiowane przez włączenie do nich domen PDZ , SH3 i GUK , chociaż wiele z nich zawiera również regiony homologiczne z domenami CaMKII , WW i L27 . Posiadana przez nie domena GUK jest strukturalnie bardzo podobna do domeny kinaz guanylanowych , jednak wiadomo, że jest katalitycznie nieaktywna, ponieważ nie ma pętli P, która wiąże ATP . Uważa się, że MAGUK dokonały subfunkcjonalizacji domeny GUK do własnych celów, głównie w oparciu o jej zdolność do tworzenia interakcji białko-białko z białkami cytoszkieletu, maszynerią opartą na mikrotubulach/aktynie i cząsteczkami zaangażowanymi w transdukcję sygnału.

Domeny PDZ , które są zawarte w MAGUKs w różnej liczbie, są replikowane trzy razy w ciągu w PSD-95. Domeny PDZ to krótkie sekwencje wiążące peptydy powszechnie występujące na C-końcu oddziałujących białek. Trzy kopie w obrębie genu mają różnych partnerów wiążących, ze względu na podstawienia aminokwasów w białku PSD-95 i jego ligandach. Domena SH3 jest ponownie domeną interakcji białko-białko. Jego rodzina na ogół wiąże się z miejscami PXXP, ale w MAGUKach wiadomo, że wiąże się również z innymi miejscami. Jedną z najbardziej znanych cech jest to, że może tworzyć wewnątrzcząsteczkowe wiązanie z domeną GUK, tworząc tak zwany stan „zamknięty” GUK-SH3. Mechanizmy regulacyjne i funkcja nie są znane, ale przypuszcza się, że może obejmować region haczyka i region wiążący kalmodulinę zlokalizowany w innym miejscu genu.

Organizmy modelowe

W badaniu funkcji DLG4 wykorzystano organizmy modelowe. Nokaut myszy linia, zwana Dlg4 ^tm1Grnt została wygenerowana. Samce i samice poddano standaryzowanemu przesiewowi fenotypowemu w celu określenia skutków delecji. Przeprowadzono dwadzieścia pięć testów na zmutowanych myszach i zaobserwowano siedem znaczących nieprawidłowości. Homozygotyczne zmutowane zwierzęta miały zmniejszoną masę ciała, nietypową kalorymetrię pośrednią i dane DEXA oraz fenotyp skóry. Mężczyźni również mieli nieprawidłową chemię osocza, podczas gdy kobiety miały nieprawidłową hematologię (zmniejszona średnia liczba hemoglobiny w krwinkach ).

Interakcje

Wykazano, że PSD-95 wchodzi w interakcje z:

Zobacz też

• Gęstość postsynaptyczna

Bibliografia

Zewnętrzne linki

• Białko DLG4, ludzkie w Narodowej Bibliotece Medycznej USA Medical Subject Headings (MeSH)